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Regulation of APOBEC3 gene expression and its transcript splicing

APOBEC3基因表达及其转录剪接的调控

基本信息

批准号：
21390143
负责人：
MIYAZAWA Masaaki
金额：
$ 10.15万
依托单位：
Kinki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2011
项目状态：
已结题

项目摘要

Polymorphisms at the mouse APOBEC3(mA3) gene locus have been associated with different susceptibilities to infection with mouse leukemia viruses. In virus-resistant C57BL/6(B6) mice, mA3 transcripts and protein are more abundant than those in susceptible BALB/c mice, and these strains of mice also express mA3 transcripts with different splicing patterns. B6 mice express predominantly the exon 5-deficient transcript, which confer more efficient translation than the full-length transcript. By employing in vitro splicing assays using genomic DNA clones, we identified two critical determinants that regulate exon 5 inclusion into mA3 transcripts : the number of TCCT repeats upstream of exon 5 and the newly identified single nucleotide polymorphism within exon 5 located 12 bases upstream of the exon 5/intron 5 boundary.

小鼠 APOBEC3(mA3) 基因位点的多态性与小鼠白血病病毒感染的不同易感性相关。在抗病毒的C57BL/6(B6)小鼠中，mA3转录本和蛋白质比易感BALB/c小鼠更丰富，并且这些品系的小鼠也表达具有不同剪接模式的mA3转录本。 B6 小鼠主要表达外显子 5 缺陷转录本，这比全长转录本具有更有效的翻译效率。通过使用基因组 DNA 克隆进行体外剪接测定，我们确定了调节外显子 5 纳入 mA3 转录本的两个关键决定因素：外显子 5 上游的 TCCT 重复次数和外显子 5 内新鉴定的单核苷酸多态性，位于外显子 5/内含子 5 边界上游 12 个碱基处。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

High-level Rac2 expression associated with novel intron polymorphisms restricts HIV-1 replication in exposed seronegative individuals

与新型内含子多态性相关的高水平 Rac2 表达限制了暴露于血清阴性个体中的 HIV-1 复制

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kanari;Y.;et al.
通讯作者：
et al.

New metabolic markers derived from gamma and deltaretrovirus envelope glycoproteins

来自γ和δ逆转录病毒包膜糖蛋白的新代谢标记物

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sitbon;M.;et al.
通讯作者：
et al.

Persistence of viremia and production of neutralizing antibodies differentially regulated by polymorphic APOBEC3 and BAFF-R loci in Friend virus-infected mice

弗兰德病毒感染小鼠中病毒血症的持续存在以及中和抗体的产生受多态性 APOBEC3 和 BAFF-R 基因座的差异调节

DOI：
10.1128/jvi.02516-09
发表时间：
2010
期刊：
J. Virol
影响因子：
0
作者：
Tsuji-Kawahara;S.;T. Chikaishi;E. Takeda;M. Kato;S. Kinoshita;E. Kajiwara;S. Takamura;M. Miyazawa
通讯作者：
M. Miyazawa

Infection of thymus with murine retrovirus induces virus-specific central tolerance that prevents dynamic differentiation of functional memory CD8+T cells

鼠逆转录病毒感染胸腺可诱导病毒特异性中枢耐受，从而阻止功能性记忆 CD8 T 细胞的动态分化