大腸菌O157におけるプロファージとプロファージ様エレメントの誘発と水平伝達

大肠杆菌 O157 中原噬菌体和原噬菌体样元件的诱导和水平转移

• 批准号: 06F06244
• 负责人: 林 哲也
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06F06244/
• 关键词: 大腸菌0157; プロファージ; 遺伝子水平伝達; DNAマイクロアレイ; Stxファージ; プロファージ間相互作用; リアルタイム定量PCR; 大腸菌O157; 水平伝達; 病原遺伝子; ゲノム

腸管出血性大腸菌O157Sakai株が保有する18種類のプロファージに関して、以下の解析を行った。1)大腸菌O157堺株が保有する18種類のプロファージのゲノム配列の詳細な再解析2)誘発可能なファージ検出のためのマイクロアレイ解析3)染色体から切り出されたファージゲノムのPCRによる検出4)リアルタイム定量PCRによる細胞内及びファージ粒子内に存在するファージゲノムDNAの定量5)染色体から切り出されてファージ粒子内にパッケージされると考えられたプロファージへのCp耐性遺伝子の挿入6)Cp耐性遺伝子を付加したプロファージの大腸菌K-12株への伝達能の解析以上の解析の結果、明らかな構造的欠陥を有する複数のプロファージが、ゲノムからの切り出し、複製、ファージ粒子内へのパッケージング能を有することが明らかとなった。さらに、少なくとも3種類のプロファージがK-12株に伝達されることも明らかになった。この予想外の結果は、細菌のゲノム上にしばしば存在するdefectiveなプロファージがただの残骸でなく、潜在的な水平伝達能力を持つことを初めて示したものである。同時に、この結果はゲノム上に複数存在するdefectiveなプロファージ間で、遺伝子産物のin transでの供給など、様々な相互作用があることを示すものである。さらに、これらの解析の中で、O157のStx1ファージであるSp15とStx2ファージであるSp5との間で、高頻度の組換えが生じ、新しいStx2ファージが生じることを明らかにし、その組換え部を特定した。また、大腸菌O157の病原性発現を制御すると予想される新規の調節遺伝子や、これまで報告されていない全く新しいタイプのファージの複製タンパク質と発現調節タンパク質を発見した。今後、さらに詳細な解析を行う必要があるが、いずれも重要な発見である。

The O157Sakai strain of hemorrhagic escherichia coli in the intestinal tube が retains する18 species <s:1> プロファ ジに ジに related て て, the following <s:1> analysis を lines った. 1) 堺 coliform O157 strains が retain す る 18 kinds の プ ロ フ ァ ー ジ の ゲ ノ ム match column の detailed な to 2) 発 may lure な フ ァ ー ジ 検 out の た め の マ イ ク ロ ア レ イ resolution 3) chromosome か ら り cutting out さ れ た フ ァ ー ジ ゲ ノ ム の PCR に よ る 検 out 4) リ ア ル タ イ ム quantitative PCR に よ る cells and び フ ァ ー ジ Particle に exist within す る フ ァ ー ジ ゲ ノ ム quantitative 5) chromosome DNA の か ら り cutting out さ れ て フ ァ ー ジ particles within に パ ッ ケ ー ジ さ れ る と exam え ら れ た プ ロ フ ァ ー ジ へ の Cp patience heritage 伝 son の scions into 6) Cp patience heritage 伝 son を plus し た プ ロ フ ァ ー ジ の coliform k-12 strains へ の 伝 danone の above の parse の results, Ming ら か な structure of owe 陥 を have す る plural の プ ロ フ ァ ー ジ が, ゲ ノ ム か ら の り し, copying, cutting フ ァ ー ジ particles within へ の パ ッ ケ ー ジ ン グ can have す を る こ と が Ming ら か と な っ た. さ ら に, less な く と も 3 kinds の プ ロ フ ァ ー ジ が k-12 strains に 伝 da さ れ る こ と も Ming ら か に な っ た. こ の to think outside の results は, bacteria の ゲ ノ ム on に し ば し ば exist す る defective な プ ロ フ ァ ー ジ が た だ の debris で な く, 伝 な level of potential を つ こ と を early め て in し た も の で あ る. に, at the same time こ の results は ゲ ノ ム に plural exist on す る defective な プ ロ フ ァ ー ジ で between, but the latter's 伝 の in trans で の supply な ど, others 々 な interaction が あ る こ と を shown す も の で あ る. さ ら に, こ れ ら の parsing の で, O157 の Stx1 フ ァ ー ジ で あ る Sp15 と Stx2 フ ァ ー ジ で あ る Sp5 と の で, high frequency between の group in え が じ, new し い Stx2 フ ァ ー ジ が raw じ る こ と を Ming ら か に し, そ の group in specific し え department を た. ま た, coliform O157 の pathogenicity 発 now を suppression す る と to think さ れ る new rules の adjust heritage 伝 や, こ れ ま で report さ れ て い な い く all new し い タ イ プ の フ ァ ー ジ の copy タ ン パ ク qualitative と 発 now adjust タ ン パ ク qualitative を 発 see し た. In the future, a detailed な analysis of the を line う is necessary があるが, and the important な of the さらに ずれ である will be seen at である.

项目成果

病原性大腸菌におけるRTXの保有状況および溶血毒素としての可能性

RTX 在致病性大肠杆菌中的可能性及其作为溶血毒素的潜力

• 发表时间: 2007
• 作者: 村瀬一典、;他
• 通讯作者: 他

A genome-wide survey on phage induction and propagation revealed defective prophages spread virulence determinants from Sakai prophage pool.

对噬菌体诱导和繁殖的全基因组调查显示，有缺陷的原噬菌体从酒井原噬菌体库中传播毒力决定因素。

• 发表时间: 2008
• 作者: Asadulghani;et. al.
• 通讯作者: et. al.

Evolutionary Biology of Bacterial and Fungal Pathogens

细菌和真菌病原体的进化生物学

• 发表时间: 2007
• 作者: Hayashi T.;et. al.
• 通讯作者: et. al.

大腸菌におけるO抗原をコードする領域の組換え過程

大肠杆菌中O抗原编码区的重组过程

• 发表时间: 2008
• 作者: 井口純;その;他
• 通讯作者: 他

大腸菌におけるO抗原合成遺伝子群を含む水平伝播領域の解析-O55からO157への入れ替わりとO55の伝播について.

大肠杆菌中包括O抗原合成基因组在内的水平传播区域的分析-关于从O55到O157的转换以及O55的传播。

• 发表时间: 2007
• 作者: 井口純、;他
• 通讯作者: 他