Rapid detection of hyper virulent strains of Clostridium difficile and application to direct detection from stool specimens

艰难梭菌高毒力菌株的快速检测及其在粪便标本直接检测中的应用

• 批准号: 19590578
• 负责人: KATO Haru
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19590578/
• 关键词: 臨床検査医学; 院内感染; 細菌; 診断検査; 遺伝子

A typing system for Clostridium difficile by sequencing the surface layer protein A gene (slpA) was evaluated, and clinical isolates in Japan were analyzed by this method. slpA sequence typing was found to have reliable typability and discriminatory power, and the typing results were highly reproducible and comparable. slpA sequence typing could be applied to direct typing successfully. The emerging strain, PCR ribotype 027 was recovered from one of the 160 specimens tested. Based on the sequence data of slpA, loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method detecting slpA of PCR ribotype 027 (slpAgc8) was established. The LAMP assay detecting slpAgc8 appears to be a valuable tool for the rapid identification of this type.

通过对表面层蛋白A基因（slpA）进行测序，对艰难梭菌的分型系统进行了评价，并通过该方法对日本的临床分离株进行了分析。slpA序列分型具有可靠的分型能力和区分能力，分型结果具有高度的可重复性和可比性。slpA序列分型可成功地用于直接分型。新出现的菌株，PCR核糖体型027是从160个测试标本之一回收的。根据slpA基因序列，建立了PCR核糖体027型（slpAgc8）slpA基因的环介导等温扩增（LAMP）检测方法。检测slpAgc8的LAMP测定似乎是用于快速鉴定这种类型的有价值的工具。

项目成果

長期入院がん患児におけるClostridium difficile消化管保有と院内伝播に関する検討.

长期住院癌症患者艰难梭菌胃肠道携带及院内传播研究。

• 发表时间: 2008
• 期刊: 感染症学雑誌 82
• 作者: 村端真由美;加藤はる;矢野久子;小椋正道;柴山順子;脇本幸夫;荒川宜親;溝上雅史.
• 通讯作者: 溝上雅史.

日本の医療機関での binary toxin 遺伝子陽性 Clostridium difficile 臨床分離株について

关于日本医疗机构二元毒素基因阳性艰难梭菌临床分离株

• 发表时间: 2009
• 作者: 加藤はる;荒川宜親;赤羽貴行;里村秀行;酒井力;中村敦;加藤秀章;岩島康仁;伊藤陽一郎;横山敏之
• 通讯作者: 横山敏之

Typing system for Clostridium difficile by sequencing the slpA gene and its application to direct typing from stool specimens.

通过对 slpA 基因进行测序的艰难梭菌分型系统及其在粪便标本直接分型中的应用。

• 发表时间: 2007
• 作者: Haru Kato;et al.
• 通讯作者: et al.

Clostridium difficile感染症について.

关于艰难梭菌感染。

• 发表时间: 2009
• 期刊: 日本病院薬剤師会雑誌 45
• 作者: Song Y;Muramatsu M;et. al.;加藤はる
• 通讯作者: 加藤はる

Clostridium difficile 感染症―変化する疫学と日本における現状―

艰难梭菌传染病 - 日本流行病学的变化和现状 -

• 发表时间: 2010
• 作者: Nagatsuma K;Hyashi Y;Matsuura T;et al.;中西豊文;加藤はる
• 通讯作者: 加藤はる