Analysis of candidate genes for heterotic QTL discovered from a gene pool of wild mice

野生小鼠基因库中发现的杂种优势QTL候选基因分析

基本信息

  • 批准号:
    22380149
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 10.15万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2010
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2010-04-01 至 2014-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Heterosis was found more than 100 years ago. Since then, it has become a genetic phenomenon essential for animal and plant breeding. However, no causative gene for heterosis has been cloned. I previously discovered a new QTL (quantitative trait locus) for heterosis of body weight from a gene pool of wild mice and I fine-mapped it to a limited chromosomal region by QTL analysis using a congenic mouse strain. In this study, I performed exome analysis, phenotypic analysis and gene-expression analysis using congenic and subcongenic mouse strains developed in previous and present studies. I fine-mapped the body weight QTL to an about 6-Mb genomic region, although its heterotic effect was unfortunately not confirmed in this study. I also revealed that four genes are putative candidate genes for the body weight QTL.
杂种优势在100多年前就被发现了。从那时起,它就成为一种对动植物育种至关重要的遗传现象。然而,目前还没有克隆出杂种优势的致病基因。我之前从野生小鼠的基因库中发现了一个新的体重杂种优势的QTL(数量性状位点),并利用一个同源小鼠品系进行QTL分析,将其精细定位到一个有限的染色体区域。在本研究中,我使用以往和目前研究中开发的顺基因和亚顺基因小鼠品系进行了外显子组分析、表型分析和基因表达分析。我将体重QTL精细定位到约6mb的基因组区域,但遗憾的是,本研究未证实其杂种优势效应。我还揭示了4个基因是体重QTL的候选基因。

项目成果

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会议论文数量(0)
专利数量(0)
Intersubspecific subcongenic mouse strain analysis reveals closely linked QTLs with opposite effects on body weight
  • DOI:
    10.1007/s00335-011-9323-9
  • 发表时间:
    2011-06-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Mollah, Md. Bazlur R.;Ishikawa, Akira
  • 通讯作者:
    Ishikawa, Akira
A wild derived quantitative trait locus on mouse chromosome 2 prevents obesity
小鼠 2 号染色体上的野生数量性状基因座可预防肥胖
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Mollah;Md. B. R.、Ishikawa;A
  • 通讯作者:
    A
Improved mapping of a body weight QTL on mouse chromosome 2 discovered from wild Mus musculus castaneus
从野生小家鼠中发现的小鼠 2 号染色体上体重 QTL 的改进图谱
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ishikawa;A.、Okuno;S
  • 通讯作者:
    S
マウス白色脂肪組織重量QTLのファインマッピングと家畜相同染色体領域
小鼠白色脂肪组织重量QTL和家畜同源染色体区域的精细定位
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    石川明;モハンマドバズルラハマンモラ
  • 通讯作者:
    モハンマドバズルラハマンモラ
Improved mapping of a body weight QTL on mouse chromosome 2 discovered from wild Mus musculus castaneus.
从野生小家鼠中发现的小鼠 2 号染色体上体重 QTL 的改进图谱。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ishikawa;A. and Okuno;S.
  • 通讯作者:
    S.
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    0
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    SANO Takashi;TEJADA Maria Luisa G.;NAKANISHI Masao;HANYU Takeshi;MIURA Seiichi;SUETSUGU Daisuke;TONEGAWA Takashi;ISHIKAWA Akira;SHIMIZU Kenji;SHIMIZU Shoka;神田 径・丹保俊哉
  • 通讯作者:
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    $ 10.15万
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  • 资助金额:
    $ 10.15万
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  • 批准号:
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  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 10.15万
  • 项目类别:
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知道了