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カチオン－π相互作用によるタンパク質の構造形成・機能発現制御

通过阳离子-π相互作用控制蛋白质结构形成和功能表达

基本信息

批准号：
23390008
负责人：
竹内英夫
金额：
$ 12.23万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

カチオン-π相互作用はタンパク質の構造や機能を制御する可能性があり、注目を浴びつつある。本研究では、各種分光法を駆使することにより、芳香族アミノ酸残基が関与するカチオン-π相互作用について、１）相互作用の存在を検証するためのスペクトルマーカーの探索・発見、２）相互作用に起因するタンパク質構造変化の追跡法の開発、ならびに、３）これら新規マーカー、追跡法のタンパク質構造解析への応用を行い、カチオン-π相互作用がタンパク質の構造形成と機能発現において果たす役割を解析するための分光学的基盤を構築することを目的とした。前年度に引き続き、HIV-1ウイルスのVprタンパク質のC末端側へリックス部分を含む29アミノ酸残基からなるペプチドVpr52-80（DTWTGVEALIRILQQLLFIHFRIGCRHSR）とその変異体を用いて、His-Trp間のカチオン-π相互作用を吸収、蛍光、円偏光二色性で検出することを試みた。その結果、酸性条件下でHisが正電荷を獲得すると、Trpとの間にカチオン-π相互作用が生じ、Trpの紫外吸収に特有の変化をもたらすこと、また、Trpの蛍光を有意に消光させることが分った。Hisが正電荷を獲得することに同期して円偏光二色性にもわずかであるが変化が観測され、へリックスの長さが増すことが分った。さらに、これらのスペクトルの温度依存性を詳細に検討したところ、カチオン-π相互作用は、Vprペプチドのへリックス二量体構造を安定化することが明らかとなった。カチオン-π相互作用によるタンパク質構造の変化と機能の制御は、別のタンパク質であるヒトガレクチン-1でも確認された。本研究により、カチオン-π相互作用がタンパク質の構造形成と機能発現において重要な役割を果たすことが示された。

The possibility of the interaction between the structure and the function of the object is discussed. This study is aimed at exploring and discovering the relationship between aromatic acid residues and π-interaction by various spectroscopic methods, 1) proving the existence of interaction, 2) developing the tracing method for qualitative structure transformation, 3) analyzing the application of the tracing method for qualitative structure transformation, The structure formation and function development of the crystal structure due to the interaction between the crystal structure and the crystal structure In the previous year, the Vpr gene of HIV-1 was selected from Vpr52-80 (DTWTGVEALIRQLLFIHFRIGCRHSR), which contains 29 amino acid residues in the C-terminal part of HIV-1 gene, and the absorption, fluorescence and polarization dichroism of His-Trp interaction. As a result, under acidic conditions, the positive charge of Trp is obtained, and the interaction between Trp and π is generated. The ultraviolet absorption of Trp is characterized by the intentional extinction of Trp. His positive charge is obtained by the polarization dichroic method, and the polarization dichroic method is obtained by the polarization dichroic method. The temperature dependence of the particles is discussed in detail. The interaction between the particles and the two-dimensional structure is stabilized. The structure and function of the system are controlled by the interaction between the two systems. This study demonstrates the importance of the interaction between structure formation and function development.