Functional analysis on endogenous pararetrovirus in rice genome-relationship with rice tungro disease-

水稻基因组内源性副逆转录病毒功能分析--与水稻东格罗病的关系--

• 批准号: 22380001
• 负责人: KISHIMA Yuji
• 金额: $ 12.23万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22380001/
• 关键词: イネ; ゲノム科学; 耐病性; ツングロ病; RTBV; ERTBV; グラベリマ種; ウイルス抵抗性; qTDR5; イネツングロ病; ジャポニカ; インディカ; Oryza glaberrima; AT連続配列

We have addressed two questions as to endogenous RTBV; theinsertion mechanism of ERTBV into rice genome and the relationship between ERTBVand RTBV resistance. ERTBVs are preferentially present in AT-rich repeats in ricegenome, and we described that AT-rich repeats have integrated chromosomal andepisomal DNAs, which would have been suspended in the nucleus. We also identified atolerance allele against RTBV, qTDR5, located on chromosome 5 by the genetic analysesusing the progenies between an African rice strain Oryza glaberrima WK18 and a japonicarice strain Taichung 65. The region in qTDR5 contains an ERTBV sequence.

我们已经解决了有关内源 RTBV 的两个问题； ERTBV插入水稻基因组的机制及ERTBV与RTBV抗性的关系。 ERTBV 优先存在于水稻基因组中富含 AT 的重复序列中，我们描述了富含 AT 的重复序列整合了染色体和附加体 DNA，这些 DNA 会悬浮在细胞核中。我们还通过使用非洲稻株Oryza glaberrima WK18和粳稻株Taichung 65之间的后代进行遗传分析，鉴定了针对RTBV的不耐受等位基因qTDR5，该等位基因位于5号染色体上。qTDR5中的区域包含ERTBV序列。

项目成果

Transcriptions of repeat sequences at boot stage in rice anther and its expression changes induced by low-temperature.

水稻花药启动期重复序列的转录及其低温诱导的表达变化

• 发表时间: 2011
• 作者: Seiya Ishiguro;Yutaka Sato and Yuji Kishima
• 通讯作者: Yutaka Sato and Yuji Kishima

The structural properties of endogenous rice tungro bacilliform virus sequences in the rice genome.

水稻基因组中内源水稻东格罗杆状病毒序列的结构特性。

• 发表时间: 2010
• 作者: Ruifang Liu;Kanako O. Koyanagi and Yuji Kishima
• 通讯作者: Kanako O. Koyanagi and Yuji Kishima

イネゲノム反復配列の発現パターンから見た雄性生殖器官の特徴化

基于水稻基因组重复序列表达模式的雄性生殖器官表征

• 作者: Toriyama K;Kazama T;貴島祐治，石黒聖也，太田雄也，佐藤裕
• 通讯作者: 貴島祐治，石黒聖也，太田雄也，佐藤裕

イネゲノムの反復配列に基づく低温鈍感力の解析

基于水稻基因组重复序列的低温不敏感性分析

• 发表时间: 2013
• 期刊: 日本草地学会誌
• 作者: I H Susilowati;A Yasukouchi;平井啓久・原暢・平井百合子・古賀章彦;石黒聖也
• 通讯作者: 石黒聖也

Temperature-dependent nuclear import of Tam3 transposase in Antirrhinum.

金鱼草中 Tam3 转座酶的温度依赖性核输入。

• 作者: Kaien Fujino;Takashi Ogawa;Tomoko Natsume and Yuji Kishima
• 通讯作者: Tomoko Natsume and Yuji Kishima