Development of a method for analysis of oral microbiota applicable to a large-scale population

开发适用于大规模人群的口腔微生物群分析方法

• 批准号: 21592652
• 负责人: NAKANO Yoshio
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Nihon University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21592652/
• 关键词: 予防歯科学; 細菌叢; 16S rRNA; T-RFLP

There are several hundreds species of oral bacteria in human oral cavities. We constructed a system for effective calculation using Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism, T-RFLP, in order to calculate compositions of oral microbial species. We succeeded in estimating compositions of bacterial species by a Monte Carlo algorithm. This program estimates proportional compositions by minimizing distances between peak values and the relative abundance of each group, containing several species, estimated from peak areas of capil-lary electrophoresis for T-RFLP analysis. In addition, databases of 16S rRNA sequences from oral and intestine microbiota to calculate bacterial composition by T-RFLP analyses.

人类口腔中有数百种口腔细菌。为了计算口腔微生物的种类组成，我们构建了一个利用末端限制性片段长度多态性（T-RFLP）进行有效计算的系统。我们成功地估计组成的细菌物种的Monte Carlo算法。该程序通过最小化峰值之间的距离和每组的相对丰度来估计比例组成，每组包含几个物种，由毛细管电泳的峰面积估计用于T-RFLP分析。此外，来自口腔和肠道微生物群的16 S rRNA序列数据库通过T-RFLP分析计算细菌组成。

项目成果

硫化水素およびメチルメルカプタン高産生口腔異常フローラの細菌構成

高产硫化氢和甲硫醇的异常口腔菌群的细菌组成

• 发表时间: 2011
• 作者: 竹下徹;鈴木奈央;中野善夫;米田雅裕;廣藤卓雄;山下喜久
• 通讯作者: 山下喜久

塩化亜鉛溶液を用いた洗口による口腔内細菌叢の変化の解析

氯化锌溶液漱口对口腔菌群的变化分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 鈴木奈央;中野善夫;畑野優子;米田雅裕;横瀬勝美;桑田文幸;廣藤卓雄
• 通讯作者: 廣藤卓雄

Enteral Tube Feeding Alters the Oral Indigenous Microbiota in Elderly Adults

• DOI: 10.1128/aem.00651-11
• 发表时间: 2011-10-01
• 期刊: APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 4.4
• 作者: Takeshita, Toru;Yasui, Masaki;Yamashita, Yoshihisa
• 通讯作者: Yamashita, Yoshihisa

口腔内細菌叢解析による口臭予測

通过口腔微生物群分析预测口臭

• 发表时间: 2010
• 作者: Okada Y;Imendra KG;Miyazaki T;Hotokezaka H;Fujiyama R;Toda K;中野善夫
• 通讯作者: 中野善夫

Relationship between Oral Malodor and the Global Composition of Indigenous Bacterial Populations in Saliva

• DOI: 10.1128/aem.02304-09
• 发表时间: 2010-05-01
• 期刊: APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 4.4
• 作者: Takeshita, Toru;Suzuki, Nao;Yamashita, Yoshihisa
• 通讯作者: Yamashita, Yoshihisa