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比較ゲノム解析によるタイレリア原虫病原性進化の解明

通过比较基因组分析阐明泰勒虫寄生虫致病性的进化

基本信息

批准号：
21248035
负责人：
杉本千尋
金额：
$ 24.63万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2012
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21248035/
关键词：
ゲノム原虫タイレリヤアビコンプレックス進化タイレリア

项目摘要

Theileria parvaのゲノムリシークエンス解析、SNP解析を実施した。まず、東アフリカでの分離株とザンビア国内の分離株の遺伝子型別をSNP情報に基づき実施したところ、両グループ間での遺伝的差異が大きく、大陸内の家畜の移動による地理的隔離が本原虫種の遺伝的多様性に大きく影響していることが判明した。さらに、アフリカ水牛由来のタイレリア2株のゲノムResequenceを行い、牛由来株との比較を行ったところ、両者の遺伝的距離が大きく、組み換えが起きたと考えられる可能性は極めて限られており、おそらく東部アフリカで水牛から牛に感染したと考察された。また、2株のクローン原虫(Muguga, Marikebuni)を、牛での混合感染により実験的に掛け合わせて得られた19クローンのゲノムResequenceを行い、高頻度で組み換えが起きており、さらに、ゲノムの組み換えが起きた部位を特定することができた。一方、ワクチン候補蛋白質の選定を行うためにSNP情報に基づく変異解析を実施した。すなわち、非同義置換/同義置換の比(dN/dS)を計算し、正の選択を受けている(dN/dS>1.0)と考えられる遺伝子を選び出すことができた。これらは、ウシもしくはダニの体内での生体防御系の監視にされられ、正の選択を受けていると考えられ、これらの中には組換えワクチン候補として有用な分子が含まれていると考えられることから、今後これらの候補について詳細な機能・構造解析が必要である。Theileria orientalis (Ikeda, Chitose株)のテロメア付近で見いだされたVeil関連遺伝子について、赤血球内での発育ステージでの役割を解析するため、その構造・機能解析を開始した。

Theileria parva analysis, SNP analysis and application. The number of isolates of domestic isolates is different from that of domestic isolates. According to the situation of SNP, there are significant differences in the movement of livestock, geographical isolation of protozoa, and isolation of protozoa species in China. This is the most important reason for the identification of parasites. The origin of the buffalo, the buffalo, the buffalo The mice were co-infected with Muguga, 2 strains of protozoa (Marikebuni), and the animals that were co-infected with the cow were infected with the virus. The mice were divided into two groups: one was infected with the other two strains, the other two strains were co-infected with the protozoa, the two strains were co-infected with each other, and the mice were co-infected with each other. The mice were co-infected with two strains of protozoa, and the animals were co-infected with each other. On the other hand, the candidate protein is selected to perform the SNP information analysis and application. For example, the calculation of the ratio of non-synonymous settings