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黄色ブドウ球菌の莢膜合成関連蛋白質群の構造解析

金黄色葡萄球菌荚膜合成相关蛋白的结构分析

基本信息

批准号：
17770080
负责人：
田中良和
金额：
$ 2.3万
依托单位：
The University of Tokyo (2006)Hokkaido University (2005)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では,黄色ブドウ球菌由来の4種類の莢膜合成蛋白質,すなわち,CapE, CapF, CapG, CapLの結晶構造解析を目指したが,その中で,CapFの立体構造をSe-MAD法で2.6Åの分解能で決定することに成功した.明らかになった構造は,結晶学的に関連付けられた2量体構造であった.これはゲルろ過の結果とよく一致するものであるとともに,他の結晶系でも同様の2量体を形成していたことから,溶液中での本蛋白質の立体構造を反映するものと考えられる.単量体のCapFの構造は2つのドメイン(Nドメイン,Cドメイン)から構成されており,各ドメインの構造と類似した構造の蛋白質を検索したところ,NドメインはRm1D, CドメインはRm1Cという,いずれも莢膜を合成する蛋白質と類似していることが明らかになった.Rm1C, Rm1Dは一連の莢膜合成反応の中で,連続する2つの反応を触媒する酵素である.活性点について,CapFとRm1C, Rm1Dとを比較したところ,CapFにおいてもRm1C,Dと同様な基質結合ポケットが存在することが明らかになった.しかしながら,Rm1C, Rm1Dの触媒残基は保存されていなかったことから,同様な活性部位は有するが,そのメカニズムは異なると考えられる.さらに,His残基が3つ集中するHisクラスターが存在することが明らかになり,これらの残基の中心には金属イオンと思われる電子密度マップが確認された.蛋白質調製中には金属イオンは添加していないため,培地中の金属イオンを取り込んだものと推察される.今後,活性評価を行うことにより,これらの構造学的特徴が機能に及ぼす影響について考察する予定である.

In this study, the crystal structure analysis of CapE, CapF, CapG and CapL from four kinds of capsular synthetic proteins of P. flava was successfully determined by Se-MAD method. The structure of the crystal is related to the structure of the crystal. The results of this study are consistent with those of the previous study, and the results of this study are consistent with those of the previous study. CapF structure of unit volume (N, C, D, E, C, D, E, D, E, D, D, E, D, D, E, E, D, E, E, D, E, E 2. Anti-microbial activity Active point, CapF, Rm1C, Rm1D, and the like matrix binding exist. The catalyst residues of Rm1C and Rm1D are preserved, and the active sites of the same species are different. His residues are concentrated in the center, and the electron density is confirmed. In protein modulation, metal ions are added, and in culture, metal ions are extracted. In the future, activity evaluation will be carried out, and the structural characteristics, functions and influences will be investigated.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Structural and Mutational analyses of Drp35 from Staphylococcus aureus: a possible mechanism for its lactonase activity

金黄色葡萄球菌 Drp35 的结构和突变分析：其内酯酶活性的可能机制

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
J. Biol. Chem. 282
影响因子：
0
作者：
Morita;H.;Kuwahara;X.;Okushima;K.;Sasamoto;H.;Itoh;K.;Hattori;M.;Hayashi;X.;Takami;H;野村尚生;Yoshikazu Tanaka;八木寛陽;Yoshikazu Tanaka
通讯作者：
Yoshikazu Tanaka

Crystal structure of the hypothetical protein ST2072 from Sulfolobus tokodaii.

来自 Sulfolobus tokodaii 的假设蛋白质 ST2072 的晶体结构。