新規シアル酸含有糖ペプチドの抽出法の確立
新規シアル酸含有糖ペプチドの抽出法の確立
批准号:
18710178
负责人:
黒河内 政樹
金额:
$2.24万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
中文摘要
本年度は、シアル酸含有糖ペプチドの調整並びに混合物の試料を用いてシアル酸糖ペプチドの解析を行った。1)単一糖タンパク質(AFP, Firinogen, EPO)由来のシアル酸含有糖ペプチドの効率的捕捉と切断(遊離)。糖タンパク質のトリプシン消化物を1mM過ヨウ素酸ナトリウム溶液を用いて氷冷下で15分間酸化した。次に、反応液をポリアクリル酸型のアミノオキシ担持樹脂を用いて、シアル酸含有糖ペプチドのみを選択的に単離収集した。捕捉した糖ペプチドは、3%TFA溶液を用いてシアル酸部位で切断を行い、糖ペプチドを回収し、MALDI TOF-MSによる解析を行った。3)血清中のシアル酸含有糖ペプチドの選択的捕捉と切断(遊離)。マウス疾患モデルマウスの血清試料のトリプシン消化物を1mM過ヨウ素酸ナトリウム溶液を用いて氷冷下で15分間酸化した。次に、反応液をポリアクリル酸型のアミノオキシ担持樹脂を用いて、シアル酸含有糖ペプチドのみを選択的に単離し回収した。捕捉した糖ペプチドは、3% TFA溶液を用いてシアル酸部位で切断を行い、糖ペプチドを回収し、MALDI TOF-MSによる解析を行った。本プロジェクトにおいて得られた成果は、Angew. Chem. Int. Ed (2007)に発表させて頂きました。本法は、非還元末端にシアル酸を有する複合糖質の網羅的なエンリッチが可能であり、かつペプチドおよび糖鎖の配列を同時かつ大規模に取得可能な唯一の方法論であることから、グライコプロテオミクスにおける基盤技術になることが期待される。
英文摘要
本年度は、シアル酸含有糖ペプチドの調整並びに混合物の試料を用いてシアル酸糖ペプチドの解析を行った。1)単一糖タンパク質(AFP, Firinogen, EPO)由来のシアル酸含有糖ペプチドの効率的捕捉と切断(遊離)。糖タンパク質のトリプシン消化物を1mM過ヨウ素酸ナトリウム溶液を用いて氷冷下で15分間酸化した。次に、反応液をポリアクリル酸型のアミノオキシ担持樹脂を用いて、シアル酸含有糖ペプチドのみを選択的に単離収集した。捕捉した糖ペプチドは、3%TFA溶液を用いてシアル酸部位で切断を行い、糖ペプチドを回収し、MALDI TOF-MSによる解析を行った。3)血清中のシアル酸含有糖ペプチドの選択的捕捉と切断(遊離)。マウス疾患モデルマウスの血清試料のトリプシン消化物を1mM過ヨウ素酸ナトリウム溶液を用いて氷冷下で15分間酸化した。次に、反応液をポリアクリル酸型のアミノオキシ担持樹脂を用いて、シアル酸含有糖ペプチドのみを選択的に単離し回収した。捕捉した糖ペプチドは、3% TFA溶液を用いてシアル酸部位で切断を行い、糖ペプチドを回収し、MALDI TOF-MSによる解析を行った。本プロジェクトにおいて得られた成果は、Angew. Chem. Int. Ed (2007)に発表させて頂きました。本法は、非還元末端にシアル酸を有する複合糖質の網羅的なエンリッチが可能であり、かつペプチドおよび糖鎖の配列を同時かつ大規模に取得可能な唯一の方法論であることから、グライコプロテオミクスにおける基盤技術になることが期待される。
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Construction and structural characterization of versatile lactosaminoglycan-related compound library for the synthesis of complex glycopeptides and phingoglycolipids
用于合成复杂糖肽和鞘糖脂的多功能乳糖胺聚糖相关化合物库的构建和结构表征
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
The Journal of Organic Chemistry 71
影响因子:
--
作者:
[阿部貴志, 池村淑道, 木ノ内誠, 中村由紀子, 前野聖, 金谷重彦, 栗田 奈津子, Fujimura T., Miura Y., Matsuhashi T., Furukawa J-I., Kurogochi M., Itoh N., Kitatsuji C., Shimaoka H., Shimawaki K., Matsushita Takahiko, Hato Megumi, Naruchi Kentarou]
通讯作者:
Naruchi Kentarou
DOI:
10.1002/anie.200702919
发表时间:
2007-01-01
期刊:
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
影响因子:
16.6
作者:
[Kurogochi, Masaki, Amano, Maho, Nishimura, Shin-ichiro]
通讯作者:
Nishimura, Shin-ichiro
A comprehensive approach to structural and functional glycomics based on chemoselective glycoblotting and sequential tag conversion
基于化学选择性糖印迹和顺序标签转换的结构和功能糖组学综合方法
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Anal. Chem. 4
影响因子:
--
作者:
[Furukawa, J-i.]
通讯作者:
J-i.
Unusual N-glycan structures in a-mannosidase II/IIx double null embryos, identified by a systematic glycomic approach based on 2D-LC mapping and MDSF method in MALDI-TOF/TOF mass spectrometry
α-甘露糖苷酶 II/IIx 双无效胚胎中异常的 N-聚糖结构,通过基于 2D-LC 作图和 MALDI-TOF/TOF 质谱中 MDSF 方法的系统糖组学方法进行鉴定
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Molecular & Cellular Proteomics 5
影响因子:
--
作者:
[阿部貴志, 池村淑道, 木ノ内誠, 中村由紀子, 前野聖, 金谷重彦, 栗田 奈津子, Fujimura T., Miura Y., Matsuhashi T., Furukawa J-I., Kurogochi M., Itoh N., Kitatsuji C., Shimaoka H., Shimawaki K., Matsushita Takahiko, Hato Megumi]
通讯作者:
Hato Megumi
DOI:
10.1002/chem.200601613
发表时间:
2007-02
期刊:
Chemistry
影响因子:
--
作者:
[Hideyuki Shimaoka;Hiromitsu Kuramoto;J. Furukawa;Y. Miura;Masaki Kurogochi;Y. Kita;H. Hinou;Y. Shinohara;S. Nishimura]
通讯作者:
Hideyuki Shimaoka;Hiromitsu Kuramoto;J. Furukawa;Y. Miura;Masaki Kurogochi;Y. Kita;H. Hinou;Y. Shinohara;S. Nishimura
共 12 条
Development of glycoproteomics using O-glycoprotease
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批准号:23K04954
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2023
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负责人:黒河内 政樹
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依托单位:
海外基金