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Insertion polymorphysm of retrotransposons and diversity of theplant genome

Insertion polymorphysm of retrotransposons and diversity of theplant genome
逆转录转座子插入多态性与植物基因组多样性
批准号：
19570002
负责人：
OHTSUBO Hisako
金额：
$2.91万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2007 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19570002/
关键词：
トランスポゾン多型ゲノム多様化ゲノム構築進化

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1. シロイヌナズナ第3染色体ペリセントロメア末端のヘテロクロマチン領域について、塩基配列の微細構造解析からLys-tRNA 合成酵素遺伝子の「重複」がまず起きたこと、「重複」したそのiso-遺伝子の分岐年代の推定から、重複がアラビドプシスゲノムの大規模再編成と同時期(50-75MYA)に起きたこと、倍加したiso-遺伝子の偽遺伝子化の年代計算から、iso-遺伝子は偽遺伝子化した後、レトロトランスポゾン、トランスポゾンの度重なる挿入によってヘテロクロマチン化したと考えられる。2. イネのレトロトランスポゾン、RIRE7は低メチル化状態で発現が上昇するレトロトランスポゾンで、イネ染色体セントロメア領域に局在する。インド型と日本型イネ系統間で多型をしめすRIRE7-TU1について、RIRE7の両LTR 上と隣接領域のメチル化パターンを解析、RIRE7挿入の有無によって対応領域のメチル化のパターンの変化を明らかにした。
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会议论文
シロイヌナズナLys-tRNA synthetase 遺伝子の倍加と偽遺伝子化およびヘテロクロマチン化
拟南芥 Lys-tRNA 合成酶基因加倍、假基因化和异染色质化
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [西村啓士郎, 土本 卓, 大坪栄一, 大坪久子, 太田邦史ら, 久保田渉誠・大原雅, 田上和美, 大坪久子,田村浩一郎,大坪栄一]
通讯作者： 大坪久子,田村浩一郎,大坪栄一
MEGA4による分子系統解析
使用 MEGA4 进行分子系统发育分析
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Araki, K. & Ohara, M, 田村浩一郎]
通讯作者： 田村浩一郎
"SINE Code" is an excellenttool for identification of Oryza species
“SINE Code”是识别稻种的绝佳工具
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [H. Ohtsubo, S. Tsuchimoto, C. Cheng, J.Xu, M.Y. Kondo, N. Kurata, T. Miyabayashi,E. Ohtsubo]
通讯作者： T. Miyabayashi,E. Ohtsubo
シロイヌナズナLys-tRNA合成酵素遺伝子の倍加、偽遺伝子化、ヘテロクロマチン化
拟南芥 Lys-tRNA 合成酶基因的加倍、假基因化和异染色质化
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Sasanuma H., Murakami H., Fukuda T., Shibata T., Nicolas A., and Ohta K, 増田健太, 大坪久子 他]
通讯作者： 大坪久子 他
共 18 条
    Studies on the Arabidopsis LINE, ATLNs : Their expression and the function of ORF proteins encoded.
    • 批准号：
      15570003
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.37万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      OHTSUBO Hisako
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Studied on gypsy-type retrotransposons in plant ; their stuructural diversity and their choromosomal localization
    • 批准号：
      12640596
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.24万
    • 财政年份：
      2000
    • 负责人：
      OHTSUBO Hisako
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Studies of the novel retrotransposable elements appeared on rice chromosomes
    Studies on transposition and dispersion of tandem repeat sequences (TrsA) in rice genome
    • 批准号：
      06640795
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $1.34万
    • 财政年份：
      1994
    • 负责人：
      OHTSUBO Hisako
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    国内基金
    海外基金
    多型网络架构中异常网络行为研究
    • 批准号：
      2025JJ50350
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2025
    • 负责人：
      汤澹
    • 依托单位：
      湖南大学
    超多型值点非计时类轨迹生成机构综合方法及红壤深松机构创成
    • 批准号：
      32372005
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      50万元
    • 批准年份：
      2023
    • 负责人：
      张雷
    • 依托单位：
      浙江理工大学
    单细胞测序解析蚂蚁多型工蚁社会分工的神经机制及演化模式
    随机矩阵乘积与随机环境中多型分枝过程
    • 批准号：
      12271062
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      45万元
    • 批准年份：
      2022
    • 负责人：
      李应求
    • 依托单位：
      长沙理工大学