Conversion of catalytic mechanism of glycoside hydrolases

糖苷水解酶催化机制的转换

• 批准号: 20780068
• 负责人: OKUYAMA Masayuki
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20780068/
• 关键词: 糖質加水分解酵素; 触媒機構; タンパク質工学; 触媒メカニズム; 分子進化; 糖転移反応

I discovered an unique glycoside hydrolases family which contains inverting- and retaining-catalytic enzymes. This divergence was due to the simple difference of the position of catalytic residues. We attempted to convert the catalytic mechanism of these enzyme each other. However, the attempt was failed. These results indicated that two similar enzymes diverged from a common ancestor in early stage of evolution and each enzyme evolved in different ways.

我发现了一个独特的糖苷水解酶家族，它含有转化和保留催化酶。这种差异是由于催化残基位置的简单差异造成的。我们试图将这些酶的催化机理相互转换。然而，这一尝试失败了。这些结果表明，在进化的早期阶段，两个相似的酶从一个共同的祖先分化而来，每个酶以不同的方式进化。

项目成果

Substrate recognition mechanism of α-1,6-glucosidic linkage hydrolyzing enzyme, dextran glucosidase from Streptococcus mutans

• DOI: 10.1016/j.jmb.2008.03.016
• 发表时间: 2008-05-09
• 期刊: JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
• 影响因子: 5.6
• 作者: Hondoh, Hironori;Saburi, Wataru;Kimura, Atsuo
• 通讯作者: Kimura, Atsuo

Catalytic mechanism of retainingα-galactosidase belonging to glycoside hydrolase family 97.

属于糖苷水解酶家族97的保留α-半乳糖苷酶的催化机制。

• 发表时间: 2009
• 期刊: J. Mol. Biol. 392
• 作者: Okuyama M;Kitamura M;Hondoh H;他5名
• 通讯作者: 他5名

Functional and structural analysis of glycoside hydrolase family 97 enzyme from Bacteroides thetaiotaomicron

多形拟杆菌糖苷水解酶家族 97 的功能和结构分析

• 发表时间: 2008
• 作者: Lee;J. -H.;牧 孝多朗;西村崇志;牧孝太朗;森春英;貞廣樹里;森春英;鐘ヶ江倫世;貞廣樹里;Mori H;森春英;奥山正幸
• 通讯作者: 奥山正幸

Substrate recognition mechanism of alpha-1, 6-glucosidic linkage hydrolyzing enzy me, dextran glucosidase from Streptococcus mutans

变形链球菌α-1,6-糖苷键水解酶、右旋糖苷酶的底物识别机制

• 发表时间: 2008
• 期刊: Journal of Molecular Biology 378
• 作者: Hondoh H;Saburi W;Mori H;Okuyama M;Nakada T;Matsuura Y;Kimura A;Kitamura M et.al.;Hondoh H et.al.
• 通讯作者: Hondoh H et.al.

糖質加水分解酵素ファミリー97の配列類似性と機能類似性の関係

碳水化合物水解酶家族97序列相似性与功能相似性的关系

• 发表时间: 2009
• 作者: 奥山正幸;他
• 通讯作者: 他