权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

DNA三次元構造の動的変化を可視化する蛍光性低分子リガンドの創成

创建荧光小分子配体以可视化三维 DNA 结构的动态变化

基本信息

批准号：
21655060
负责人：
長澤和夫
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Tokyo University of Agriculture and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2010
项目状态：
已结题

项目摘要

細胞内では、転写因子と呼ばれるタンパク質により転写が制御されている。これにより様々なタンパク質が合成され、複雑な生命活動が維持される。しかしごく最近、核酸塩基の特異な3次元構造であるグアニン四重鎖(G4)が「直接的に」遺伝子の転写を制御する、新たな調節機構が提唱された。この転写調節機構の詳細な解析は、新たな生命現象の理解につながる。G4の転写調節機能の解析を行うには、一本鎖G4が持つ特異な3次元構造を普遍的に検出し、かつ通常の二本鎖DNAと区別する手法が必要となる。そこで本研究では、従来法では困難であったG4構造の検出法を開発するため、G4を選択的に認識し安定化する蛍光化合物(蛍光G4リガンド)を有機合成化学的なアプローチにより創製することを計画した。これまでに開発した蛍光G4リガンドを用い、今年度はその機能評価を電気泳動法、蛍光偏光法により行った。その結果、電気泳動法により当該化合物は既知のG4配列(telomere,c-myc,c-kit,bcl-2等)に強力に結合し、一本鎖非G4、二本鎖DNAには全く結合しないことが分かった。さらに蛍光偏光法により評価したところ、当該化合物は既知のG4配列へ解離定数10nMで結合していることも明らかとなった。当該化合物は無細胞系で選択的にG4を検出できることがわかったので、次にこれを用いた細胞内G4の可視化を検討した。すなわち、細胞内のG4の局在部位を確認することを目的に、細胞を当該化合物にて処理し細胞を固定化した後に蛍光像を観察した。その結果、当該化合物は核内に移行していることが明らかとなり、特にrRNAの生合成が行われている核小体に局在が集中していることが明らかとなった。rRNAの生合成はシスプラチン,5-FU等の既存の抗がん剤の標的であることから、今後rDNA上でのG4形成の確認について検討を行う。

Intracellular transcription factors and regulatory factors This is the first time that we've seen this. Recently, the special three-dimensional structure of nucleic acid base has been developed. The four-fold lock (G4) has been developed as a "direct" genetic control mechanism. The detailed analysis of the regulating mechanism of this article is related to the understanding of life phenomena. The analysis of G4's writing adjustment function is necessary for the unique three-dimensional structure of G4 and the common two-dimensional DNA difference. In this study, we have developed a new method for the identification of G4 structures and the identification of stable photo-compounds (photo-G4) in organic synthetic chemistry. This is the first time that the light source G4 has been used. This year, the function evaluation method is the electrokinetic method and the light polarization method. The results showed that the compound strongly binds to known G4 sequences (telomere,c-myc,c-kit,bcl-2, etc.), and binds to G4 and bi-lock DNA. When the compound is dissociated from the known G4 ligand at 10nM, it will bind to the target molecule. When the compound is used in cell line selection, G4 is visualized. The position of G4 in the cell was confirmed by the optical imaging after the treatment of the compound. As a result, when the compound moves within the nucleus, it is concentrated in the nucleosome. rRNA gene synthesis, 5-FU and other existing anti-DNA targets, future rDNA gene G4 formation confirmation