Selfish DNases at a diverging point to survival, death and evolution

自私的DNA酶处于生存、死亡和进化的分歧点

• 批准号: 21370001
• 负责人: KOBAYASHI Ichizo
• 金额: $ 12.15万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21370001/
• 关键词: ゲノム構築; ゲノム再編; ゲノム維持; ゲノム進化

Our experimental analyses and genome comparisons revealed how DNAases distinguishing self and non-self genome acted on genomes and drove their evolution.1. We revealed role of antisense RNA in their gene regulation and life cycle.2. We showed several restriction enzymes cleave a DNA replication fork.3. With restriction enzyme attacking the chromosome, we demonstrated success of suicidal defense strategy against infection.4. Genome comparison of H. pylori revealed novel mechanisms of genome rearrangements and suggested that restriction modification systems frequently switch their recognition sequence.

我们的实验分析和基因组比较揭示了区分自我和非自我基因组的DNA酶是如何作用于基因组并驱动其进化的.揭示了反义RNA在其基因调控和生命周期中的作用.我们展示了几种限制性内切酶切割DNA复制叉。通过限制性内切酶攻击染色体，我们证明了针对感染的自杀性防御策略的成功. H. pylori揭示了基因组重排的新机制，并表明限制性修饰系统经常转换其识别序列。

项目成果

Cleavage of a model DNA replication fork by a Type I restriction endonuclease

• DOI: 10.1093/nar/gkp214
• 发表时间: 2009-06-01
• 期刊: NUCLEIC ACIDS RESEARCH
• 影响因子: 14.9
• 作者: Ishikawa, Ken;Handa, Naofumi;Kobayashi, Ichizo
• 通讯作者: Kobayashi, Ichizo

ピロリ菌ゲノムに残された相同組換えの痕跡

幽门螺杆菌基因组中留下的同源重组痕迹

• 发表时间: 2012
• 作者: 小林一三;古田芳一;吉田優;東健
• 通讯作者: 東健

ピロリ菌cagA癌遺伝子の組換えによる進化

幽门螺杆菌cagA癌基因通过重组的进化

• 发表时间: 2012
• 作者: 古田芳一;矢原耕史;畠山昌則;小林一三
• 通讯作者: 小林一三

タンパク遺伝子内でのドメイン配列移動(Domo)

蛋白质基因内的结构域序列移动 (Domo)

• 发表时间: 2011
• 作者: 古田芳一;河合幹彦;内山郁夫;小林一三
• 通讯作者: 小林一三

遺伝子内ドメイン移動

基因内结构域移动

• 发表时间: 2011
• 作者: 古田芳一;河合幹彦;内山郁夫;小林一三
• 通讯作者: 小林一三