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豚レンサ球菌と近縁菌種の比較ゲノム解析による病原因子の探索

通过猪链球菌和相关细菌物种的比较基因组分析寻找致病因素

基本信息

批准号：
18J40081
负责人：
黒木(石田) 香澄
金额：
$ 2.58万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-04-25 至 2022-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18J40081/
关键词：
豚レンサ球菌比較ゲノム解析ヒアルロニダーゼ Streptococcus suis

项目摘要

Streptococcus suisは人獣共通感染症を引き起こすが、莢膜以外に病原因子として確定しているものはない。また、分類再検討が行われる以前までは S. suis とされていた Streptococcus ruminantium は牛の心内膜炎などから分離されるが、同じくS. suisから再分類されたStreptococcus parasuisは病豚からの検出例は少ない。そこで、S. suis と病原性や毒力が異なると推測される近縁菌種と比較解析を行い S. suis の新規病原因子探索を試みた。令和２年度は、これまで報告されていなかった S. parasuisの全ゲノム配列を明らかにし、データベース上に公開されている S. suis と S. ruminantium の全ゲノム配列を合わせて比較ゲノム解析を実施した。 3菌種が保有する遺伝子として8,103種類の遺伝子がみつかり、そのうち740種類は3菌種全株に共通して保存されていた。S. suisとS. ruminantiumにはアスコルビン酸代謝経路に関与する遺伝子があるのに対して、S. parasuis には保存されていなかった。一方で、ヒスチジンやトリプトファンなどのアミノ酸合成遺伝子は、S. parasuis に保存されていたが、S. suis と S. ruminantiumには保存されていなかった。また、毒力が強いS. suis 株と S. ruiminantium 2株には宿主のグリコサミノグリカンを分解するヒアルロニダーゼとヘパリナーゼを含む遺伝子群が保存されていたが、S. parasuisには保存されていなかった。これらの解析結果から、S. suis とS. ruminantiumは宿主で生存するように適応進化し、S. parasuisは環境中でも生存できるよう適応進化したことが示唆された。

The common infection of Streptococcus suis causes the pathogens out of the membrane and out of the membrane. In the past, there were fewer cases of Streptococcus parasuis disease in cattle with endocarditis caused by endocarditis in Streptococcus ruminantium cattle than in the previous group, and in the same group as in S. suis group. There were fewer cases of Streptococcus parasuis disease. The pathogenic virulence tests of S. suis and S. suis were carried out to explore the causes of the disease. In the annual report of the year and the second year of the parasuis, there is a list of public information on the full report of S. parasuis, which is open to the public, that is, S. suis, S. ruminantium, which is in line with the analysis and implementation of the project. The three strains of bacteria are common to the three strains of bacteria, such as the 8103 and the third species of bacteria, which are common to the whole population. S. suis

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

豚肉フードチェーン内の網羅的な細菌汚染状況調査とStreptococcus suisの汚染指標細菌としての有用性の検証

全面调查猪肉食物链内的细菌污染并验证猪链球菌作为污染指示菌的有效性

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
Dozaki S;Suzuki E;Tohya M;Watanabe T;Kuroki K;Sekizaki T;堂崎真一，遠矢真理，渡辺孝康，鈴木詠律子，黒木香澄，関崎　勉;黒木香澄，仁田義弘，門屋亨介，関崎　勉
通讯作者：
黒木香澄，仁田義弘，門屋亨介，関崎　勉

16S rRNA gene amplicon sequence data from feces of wild deer (Cervus nippon) in Japan

日本野鹿（Cervus nippon）粪便中的 16S rRNA 基因扩增子序列数据

DOI：
10.1128/mra.00346-20
发表时间：
2020
期刊：
Microbiol Resour Announc
影响因子：
0
作者：
Ishida-Kuroki K;Takeshita N;Nitta Y;Chuma T;Maeda K;Shimoda H;Takano A;Sekizaki T
通讯作者：
Sekizaki T

新たな汚染指標細菌候補であるStreptococcus suisの豚肉フードチェーン内汚染状況調査

新候选污染指示菌猪链球菌对猪肉食物链污染状况的调查

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Meekhanon N;Kaewmongkol S;Jirawattanapong P;Kaminsonsakul T;Kongsoi S;Chumsing S;Okura M;Ueno Y;Sekizaki T;Takamatsu D;Pan Yaqi，黒木香澄，野本竜平，遠矢真理，仁田義弘，関崎　勉;関崎　勉;黒木香澄，仁田義弘，門屋亨介，関崎　勉
通讯作者：
黒木香澄，仁田義弘，門屋亨介，関崎　勉

鶏肉のカンピロバクター汚染に関連する市販鶏肉表面の細菌叢についての調査

与鸡肉弯曲杆菌污染相关的市售鸡肉表面细菌菌群调查

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
吾郷良輔;竹下奈知子;黒木香澄;門屋亨介;関崎勉
通讯作者：
関崎勉

豚肉フードチェーン内の細菌叢解析による新たな汚染指標細菌Streptococcus suisの有用性の検証

通过猪肉食物链中的细菌菌群分析验证新型污染指示菌猪链球菌的有效性

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
Dozaki S;Suzuki E;Tohya M;Watanabe T;Kuroki K;Sekizaki T;堂崎真一，遠矢真理，渡辺孝康，鈴木詠律子，黒木香澄，関崎　勉;黒木香澄，仁田義弘，門屋亨介，関崎　勉;堂崎真一，遠矢真理，渡辺孝康，鈴木詠律子，黒木香澄，関崎　勉;黒木香澄，仁田義弘，門屋亮介，関崎　勉
通讯作者：
黒木香澄，仁田義弘，門屋亮介，関崎　勉