Preparation of the glycol-arrays for aiming at the ordered and well-defined accumulation and the analyses of the interaction to proteins

制备乙二醇阵列以实现有序且明确的积累并分析与蛋白质的相互作用

• 批准号: 20550150
• 负责人: MORI Toshiaki
• 金额: $ 3.16万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20550150/
• 关键词: atomic force microscopy (AFM); verotoxin; Gb3 sugar molecules; single molecular measurement; Quartz-crystal microbalance (QCM); 細胞膜; 複合糖質; Gb3糖脂質; ベロ毒素; 生体分子間相互作用; 水晶発振子マイクロバランス; フォースカーブ測定; 1分子計測; コンドロイチン; 糖鎖伸長酵素; SPM; 一分子計測

In order to elucidate the multivalent interactions between carbohydrates and proteins, and to prepare the glycol arrays which immobilized onto the solid surfaceWe could succeed in arraying carbohydrate ligands on the surface with dispersion by utilizing the biotin-avidin interaction, and the kinetic analyses for protein binding could be performed with the QCM system.Moreover, we have analyzed interaction forces between a verotoxin that is a substance responsible for o-157 and Gb3 sugar molecules on a cell surface. The rupture forces were obtained by changing loading rates and we can get an effective bond length which is an important parameter for an analysis of interaction mechanisms. We can have detected single-molecular interaction forces, and we will discuss about the interaction mechanism in more detail by an analysis of the forces.

为了阐明碳水化合物与蛋白质之间的多价相互作用，并制备固定在固体表面上的二醇阵列，我们利用生物素-亲和素相互作用，成功地将碳水化合物配体分散排列在表面上，并可以利用QCM系统进行蛋白质结合的动力学分析。此外，我们还分析了糖配体之间的相互作用力。 维罗毒素是细胞表面产生 o-157 和 Gb3 糖分子的物质。通过改变加载速率获得断裂力，并且我们可以获得有效键长，这是分析相互作用机制的重要参数。我们可以检测到单分子相互作用力，并且我们将通过对力的分析来更详细地讨论相互作用机制。

项目成果

コンドロイチンポリメラーゼによる-糖交互伸長反応の解析

软骨素聚合酶交替糖延伸反应的分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 森俊明;小寺貴之;岡畑恵雄
• 通讯作者: 岡畑恵雄

高速原子間力顕微鏡を用いたコンドロイチンポリメラーゼの一分子酵素反応の観察

高速原子力显微镜观察软骨素聚合酶的单分子酶促反应

• 发表时间: 2010
• 作者: 大塚雅徳;飯田匡章;森俊明;岡畑恵雄
• 通讯作者: 岡畑恵雄

Kinetic studies of dextransucrase enzyme reactions on a substrate- or enzyme-immobilized 27 MHz quartz crystal microbalance.

• DOI: 10.1021/la104550m
• 发表时间: 2011-01
• 期刊: Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
• 作者: T. Nihira;Toshiaki Mori;Megumi Asakura;Y. Okahata

フォースカーブ測定によるデキストランスクラーゼ糖鎖伸長反応の一分子計測

通过力曲线测量单分子测量葡聚糖蔗糖酶糖链延长反应

• 发表时间: 2009
• 作者: 浅倉恵;森俊明;岡畑恵雄
• 通讯作者: 岡畑恵雄

SPMフォースカーブ測定による糖鎖伸長酵素反応の解析

通过SPM力曲线测量分析糖链延伸酶反应

• 发表时间: 2009
• 作者: 森俊明;浅倉恵;岡畑恵雄
• 通讯作者: 岡畑恵雄