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成体内神経幹細胞におけるエピジェネティックス制御の解明

阐明成体神经干细胞的表观遗传调控

基本信息

批准号：
06J11532
负责人：
姫野絵美
金额：
$ 1.79万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2009
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06J11532/
关键词：
DNAメチル化エピジェネティックスエピジェネティクス

项目摘要

DNAのメチル化は哺乳類ゲノムに見られる唯一の化学修飾で、ヒストン修飾と共にクロマチン構造を制御するエピジェネティック機構の中心となる。体を構成するすべての細胞のゲノムにはDNAメチル化領域が存在する。各領域で細胞や組織の種類に特有のメチル化状態が形成され、これらが集合して各々の細胞や組織に固有のDNAメチル化プロファイルが構築される。細胞、組織間でDNAメチル化プロファイルを比較すると、メチル化状態が異なる領域が多数見出されることになり、こうした領域は、組織特異的DNAメチル化可変領域(Tissue-dependent and Differentially Methylated Regions,T-DMR)と定義される。本研究では、成体内神経幹細胞特異的なDNAメチル化状態を解析する基盤として、様々な組織、細胞のDNAメチル化プロファイルの解析を行った。まず、Real Time PCRを用いたDNAメチル化感受性定量的PCR法により、18種類のマウス組織、細胞間で221か所のNot I認識部位のメチル化率の定量と階層的クラスタリングを行った。さらに、当研究室で開発されたD-REAM(T-DMR profiling with restrictiontag-mediated amplification)法により、マウス肝臓、腎臓、成体脳、筋芽細胞、筋、ES細胞、胎生11.5日、14.5日の胎仔脳に由来するニューロスフィア間でDNAメチル化プロファイルを解析、比較した。申請者が神経幹細胞の増殖抑制能を明らかにしたPSP遺伝子に着目すると、本遺伝子プロモーター領域(転写開始点上流6kbから下流2.5kb)に複数のT-DMRが検出された。また、ES細胞に比べ、これらのT-DMRの中にはPSP遺伝子の発現が認められている肝臓、腎臓で共通した低メチル化領域が認められた。一方、ニューロスフィアでは、これらのT-DMRでは低メチル化傾向と高メチル化傾向を示す領域が共に検出され、他組織とは異なる特有のパターンが検出された。今後PSP遺伝子のみならず、ゲノムワイドなDNAメチル化プロファイルの比較から神経幹細胞に特異的な複数のT-DMRの検出し、成体内神経幹細胞におけるDNAメチル化状態の解析に応用できると考えられる。

DNA is responsible for the establishment and control of the chemical engineering of mammals. The center of the organization is responsible for the development of chemical and chemical engineering. The system is divided into several parts, such as the cell size, the DNA level, the existence of the domain. The organization in all fields has its own characteristics, such as the formation of the system, the collection of information, the integration of the DNA, the organization, the organization. The majority of users in the field of cell and inter-organization DNA authentication can define the definition of Tissue-dependent and Differentially Methylated Regions,T-DMR in the field of Tissue-dependent and Differentially Methylated Regions,T-DMR. The purpose of this study is to analyze the characteristics of DNA cells in adults, such as basic tissue analysis, tissue analysis, DNA tissue analysis, and so on. The quantitative analysis of DNA sensitivity by PCR method, 18-year-old tissue, and the quantitative analysis of the susceptibility rate of Not I in Not I were analyzed by using the method of quantitative analysis of susceptibility and sensitivity. The D-REAM (T-DMR profiling with restrictiontag-mediated amplification) method was used in the laboratory to analyze and compare the causes of fetal death, liver cancer, liver cancer, adult pregnancy, muscle bud cell, tendon, ES cell, fetal birth at 11.5 days and 14.5 days after birth. The applicant is aware that the PSP cell colonization inhibition can show that the target is focused on the target, and that the copy number is T-DMR in the field (upstream and downstream 2.5kb of the write starting point). The ES cell ratio, the PSP cell ratio, the cell ratio, the cell ratio, On the one hand, you need to know that you are in the market, and that you are in a position to show that you are in the field of information. On the other hand, you have to pay attention to the situation in the field of information, and the other organization is responsible for your own performance. In the future, the PSP will have to compare the complex T-DMR of the special cell of the god, the cell of the adult, the DNA of the cell, the analysis of the status, and the analysis of the status.