ロタウイルスの遺伝学的多様性と種間伝播に関する研究

轮状病毒遗传多样性及种间传播研究

• 批准号: 08F08463
• 负责人: 小林 宣道
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Sapporo Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08F08463/
• 关键词: ロタウイルス; 種間伝播; 動物; 遺伝子再集合; 系統

本研究の目的は、ヒト由来のA群ロタウイルスで非定型的性状を有するもの、および動物ロタウイルスについて遺伝子解析を行い、動物とヒトの間におけるロタウイルスの感染・伝播の様態を明らかにすることである。今年度は次の3つの研究成果を得た。(1)昨年度から解析を行っていたウシ由来B群ロタウイルスについて、9種類の遺伝子分節のクローニングと遺伝子配列の決定を行なった。系統解析の結果、ウシB群ロタウイルスはヒト、マウス、ヒツジのB群ロタウイルスとは異なる系統に属し、B群では動物間の伝播は稀であることが示唆された。(2)ヒトロタウイルスの世界的な新興型として認識されるG12型ウイルスの由来について探るため、動物で唯一G12型が検出されているブタのG12型A群ロタウイルスRU172株について、その全遺伝子配列を決定し解析した。その結果、一部の遺伝子分節はあるヒトロタウイルス株に非常に近いものの、他の遺伝子分節はブタロタウイルスの配列と高い一致率を示した。この知見から、ブタおよびヒトのG12型ロタウイルスは、ブタとヒトのロタウイルスの遺伝子再集合体であった可能性、またはブタとヒトのG12ロタウイルスが同じ共通の祖先ウイルスに由来し、別個に分子進化したことが示唆された。(3)ヤギA群ロタウイルスについて初めて全遺伝子配列を決定し(G034株)、既知のヒト・動物ロタウイルスと系統解析を行った。その結果、ヤギロタウイルスの一部の遺伝子分節はG6, G8, G12などの非定型的ロタウイルスの遺伝子分節と高い一致率を示した。このことからヒトの非定型的ロタウイルスの形成にヤギロタウイルスの伝播、遺伝子再集合が関与したことが示唆された。

は の purpose, this study ヒ ト origin の group A ロ タ ウ イ ル ス で of atypical traits are す を る も の, お よ び animal ロ タ ウ イ ル ス に つ い て heritage 伝 line analytical を い, animal と ヒ ト の between に お け る ロ タ ウ イ ル ス の infection, 伝 sowing の others state を Ming ら か に す る こ と で あ る. This year, the research results of を times を 3 を を are た. Line (1) yesterday annual か ら parsing を っ て い た ウ シ origin B group ロ タ ウ イ ル ス に つ い て, 9 kinds の heritage 伝 sub section の ク ロ ー ニ ン グ と heritage 伝 with sequence の decided to line を な っ た. System analytical の results, ウ シ B group ロ タ ウ イ ル ス は ヒ ト, マ ウ ス, ヒ ツ ジ の B group ロ タ ウ イ ル ス と は different な る system に し, B group で は between animals の 伝 sowing は dilute で あ る こ と が in stopping さ れ た. (2) ヒ ト ロ タ ウ イ ル ス の world な new type と し て know さ れ る type A G12 ウ イ ル ス の origin に つ い て agent る た め type, animals, only A G12 で が 検 out さ れ て い る ブ タ の type A G12 group A ロ タ ウ イ ル ス RU172 strains に つ い て, そ の full heritage 伝 with sequence を decision analytical し し た. そ の results, a の but 伝 segmental は あ る ヒ ト ロ タ ウ イ ル ス strains に very nearly い に も の の, he の but 伝 segmental は ブ タ ロ タ ウ イ ル ス の column と い consistent high ratio を shown し た. こ の knowledge か ら, ブ タ お よ び ヒ ト の type a G12 ロ タ ウ イ ル ス は, ブ タ と ヒ ト の ロ タ ウ イ ル ス の heritage 伝 son to aggregate で あ っ た possibility, ま た は ブ タ と ヒ ト の a G12 ロ タ ウ イ ル ス が with じ の common ancestor ウ イ ル ス に origin し, another に molecular evolution し た こ と が in stopping さ れ た. (3) ヤ ギ group A ロ タ ウ イ ル ス に つ い て early め て full heritage 伝 with sequence を decided し (G034 strains), both known の ヒ ト, animal ロ タ ウ イ ル ス と line system analytic を っ た. そ の results, ヤ ギ ロ タ ウ イ ル ス の a の heritage 伝 sub section は G6, the G8, a G12 な ど の of atypical ロ タ ウ イ ル ス の heritage 伝 sub section を と い consistent high rate in し た. こ の こ と か ら ヒ ト の of atypical ロ タ ウ イ ル ス の form に ヤ ギ ロ タ ウ イ ル ス の 伝 sowing, but 伝 re-collect が masato and し た こ と が in stopping さ れ た.

项目成果

Molecular characterization of rare bovine group A rotavirus G15P[11] and G15P[21] strains from eastern India: identification of simian SA11-like VP6 genes in G15P[21] strains

• DOI: 10.1007/s11262-008-0260-y
• 发表时间: 2008-10-01
• 期刊: VIRUS GENES
• 影响因子: 1.6
• 作者: Ghosh, Souvik;Samajdar, Sudipta;Naik, Trailokya N.
• 通讯作者: Naik, Trailokya N.

Full genomic analysis and possible origin of a porcine G12 rotavirus strain RU172

• DOI: 10.1007/s11262-010-0454-y
• 发表时间: 2010-06-01
• 期刊: VIRUS GENES
• 影响因子: 1.6
• 作者: Ghosh, S.;Kobayashi, N.;Naik, T. N.
• 通讯作者: Naik, T. N.

Human group A rotavirus P[8] Hun9-like and rare OP354-like strains are circulating among diarrhoeic children in Eastern India

• DOI: 10.1007/s00705-008-0187-6
• 发表时间: 2008-09
• 期刊: Archives of Virology
• 影响因子: 2.7
• 作者: S. Samajdar;S. Ghosh;D. Dutta;M. Chawla-Sarkar;N. Kobayashi;T. Naik

Molecular characterization of full-length genomic segment 2 of a bovine picobirnavirus strain : evidence for high genetic diversity with genogroup I picobirnaviruses

牛小核糖核酸病毒株全长基因组片段 2 的分子特征：基因组 I 小核糖核酸病毒具有高遗传多样性的证据

• 发表时间: 2009
• 期刊: Journal of General Virology 90
• 作者: Ghosh S;et al.
• 通讯作者: et al.

Molecular characterization of full-length gene segment 2 of a bovine genogroup I picobirnavirus strain

牛基因组 I 小核糖核酸病毒株全长基因片段 2 的分子特征

• 发表时间: 2009
• 作者: Ghosh S;小林宣道;長嶋茂雄;Naik TN.
• 通讯作者: Naik TN.