Study on the mechanism of the ribonucleoprotein complex

核糖核蛋白复合物的作用机制研究

• 批准号: 19380060
• 负责人: KIMURA Makoto
• 金额: $ 12.81万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19380060/
• 关键词: リボヌクレアーゼP; tRNA; RNAプロセシング; リボザイム; 結晶構造; リボ核タンパク質; 前駆体tRNA; タンパク質結晶構造; 超好熱古細菌; 酵素利用学; RNAシャペロン; リボ核ダンパク質

Ribonuclease P (RNase P) is composed of a catalytic RNA (PhopRNA) and five proteins (PhoPop5, PhoRpp21, PhoRpp29, PhoRpp30, PhoRpp38). In this study, we determined the crystal structure of the protein complex composed of PhoRpp21 and PhoRpp29. Furthermore, we examined the protein binding sites on PhopRNA by biochemical methods and analyzed the activated structure of RNase P RNA (PhopRNA) in Pyrococcus horikoshii OT3 was characterized by circular dichroism (CD) and ultraviolet (UV) absorbance spectra.

核糖核酸酶 P (RNase P) 由催化 RNA (PhopRNA) 和五种蛋白质 (PhoPop5、PhoRpp21、PhoRpp29、PhoRpp30、PhoRpp38) 组成。在本研究中，我们确定了由 PhoRpp21 和 PhoRpp29 组成的蛋白质复合物的晶体结构。此外，我们通过生化方法检查了 PhopRNA 上的蛋白质结合位点，并通过圆二色性 (CD) 和紫外 (UV) 吸收光谱分析了 Pyrococcus horikoshii OT3 中 RNase P RNA (PhopRNA) 的激活结构。

项目成果

Structural basis for the broad range substrate specificity of a novel mouse cytosolic sulfotransferase-mSULT1D1

新型小鼠胞质磺基转移酶 mSULT1D1 广泛底物特异性的结构基础

• 发表时间: 2009
• 期刊: Biochem Biophys Res Commun 379(1)
• 作者: Teramoto T;Sakakibara Y;Liu MC;Suiko M;Kimura M;Kakuta Y
• 通讯作者: Kakuta Y

The action of rice branching enzyme I (BEI) on starch. Biosci.

水稻分支酶 I (BEI) 对淀粉的作用。

• 发表时间: 2009
• 期刊: Biotechnol. Biochem. 73
• 作者: T. Akasaka;N.T. Vu;K. Chaen;A. Nishi;H. Satoh;H. Ida;T. Omori;M. Kimura
• 通讯作者: M. Kimura

Crystal structure and functional analysis of an archaeal chromatin Alba from hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3.

来自超嗜热古菌 Pyrococcus horikoshii OT3 的古菌染色质 Alba 的晶体结构和功能分析。

• 发表时间: 2008
• 期刊: Biosci. Biotechnol. Biochem. 72
• 作者: K. Hada;T. Nakashima;T. Osawa;H. Shimada;Y. Kakuta;M. Kimura
• 通讯作者: M. Kimura

Archaeal homologs of human RNase P protein pairs Pop5 with Rpp30 and Rpp21 with Rpp29 word on distinct functional domains of the RNA subunit.

人类 RNase P 蛋白的古细菌同源物在 RNA 亚基的不同功能域上将 Pop5 与 Rpp30 配对，将 Rpp21 与 Rpp29 配对。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Biosci.Biotechnol.Biochem.
• 作者: Honda;et al.
• 通讯作者: et al.

Identification of nucleotide residues essential for RNase P activity from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3.

从超嗜热古菌堀越火球菌 OT3 中鉴定对 RNase P 活性至关重要的核苷酸残基。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Biosci. Biotechnol. Biochem. 71
• 作者: A. Terada;T. Honda;M. Kimura
• 通讯作者: M. Kimura