Molecular mechanisms of co-evolution of mitochondrial genetic codes and tRNA in the evolution of animals

动物进化中线粒体遗传密码与tRNA共同进化的分子机制

• 批准号: 21570242
• 负责人: WATANABE Kimitsuna
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: The University of Tokyo (2010-2011)National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (2009)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21570242/
• 关键词: 遺伝暗号; ミトコンドリア; tRNA; 修飾塩基; 分子進化; マボヤ; ヤリイカ; 非普遍暗号; ゲノム解析

In animal mitochondria, distribution of the non-universal codons(relationship between codon and amino acid) has been clarified in all animal phyla. However, relationship between codon and anticodon has not clarified except for Vertebrata and Nematoda. In order to elucidate a whole image for the decoding mechanism of genetic code, we isolated the relevant tRNAs from a tunicate(ascidian) and a mollusc(squid) and analysed them by using LC/MS. By doing so, we clarified the relationship. We found 5-taurinomethyluridine(. m5U) in the first position of ascidian tRNATrp, tRNAMet and tRNAGly, and squid tRNATrp and concluded that. m5U-bearing anticodons decode A-and G-ending codons.

在动物线粒体中，非通用密码子（密码子与氨基酸之间的关系）在所有动物门中的分布已被阐明。但密码子与反密码子之间的关系除脊椎动物和线虫外，尚不清楚。为了阐明遗传密码解码机制的整体图像，我们从被囊动物（海鞘）和软体动物（鱿鱼）中分离出相关的tRNA，并使用LC/MS分析它们。我们发现5-taurinomethyluridine（. m5 U）位于海鞘tRNATrp、tRNAMet和tRNAGly以及鱿鱼tRNATrp的第一位。携带m5 U的反密码子解码A-和G-末端密码子。

项目成果

深海性二枚貝シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析

深海双壳类线粒体基因组分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 小澤元希;島村繁;高木善弘;横堀伸一;丸山正;吉田尊雄
• 通讯作者: 吉田尊雄

tRNAから見た遺伝暗号の進化

从tRNA角度看遗传密码的进化

• 发表时间: 2011
• 作者: 金子和久;ほか;横堀伸一
• 通讯作者: 横堀伸一

Molecular phylogeny of urochordates and evolution of mitochondrial genetic code in urochordate mitochondria

尾索动物的分子系统发育和尾索动物线粒体遗传密码的进化

• 发表时间: 2011
• 作者: Yokobori;S.;K.Watanabe;A.Yamagishi
• 通讯作者: A.Yamagishi

生命化学II 改訂版

生命化学II修订版

• 发表时间: 2011
• 作者: Honma Y;Yoshida Y;Terachi T;Toriyama K;Mikami T & Kubo T;渡辺公綱・姫野俵太
• 通讯作者: 渡辺公綱・姫野俵太

Taurine-containing uridine modifications in tRNA anticodons are required to decipher non-universal genetic codes in ascidian mitochondria

破译海鞘线粒体中的非通用遗传密码需要 tRNA 反密码子中含有牛磺酸的尿苷修饰

• DOI: 10.1074/jbc.m111.279810
• 发表时间: 2011
• 期刊: J. Biol. Chem
• 作者: Suzuki T (第1著者);他8名
• 通讯作者: 他8名