Epidemics and evolution on the commuter network in metropolitan area

都市圈通勤网络的流行与演变

• 批准号: 21370009
• 负责人: SASAKI Akira
• 金额: $ 12.15万
• 依托单位: The Graduate University for Advanced Studies
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21370009/
• 关键词: 空間明示的疫学モデル; 交通流動ネットワーク; インフルエンザ; ウイルス強毒株変異; 伝染病防除政策; 口蹄疫; 農場ベースモデル; 分岐過程; 感染症; ネットワーク; 交通流動調査; ハブ; コンパートメントモデル; 空間情報; 伝染病; ネットワークトの感染動態; 病原体の毒性; 小さな世界; 大都市交通センサス; 基本増殖率; 空間構造; 個体ベースモデル

Epidemic dynamics of an infectious disease spreading over the commute network in Tokyo metropolitan area is analyzed using a simple mathematical model. The model is formulated based on the meta-population connected by commuter trains where each population is interconnected by commuter flows. Here, the actual data from the Urban Transportation Census(Japanese Ministry of Land, Infrastructure, Transport and Tourism) is used to simulate the movements of commuters. The effect of infectiousness of pathogen and the structure of commute network are investigated and the following results are obtained. The probability of global epidemic and the final size of global epidemic are mainly determined by the joint distribution of home and work population sizes, but is insensitive to the geographical or topological structure of the network.

用简单的数学模型分析了一种传染病在东京大都市区交通网络中传播的流行动力学。该模型基于通勤列车连接的元人口，其中每个人口通过通勤流相互连接。这里，来自城市交通普查（日本国土、基础设施、交通和旅游部）的实际数据被用来模拟通勤者的运动。对病原菌传染性的影响和交通网络的结构进行了研究，得到了以下结果：全球流行的概率和全球流行的最终规模主要由家庭和工作人口规模的联合分布决定，但对网络的地理或拓扑结构不敏感。

项目成果

Applying theories of arms races of plants and their parasites : Camellia-weevil system and rice blast disease (Invited talk)

植物及其寄生虫军备竞赛理论的应用：茶象甲系统和稻瘟病（特邀报告）

• 发表时间: 2011
• 作者: A.Kikuchi;L.Zhang;N.Okinaka;T.Tosho;T.Akiyama;Akira Sasaki
• 通讯作者: Akira Sasaki

Antigenic distance and cross-immunity, invasibility and coexistence of pathogen strains in anepidemiological model with discrete antigenic space

离散抗原空间流行病学模型中病原体株的抗原距离与交叉免疫、侵袭性和共存性

• 发表时间: 2009
• 期刊: Theoretical Population Biology
• 影响因子: 1.4
• 作者: Adams;B.;and Sasaki;A.
• 通讯作者: A.

多次元尺度法と個体ベースモデルによるインフルエンザ抗原進化の予測

使用多维尺度和基于个体的模型预测流感抗原进化

• 发表时间: 2010
• 作者: Nitta K;Yasumoto AA;and Yahara T.;佐々木顕
• 通讯作者: 佐々木顕

インフルエンザ新系統の出現時期

新流感病毒株出现的时间

• 发表时间: 2010
• 作者: Tachiki;Y. andY. Iwasa;Yu Kanesaki;佐々木顕
• 通讯作者: 佐々木顕

群集生態モデルと進化動態 : 資源分割理論を例に. 群集生態学2-進化生物学からせまる(大串隆之・近藤倫生・吉田丈人 (編))

群落生态模型和进化动力学：以资源分配理论为例 2 - 来自进化生物学（Takayuki Ohkushi、Michio Kondo、Taketo Yoshida（编辑））。

• 发表时间: 2009
• 作者: Mougi;A.;and Y. Iwasa;佐々木顕
• 通讯作者: 佐々木顕