Molecular cytogenetic studies on the process of genomic and chromosomal reorganization in amphibians and reptiles
两栖类和爬行类基因组和染色体重组过程的分子细胞遗传学研究
基本信息
- 批准号:22370081
- 负责人:
- 金额:$ 11.81万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2010
- 资助国家:日本
- 起止时间:2010-04-01 至 2013-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
To delineate the process of genomic and karyotypic evolution of tetrapods, we constructed comparative cytogenetic maps of Pelodiscus sinensis, Crocodylus siamensis, Elaphe quadrivirgata, Varanus salvator, Xenopus tropicalis, and Xenopus laevis. Our results provide the possibility that the ancestral karyotype of tetrapods had at least 10 large linkage groups of macrochromosomes and many microchromosomal pairs, which have been conserved in the chicken. We identified all nine homoeologous chromosome groups of X laevis, which were homologous within the same groups except for two inversions, and the genetic linkages were highly conserved between X. tropicalis and X. laevis except for one fusion and one inversion. In E. quadrivirgata, microchromosomal genes showed significantly higher GC content than macrochromosomal genes as in the chicken, suggesting that the chromosome size-dependent GC heterogeneity had already occurred before the lepidosaur-archosaur split, 275 million years ago.
为了描述四足动物的基因组和核型进化过程,我们构建了中华泥鳅(Pelodiscus sinensis)、siamensis、Elaphe quadrivirgata、Varanus salvator、Xenopus tropicalis和Xenopus laevis的细胞遗传学比较图谱。我们的结果提供了四足动物祖先的核型可能至少有10个大连锁群的大染色体和许多微染色体对,这在鸡中是保守的。我们鉴定出9个同源染色体群,除2个倒位外,其余9个同源染色体群在同一群内均为同源染色体群;除1个融合和1个倒位外,热带褐毛大蠊与褐毛大蠊的遗传联系高度保守。在四角龙中,微染色体基因的GC含量明显高于鸡的大染色体基因,这表明染色体大小依赖的GC异质性早在2.75亿年前鳞龙-祖龙分裂之前就已经发生了。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
核型進化が語るもの-マイクロ染色体とゲノム構造の区画化-
核型进化告诉我们什么 - 微染色体和基因组结构的划分 -
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Fujishima;Masahiro;松田洋一
- 通讯作者:松田洋一
Comparative genomics : tracking chromosomal evolution in vertebrates
比较基因组学:追踪脊椎动物的染色体进化
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:表迫竜也;西野敦雄;西田宏記;Tanaka Kenya;Matsuda Y
- 通讯作者:Matsuda Y
Infertility associated with meiotic failure in the tremor rat (tm/tm) is caused by the deletion of spermatogenesis associated 22.
- DOI:10.1538/expanim.62.219
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:2.4
- 作者:Ishishita S;Inui T;Matsuda Y;Serikawa T;Kitada K
- 通讯作者:Kitada K
Dynamics of karyotypic evolution in squamate reptiles inferred comparative gene mapping
有鳞爬行动物核型进化动态推断比较基因图谱
- DOI:
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Srikulnath K;Matsubara K;Uno Y;Nishida C;Matsuda Y
- 通讯作者:Matsuda Y
ヘビ類のゲノム・染色体構造とその進化-四肢動物の比較ゲノム学の視点から-
蛇的基因组/染色体结构及其进化——从四足动物比较基因组学的角度——
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:児玉有紀;藤島政博;松田洋一;Hiroki Nishida;近藤滋;松田洋一
- 通讯作者:松田洋一
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
MATSUDA Yoichi其他文献
MATSUDA Yoichi的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('MATSUDA Yoichi', 18)}}的其他基金
The theoretical and substancial study of hindrance(resistance) factor in organizational change of business
企业组织变革阻碍(阻力)因素的理论与实证研究
- 批准号:
23530472 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
experience of myringoplasty using autologous fibrin membrane and platelet rich plasma.
使用自体纤维蛋白膜和富含血小板的血浆进行鼓膜成形术的经验。
- 批准号:
21791657 - 财政年份:2009
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Study in effects that the company's organization structure and human resource management policies and programs have on employee's will and behavior .change
研究公司的组织结构和人力资源管理政策和方案对员工意愿和行为变化的影响
- 批准号:
17530285 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Molecular cytogenetic studies on the evolution of genome structure in reptiles and birds.
爬行动物和鸟类基因组结构进化的分子细胞遗传学研究。
- 批准号:
15370001 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Construction of the chromosome map of hamster and Suncus by FISH using human and mouse cDNA clones
使用人和小鼠 cDNA 克隆通过 FISH 构建仓鼠和 Suncus 染色体图谱
- 批准号:
09680829 - 财政年份:1997
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Comparative genome mapping of experimental animals by FISH
通过 FISH 对实验动物进行比较基因组作图
- 批准号:
07680926 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Genetic mechanism in hybrid sterility of the mouse
小鼠杂交不育的遗传机制
- 批准号:
05680746 - 财政年份:1993
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
相似海外基金
微小消化管内容物化石に基づく中生代海生爬虫類の食性と進化・絶滅要因の解明
基于微胃肠内容物化石阐明中生代海洋爬行动物的摄食习性和进化/灭绝因素
- 批准号:
24K07205 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
爬虫類前障の細分化とその機能解析
爬行动物屏状体的细分及其功能分析
- 批准号:
24K18155 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
中生代海棲爬虫類の尾部軟組織復元と機能形態学的解析に基づく水棲適応史の解明
基于尾部软组织重建和功能形态分析阐明中生代海洋爬行动物水生适应史
- 批准号:
22KJ0863 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
化石爬虫類の古生態を復元する新指標の構築:現生種の感覚器及び脳形態の定量解析
重建爬行动物化石古生态新指标的构建:现存物种感觉器官和大脑形态的定量分析
- 批准号:
22KJ3170 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
爬虫類を活用した冬眠の神経科学的・分子生物学的な基盤の確立
利用爬行动物建立冬眠的神经科学和分子生物学基础
- 批准号:
23KJ0055 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
爬虫類・鳥類の海洋進出を可能にした最重要形質、塩類腺の獲得機構解明
阐明获得盐腺的机制,盐腺是爬行动物和鸟类向海洋扩张的最重要特征
- 批准号:
23KJ1978 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ソメワケササクレヤモリを用いた爬虫類初の性決定遺伝子の同定
使用 Somewakesasakure 壁虎鉴定爬行动物中第一个性别决定基因
- 批准号:
18K06362 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
哺乳類から爬虫類まで100%保存された、5’非翻訳領域由来タンパク質の機能解明
阐明源自 5 非翻译区的蛋白质的功能,这些蛋白质从哺乳动物到爬行动物 100% 保守
- 批准号:
16J08765 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
爬虫類の温度依存型性決定を制御する生体内シグナル因子の探索
寻找控制爬行动物温度依赖性性别决定的体内信号因子
- 批准号:
16H07423 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
現生動物の解剖学的解析に基づく化石爬虫類の視覚機能及び潜水深度の復元
基于现代动物解剖分析的化石爬行动物视觉功能和潜水深度重建
- 批准号:
15J10919 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 11.81万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows