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Virus Ecology in the Floodwater of Rice Fields

稻田洪水中的病毒生态

基本信息

批准号：
18380051
负责人：
KIMURA Makoto
金额：
$ 10.98万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究においては、水田表面水中のウイルスの生態解明を目的とし、1)水田表面水中には細菌数の平均8倍程度多数のウイルスが存在すること、細菌数とウイルス数の間に正の相関がみとめられた。2)表面水から分離した18株の細菌を供試し、これらに感染するバクテリオ数の季節変動と肥料の種類の影響を調査した結果、表面水中のファージ群集は、系統的に広い範囲の細菌に感染するファージから構成されていることが示唆された。3)表面水中に生息する細菌へのウイルスの感染状況を、透過型電子顕微鏡による細菌細胞の観察から推定した結果、平均で2~3%の細菌細胞中にファージの存在が観察され、水田表面水中のファージ群集が細菌群集の死滅を引き起こすとともに、細菌群集の遷移に大きく影響していることを推察した。また、4)藍藻ファージに特異的なプライマーを用いて同ファージの群集構造を評価した結果、水田にはこれまで知られていなかった未知の藍藻ファージの存在が推定された。

The purpose of this study is to clarify the ecological situation of paddy field surface water. 1) The average number of bacteria in paddy field surface water is 8 times that of the average number of bacteria in paddy field. 2)18 strains of bacteria isolated from surface water were tested, and seasonal variations in the number of infections and the effects of fertilizer types were investigated. The results showed that the number of strains of bacteria isolated from surface water was significantly higher than that of control. 3)The infection status of bacteria living in surface water, the detection of bacterial cells by transmission electron microscopy, the detection of the presence of bacteria in an average of 2 - 3% of bacterial cells, the detection of the death of bacterial clusters in surface water of paddy fields, and the large impact of migration of bacterial clusters 4) The existence of cyanobacteria in paddy field is presumed.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Seasonal variations in abundances of virus-like particles and bacteria in the flood water of a Japanese paddy field

日本稻田洪水中病毒样颗粒和细菌丰度的季节性变化

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Soil Science and Plant Nutrition 53
影响因子：
0
作者：
Traut W;Sahara K;Marec F;Natsuko Nakayama
通讯作者：
Natsuko Nakayama

サイズ分布から見た水田表面水中ウイルスの多様性

从大小分布看稻田地表水中病毒的多样性

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
加藤太一;伊藤小百合;大竹憲邦;末吉邦;大山卓爾;中山奈津子
通讯作者：
中山奈津子

Comparison of g23 gene sequence diversity between Novosphingobium and Sphingomonas phages and phage communities in the floodwater of a Japanese paddy field

DOI：
10.1016/j.soilbio.2008.06.008
发表时间：
2009-02
期刊：
Soil Biology & Biochemistry
影响因子：
9.7
作者：
N. Nakayama;S. Asakawa;M. Kimura
通讯作者：
N. Nakayama;S. Asakawa;M. Kimura

Morphology, host range and phylogenetic diversity of Sphingomonas phaees in the floodwater of a Japanese paddy field.

日本稻田洪水中鞘氨醇单胞菌的形态、寄主范围和系统发育多样性。

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
Soil Science and Plant Nutrition 55
影响因子：
0
作者：
Sayuri ITO;Taichi KATO;Norikuni OHTAKE;Kuni SUEYOSHI and Takuji OHYAMA;Y. Kuga;Natsuko Nakayama
通讯作者：
Natsuko Nakayama

水田表面水中のSphingomonas sp.に感染する溶菌性ファージの遺伝子解析

稻田地表水中鞘氨醇单胞菌感染的裂解噬菌体的遗传分析。