NMRを用いたフェレドキシン―キノン還元酵素の機能解明
NMRを用いたフェレドキシン―キノン還元酵素の機能解明
批准号:
19890049
负责人:
上田 卓見
金额:
$1.97万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
中文摘要
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英文摘要
安定同位体標識を施したフェレドキシン(Fd)を、大腸菌BL21(DE3)-CodonPlus-RPを用いて大量発現させ、Sepharose 6B、 Resource PHE、 Hiload Superdex 75カラムを用いて、SDS-PAGEにて単一バンドとなるまで精製した。Fdの[2Fe-2S]クラスターは不対電子を持つため、その近傍のNMRシグナルは観測されない。そこで、その影響を見積もるため、Fdの主鎖に由来するNMRシグナルの連鎖帰属を行った。その結果、[2Fe-2S]クラスターの5Å以内に存在するY37-A48およびT76-A79のアミノ酸に対応するシグナルは観測されなかった。次に、Fd上の光化学系Iとの特異的相互作用残基を同定するために、Fdと可溶化した光化学系Iを混合し、TCS実験を行った。さらに、FQRとの相互作用を検出するために、光化学系IおよびFQRのFd結合界面が外側を向いた、right side-outベシクルを用いたTCS実験も行った。両TCS実験の結果を比較すると、K52近傍、D66近傍、V82近傍およびE30-I33は両方のTCS実験においてシグナル強度減少が観測されているのに対し、K4およびD84はベシクルとのTCS実験のみでシグナル強度減少が観測された。このことから、K52近傍、V82近傍、D66近傍およびE30-I33は、PSIとの結合界面上に存在し、K4およびD84はFQRとの結合界面に存在すると結論した。近年、低分子量チラコイド膜タンパク質PGR5がFQRの活性に必須であることが示された。しかし、PGR5がFdと直接相互作用しているか否かは明らかではない。PGR5変異株から調製したチラコイド膜ベシクルを用いたTCS実験における、K4およびD84の強度減少を調べることにより、この点を明らかにしたいと考えている。
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会议论文
相互作用に基づく光合成循環的電子伝達の機構解明
基于相互作用的光合循环电子转移机制
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Matsuura I, Endo M, Hata K, Kubo T, Yamaguchi A, Saeki N, Yamashita T, 野本 直子]
通讯作者:
野本 直子
GPCRの活性化状態が薬物の親和性を規定するメカニズムの解明
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批准号:23K27309
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.65万
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财政年份:2024
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负责人:上田 卓見
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依托单位:
溶液NMR法による効率的な特殊ペプチドの動的立体構造解析法の開発
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批准号:23K18177
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2023
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负责人:上田 卓見
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依托单位:
GPCRの活性化状態が薬物の親和性を規定するメカニズムの解明
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批准号:23H02618
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.98万
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财政年份:2023
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负责人:上田 卓見
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依托单位:
海外基金