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超好熱始原菌における"missing gene"の同定と機能検証

超嗜热古菌“缺失基因”的鉴定及功能验证

基本信息

批准号：
16681016
负责人：
福居俊昭
金额：
$ 18.64万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を進めた。昨年度までに引き続き、超好熱菌ではこれまで例のないトランスポゾンによるランダム変異法の確立を試みた。好酸好熱菌S.solfataricusのトランスポゾン転移株から単離したトランスポザーゼ(TPase)遺伝子、および近縁のP.furiosusの推定TPase遺伝子を種々のプロモーター領域の下流に配置したトランスポゾンベクターを新たに作製した。これらを用いてT.kodakaraensisトリプトファン要求性株におけるtrpEマーカ0の転移を試みたが、明確なトランスポゾンによる転移の確認はできなかった。今後はTPase遺伝子の発現の確認や、in vitroでの転移活性の確認を行い、最終的に超好熱菌におけるトランスポゾン変異の確立を目指す。一方、T.kodakaraensis有機酸代謝経路において"missing gene"であるスクシニル-CoAシンテターゼ(SCS)が、アセチル-CoAシンテターゼI(ACSI)およびACS IIのパラログであることを見出した。特にSCSとACS IIは共通のスモールサブユニットに異なるラージサブユニットが会合することにより異なる基質特異性と機能を実現していることを明らかにした。また通常は糖新生酵素であるホスホエノールピルビン酸シンターゼが超好熱菌の解糖系において必須であることを遺伝子破壊により証明した。

90℃ above the fertility of the super-hot bacteria, the fertility of the necessary organs, the composition of the genetic subgroup, the identification of a part of the same analysis, the identification of all "missing gene" and "missing gene". In this study, T.kodakaraensis was used to identify the identity and function of the missing gene in the 2.09 Mbp genome of the strain. Last year, we tried to establish a new method for improving the quality of products. A new method for the down-stream configuration of S.solfataricus, a strain of S.solfataricus, is proposed. This is the first time that T.kodakaraensis has been identified. In the future, the identification of Tase gene development, the identification of migration activity in vitro, and the establishment of ultra-high-temperature bacteria will be directed. A party, T.kodakaraensis organic acid metabolism pathway "missing gene"-CoA <$$>$>(SCS)-CoA <$$> I(ACSI) ACS II Special ACS II common ground The sugar production enzyme is usually used to produce sugar.