3次共生に伴う真核共生体退化核ゲノム構造と縮退過程の解明

阐明与第三级共生相关的真核共生体的核基因组结构和退化过程

• 批准号: 09J00508
• 负责人: 松本 拓也
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09J00508/
• 关键词: ヌクレオモルフ; Lepidodinium; 葉緑体; 3次共生; 渦鞭毛藻類

本研究では、緑色渦鞭毛藻類Lepidodinium chlorophurumが持つ、共生藻退化核であるヌクレオモルフ (Nm) の探索を行っている。Lepidodnium葉緑体周辺区画内には、2重膜に囲まれ、穴の空いた構造体が電子顕微鏡観察により確認されている。葉緑体周辺区画は共生緑藻のかつての細胞質に相当し、そこに存在する2重膜構造体は退化・縮小した緑藻核、すなわちNMではないかと考えられている。しかし、Nm様構造体は、電子顕微鏡写真により確認されているだけで、DNAの存在は未知である。本研究では、EST解析を行い、ヌクレオモルフゲノムの構造を決定する。そして、クリプト藻類、クロララクニオン藻類が持つヌクレオモルフゲノム構造と比較することにより、真核共生体核ゲノムの縮退過程の解明を目的とする。H23年度では、H22年度作成したcDNAライブラリーを用いて網羅的発現遺伝子(Expression Sequence TagあるいはEST)解析により配列情報を獲得した。そめ中で特に緑藻類に相同性を示すハウスキーピング遺伝子(転写、翻訳、複製に関する遺伝子)を、BLASTサーチプログラムを用いて探索した。これらの配列は、L.chlorophorumが持つNm関連遺伝子である可能性が高い。その結果、緑藻類と近縁性を示すHistonや、eukaryotic initiation factor(翻訳開始因子)遺伝子の部分配列が得られた。これら配列データは、NMにゲノムが存在し、翻訳、転写が行われている事を示唆している。得られた配列情報を基に分子系統解析を行ったがその起源ははっきりとはしなかった。今後は、完全長配列を取得し、分子系統解析に基づいて起源を精査していく。また、輸送システムについても輸送配列の精査を行い、そのメカニズムについて言及する。

In this study, the Lepidodinium chlorophurum species of dinoflagellates, dinoflagellates, and the degenerated nuclei of symbiotic algae were studied in this study. (Nm). In the Lepidodnium body perimeter area, there are two layers of film, two layers of film, and a hole in the body. The electron micrograph is used to make sure that the image is fine. In the area around the body, there is a picture of symbiotic algae, which is similar to the cells, and that there is a double membrane structure in which there is a degeneration of a small algal nucleus, and a NM cell. The computer, the Nm system, the computer microphone, and the computer confirm that there is an unknown error in the DNA. In this study, EST analysis was used to determine the accuracy of the decision. In the process of understanding the process of eukaryotic symbiosis, the process of eukaryotic symbiosis is not known. In H23 and H22 years, the Expression Sequence Tag user EST of the cDNA Internet usage network was created to analyze the performance of the subscriber allocation situation. The similarity of special algae in China shows that you need to write, flip, copy, copy, write, copy, copy, copy The probability is high that L.chlorophorum holds the high probability of Nm. According to the results of the experiment, the phytoplankton proximity test showed that the Histon and eukaryotic initiation factor (flip start factor) substrates were partially matched with satisfactory results. Please assign the following items: exist, flip, write, write, read, write, write It is necessary to configure the basic molecular system to analyze the origin of the system. In the future, the full length of the array has been obtained, and the molecular system has been used to analyze the origin of the molecular system. Please send me a list of words, lines, lines, words, words and expressions.

项目成果

Chromera velia及びCMP3155株葉緑体ゲノム解析から推測するアルベオラータ葉緑体の進化

从 Chromera velia 和 CMP3155 菌株的叶绿体基因组分析推断出 Alveolata 叶绿体的进化

• 发表时间: 2010
• 期刊: 藻類Jpn J Phycol (Sorui)
• 作者: 石川奏太;松本拓也
• 通讯作者: 松本拓也

Rooting for the root of elongation factor-like protein phylogeny

• DOI: 10.1016/j.ympev.2010.04.040
• 发表时间: 2010-09-01
• 期刊: MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION
• 影响因子: 4.1
• 作者: Kamikawa, Ryoma;Sakaguchi, Miako;Inagaki, Yuji
• 通讯作者: Inagaki, Yuji

Green-colored plastids in the dinoflagellate genus Lepidodinium are a member of core chlorophytes in origin

甲藻属鳞甲藻属中的绿色质体是起源于核心叶绿藻的成员

• 发表时间: 2011
• 期刊: Protist
• 影响因子: 2.5
• 作者: Takuya Matsumoto;Fumihiko Shinozaki;Tomoko Chikuni;Akinori Yabuki;Kiyotaka Takishita;Masanobu Kawachi;Takeshi Nakayama;Isao Inouye;Tetsuo Hashimoto;Yuji Inagaki
• 通讯作者: Yuji Inagaki

クロロフィルa, bを持つ緑色渦鞭毛藻類Lepidodinium Chlorphorumの葉緑体起源探索:11葉緑体遺伝子配列データに基づく解析

寻找含有叶绿素a和b的绿色甲藻Lepidodinium Chlorphorum中叶绿体的起源：基于11个叶绿体基因序列数据的分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 松本拓也;篠崎文彦;千國友子;矢吹彬憲;瀧下清貴;河地正伸;中山剛;橋本哲男;稲垣祐司
• 通讯作者: 稲垣祐司

Green-colored Plastids in the Dinoflagellate Genus Lepidodinium are of Core Chlorophyte Origin

• DOI: 10.1016/j.protis.2010.07.001
• 发表时间: 2011-04-01
• 期刊: PROTIST
• 影响因子: 2.5
• 作者: Matsumoto, Takuya;Shinozaki, Fumihiko;Inagaki, Yuji
• 通讯作者: Inagaki, Yuji