权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

Strain typing of Candida alhiranstargeting to repeat sequences in each chromosome

针对每条染色体中的重复序列的 Alhirans 念珠菌菌株分型

基本信息

批准号：
18590418
负责人：
KANBE Toshio
金额：
$ 2.45万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

Candida albicans is the most etiologic yeast species of candidiasis in both healthy and immunocompromized individuals. For surveillance and prevention of candidiasis, it is important to discriminate C. albicans at the strain level. PCRs targenting 25S rDNA and ALT repeat element have evaluated in this study. Furthermore, fragment analysis of microsatellite repeats was adapted to further genotype study of C. albicans at the strain level. One hundred-seventy nine clinical isolates were grouped into genotypes A(92 isolates), B(37 isolates)and C(50 isolates)on the basis of their 25S rDNA, and each was further classified into 5 types(types 3, 4,3/4,2/3/4 and 3/4/5)by PCR amplification targeting ALT repeats. Type 3 C. albicans constituted the majority of isolates in any genotypes(66.3% for genotype A, 78.3% for genotype B and 72.0% for genotype C).The fragment analysis of microsatellites using CDC3, HIS3, CAI and CAIII allowed to discriminate the strains, which showed the same electophoretic patterns in the PCRs using 25SINT, P-II and AS-I. Conversely, the PCRs using 25SINT, P-II and AS-I discriminated the strain that showed identical scores in the fragment analysis. These results indicate that a combination of three different systems is useful for genotyping of C. albicans at the strain level(DP=99.99). Furthermore, the fragment analysis using 117 strains of C. albicans isolated in Brazil, Japan and Thailand suggested the presence of genotypes specific for each country

白色念珠菌是健康和免疫功能低下个体中念珠菌病最致病的酵母菌种。为了监测和预防念珠菌病，在菌株水平上区分白色念珠菌非常重要。本研究评估了针对 25S rDNA 和 ALT 重复元件的 PCR。此外，微卫星重复片段分析适用于白色念珠菌在菌株水平上的进一步基因型研究。 179株临床分离株根据其25S rDNA分为基因型A（92株）、B（37株）和C（50株）基因型，并通过针对ALT重复序列的PCR扩增将每种基因型进一步分为5个类型（3型、4型、3/4型、2/3/4型和3/4/5型）。 3 型白色念珠菌在任何基因型中均占大多数分离株（基因型 A 为 66.3%，基因型 B 为 78.3%，基因型 C 为 72.0%）。使用 CDC3、HIS3、CAI 和 CAIII 进行的微卫星片段分析可以区分菌株，在使用 25SINT、P-II 和AS-I。相反，使用 25SINT、P-II 和 AS-I 的 PCR 可以区分在片段分析中显示相同分数的菌株。这些结果表明，三种不同系统的组合可用于菌株水平上白色念珠菌的基因分型（DP=99.99）。此外，使用在巴西、日本和泰国分离的 117 株白色念珠菌进行的片段分析表明存在每个国家特有的基因型