E‐Life構築を目指したD型タンパク質翻訳系の開発
开发D型蛋白质翻译系统,构建E-Life
基本信息
- 批准号:21651088
- 负责人:
- 金额:$ 2.05万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- 财政年份:2009
- 资助国家:日本
- 起止时间:2009 至 2010
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
生命はL型アミノ酸から構成されるタンパク質とD型デオキシリボースを含むDNAから構成されている。このように、生物学的経路の中心の役割を担うタンパク質とDNAはホモキラリティーが確立しており、その選択性が厳密に制御されている。しかしながら、L型タンパク質とD型タンパク質問、あるいはD型タンパク質同士の相互作用について実験的に解き明かされた報告はほとんどない。これらを解明するためには、L型タンパク質だけではなく、D型のタンパク質を用いた解析が必須であるが、天然のリボソームではD型アミノ酸などの非天然アミノ酸をペプチド鎖に組み込むことが出来ず、タンパク質翻訳により非天然の生体分子を得ることは不可能である。本研究では、D型タンパク質翻訳系の確立を目指し、『D型アミノ酸をペプチド鎖に組み込むことの出来るリボソームの開発』を目的とする。前年度までにペプチド結合転移反応の反応中心であるペプチジルトランスフェラーゼセンター(PTC)を変異させたランダム変異ライブラリーを作製するため、23SrRNAのDNA配列を含むrrnBオペロンをクローニングしている。本年度は、リボソーム立体構造の詳細な解析結果により決定した二カ所の部位(2444-2449位と2498-2535位)にランダム変異を導入する手法としてランダムプライマー法を用い、1.rrnBオペロン全体をPCRで増幅する方法および2.変異導入部位周辺をPCRで増幅した後、全長rrnBオペロンへと組み込む方法の二つの方法を実施した。その結果、1.rrnBオペロン全長をPCRで増幅する手法がrrnBランダム変異ライブラリーの作成に適していることが明らかとなった。この手法を用い、PTCにランダム変異を組み込んだrrnBライブラリーの作製法を確立した。
Life は L ア ミ ノ acid か ら constitute さ れ る タ ン パ ク qualitative と type D デ オ キ シ リ ボ ー ス を containing む DNA か ら constitute さ れ て い る. こ の よ う に, biology 経 の way の center "を cut bear う タ ン パ ク qualitative と DNA は ホ モ キ ラ リ テ ィ ー が establish し て お り, そ の sentaku sex が 厳 dense に suppression さ れ て い る. し か し な が ら, L タ ン パ ク qualitative と type D タ ン パ ク questioned, あ る い は type D タ ン パ ク qualitative interaction with people の に つ い て be 験 に solution き Ming か さ れ た report は ほ と ん ど な い. こ れ ら を interpret す る た め に は, L タ ン パ ク qualitative だ け で は な く, D type の タ ン パ ク qualitative を with い た parsing が must で あ る が, natural の リ ボ ソ ー ム で は type D ア ミ ノ acid な ど の unnatural ア ミ ノ acid を ペ プ チ ド lock に group み 込 む こ と が ず, タ ン パ ク qualitative double 訳 に よ り unnatural の raw body molecules are を る こ と は impossible Youdaoplaceholder0. This study で は, D type タ ン パ ク qualitative double 訳 を refers is の established し, "type D ア ミ ノ acid を ペ プ チ ド lock に group み 込 む こ と の out る リ ボ ソ ー ム の 発" を purpose と す る. Before the annual ま で に ペ プ チ ド inverse planning move 応 の anti 応 center で あ る ペ プ チ ジ ル ト ラ ン ス フ ェ ラ ー ゼ セ ン タ ー (PTC) を - different さ せ た ラ ン ダ ム - different ラ イ ブ ラ リ ー を cropping す る た め, 23 srrna の DNA match column を containing む rrnB オ ペ ロ ン を ク ロ ー ニ ン グ し て い る. This year は, リ ボ ソ ー ム three-dimensional structure の detailed analytical results に な よ り decided し た second カ の parts (2535) 2444-2449 と 2498 - に ラ ン ダ ム - different を import す る gimmick と し て ラ ン ダ ム プ ラ イ マ ー method を い, 1. RrnB オ ペ ロ ン all を PCR で rights of す る method お よ び 2. After the mutation introduction site week 辺をPCRで increase amplitude <s:1> た, full-length rrnB ペロ ペロ へと へと group み込む method <s:1> two method を implementation た. そ の results, 1. RrnB オ ペ ロ ン span を PCR で rights of す る gimmick が rrnB ラ ン ダ ム - different ラ イ ブ ラ リ ー の made に optimum し て い る こ と が Ming ら か と な っ た. こ の gimmick を い, PTC に ラ ン ダ ム group - different を み 込 ん だ rrnB ラ イ ブ ラ リ ー の method for を establish し た.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Effect of Peptide Oligomerization Mediated by p53 Tetramerization Domain on Biomineralization Activity
p53 四聚化结构域介导的肽寡聚化对生物矿化活性的影响
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:T. Sakaguchi;R. Kamada;and K. Sakaguchi
- 通讯作者:and K. Sakaguchi
Low Threshold of Destabilization for Loss of Tumor Suppressor Activity of p53 : A Quantitative Analysis of p53 Tetramerization Domain Mutants.
p53 肿瘤抑制活性丧失的不稳定低阈值:p53 四聚化结构域突变体的定量分析。
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:2.4
- 作者:Ono;E.;Homma;Y.;Horikawa;M.;Kunikane-Doi;S.;Imai;H.;Takahashi;S.;Kawai;Y.;Ishiguro;M.;Fukui;Y.;Nakayama,T;R.Kamada
- 通讯作者:R.Kamada
生体内タンパク質発現レベルでの癌抑制タンパク質p53細胞内転写活性解析
抑癌蛋白p53体内蛋白表达水平的细胞内转录活性分析
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:S. Ohshima;et al
- 通讯作者:et al
Drastic Effects on Fibril Formation of Amyloid-beta Peptides by the Addition of Amino Acid Residue Units to the Termini
通过在末端添加氨基酸残基单元对淀粉样β肽原纤维形成产生巨大影响
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Asanomi;Y.;Kobayashi;Y;Sakai;H.;Masuda;T.;Chen;X.;Chuman;Y.;Uosaki;K.;Sakaguchi;K.
- 通讯作者:K.
Development of Probed-SCAP Directed at Thiol Groups
针对硫醇基团的 Probed-SCAP 的开发
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:2.4
- 作者:Watanabe;et al.
- 通讯作者:et al.
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
坂口 和靖其他文献
Au(001)上bcc Co薄膜のナノ構造とXMCD/STM測定(口頭)
Au(001) 上 bcc Co 薄膜的纳米结构和 XMCD/STM 测量(口头)
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
斎藤英雄;林邦彦;植松裕子;川本哲也;窪川直毅;藤原 徹;Akihiro Yoshida;坂口 和靖;鎌田 瑠泉;中馬 吉郎;野村 尚生;鎌田 瑠泉;鎌田 瑠泉;野村 尚生;宮崎 広充;八木 寛陽;二本杉剛;二本杉剛(西條辰義氏と共同発表);二本杉剛(西條辰義氏と共同発表);T. Kawagoe;宮町俊生 - 通讯作者:
宮町俊生
An fMRI Study of Spiteful and Altruistic Behavior
恶意和利他行为的功能磁共振成像研究
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
斎藤英雄;林邦彦;植松裕子;川本哲也;窪川直毅;藤原 徹;Akihiro Yoshida;坂口 和靖;鎌田 瑠泉;中馬 吉郎;野村 尚生;鎌田 瑠泉;鎌田 瑠泉;野村 尚生;宮崎 広充;八木 寛陽;二本杉剛;二本杉剛(西條辰義氏と共同発表) - 通讯作者:
二本杉剛(西條辰義氏と共同発表)
癌抑制タンパク質p53四量体形成ドメインペプチドの構造安定性の制御
抑癌蛋白p53四聚化结构域肽结构稳定性的控制
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
斎藤英雄;林邦彦;植松裕子;川本哲也;窪川直毅;藤原 徹;Akihiro Yoshida;坂口 和靖;鎌田 瑠泉;中馬 吉郎;野村 尚生 - 通讯作者:
野村 尚生
軌道角運動量状態に関する量子メモリのプロセス推定
轨道角动量态的量子记忆过程估计
- DOI:
- 发表时间:
2010 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
斎藤英雄;林邦彦;植松裕子;川本哲也;窪川直毅;藤原 徹;Akihiro Yoshida;坂口 和靖;鎌田 瑠泉;中馬 吉郎;野村 尚生;鎌田 瑠泉;鎌田 瑠泉;野村 尚生;宮崎 広充;八木 寛陽;二本杉剛;二本杉剛(西條辰義氏と共同発表);二本杉剛(西條辰義氏と共同発表);T. Kawagoe;宮町俊生;井上遼太郎 - 通讯作者:
井上遼太郎
アゾベンゼンアミノ酸誘導体を導入したペプチドの光による構造制御
利用光对含有偶氮苯氨基酸衍生物的肽进行结构控制
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
斎藤英雄;林邦彦;植松裕子;川本哲也;窪川直毅;藤原 徹;Akihiro Yoshida;坂口 和靖;鎌田 瑠泉;中馬 吉郎;野村 尚生;鎌田 瑠泉 - 通讯作者:
鎌田 瑠泉
坂口 和靖的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('坂口 和靖', 18)}}的其他基金
リボソームRNA潜在性ORF由来機能性ポリペプチドによる細菌の生存危機防御機構
源自核糖体RNA潜在ORF的功能性多肽的细菌生存防御机制
- 批准号:
23K26791 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Novel mechanisms in the acquisition of bacterial antibiotics resistance
细菌抗生素耐药性获得的新机制
- 批准号:
23K17966 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Serious stress resistance mechanism by functional polypeptides encoded by latent ORFs in bacterial ribosomal RNA.
细菌核糖体 RNA 中潜在 ORF 编码的功能性多肽的严重应激抵抗机制。
- 批准号:
23H02098 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development of a novel genome editing method through transient arrest control of the tumor suppressor protein p53
通过肿瘤抑制蛋白 p53 的瞬时抑制控制开发新型基因组编辑方法
- 批准号:
20H02873 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
がん抑制タンパク質p53の四量体形成ドメインのフォールディング
肿瘤抑制蛋白 p53 四聚化结构域的折叠
- 批准号:
16041202 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
酸化ストレス解析のための特異的モノクローナル抗体作製法の開発
开发用于氧化应激分析的特异性单克隆抗体生产方法
- 批准号:
15651100 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
p53誘導性ホスファターゼWip1の局在化とSH3蛋白質を介した細胞周期の制御
p53 诱导的磷酸酶 Wip1 的定位和通过 SH3 蛋白控制细胞周期
- 批准号:
13214079 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
p53誘導性ホスファターゼWip1の局在化調節を介した細胞周期の制御機構の解明
阐明p53诱导磷酸酶Wip1定位调节介导的细胞周期控制机制
- 批准号:
12213105 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
相似海外基金
リボソームのユビキチン修飾を介した翻訳停滞の新規制御機構
核糖体泛素修饰介导的翻译停滞的新型控制机制
- 批准号:
24KJ0673 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ウイルス感染症におけるリボソーム翻訳品質管理機構を理解する
了解病毒感染中核糖体翻译质量控制机制
- 批准号:
24K09364 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
小胞体膜上リボソーム特有の翻訳品質管理の分子機構の解明
阐明内质网膜核糖体特异性翻译质量控制的分子机制
- 批准号:
24KJ0895 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
リボソームの不均一性から生み出される細胞・組織特異的翻訳開始制御機構の解明
阐明核糖体异质性产生的细胞/组织特异性翻译起始控制机制
- 批准号:
23K23813 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
リボソーム恒常性の乱れによって生じるmRNA特異的な翻訳変動の解明
阐明核糖体稳态破坏引起的 mRNA 特异性翻译波动
- 批准号:
23K27106 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
真核リボソームの翻訳終結・再生過程における変則的mRNA翻訳制御機構の解明
阐明真核核糖体翻译终止和再生过程中异常mRNA翻译控制机制
- 批准号:
24K01953 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
酸化ストレスに対するミトコンドリア翻訳停滞解消システムの役割
线粒体翻译失速解决系统在氧化应激反应中的作用
- 批准号:
23K05677 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
環状mRNA・リボソーム・腫瘍増殖因子APPLEによる翻訳開始制御の立体構造解析
环状mRNA、核糖体和肿瘤生长因子APPLE对翻译起始控制的三维结构分析
- 批准号:
23K05674 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
リボソーム恒常性の乱れによって生じるmRNA特異的な翻訳変動の解明
阐明核糖体稳态破坏引起的 mRNA 特异性翻译波动
- 批准号:
23H02413 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
肝臓組織特異的発現遺伝子のサイレント変異で翻訳が停止する新規分子機序
由于肝组织特异性表达基因的沉默突变而停止翻译的新分子机制
- 批准号:
23K18217 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)