Development of method to extract drug effect by state space model
Development of method to extract drug effect by state space model
状态空间模型提取药效方法的研制
批准号：
22700308
负责人：
YAMAGUCHI Rui
金额：
$2.33万
依托单位：
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2011
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英文摘要
We have developed a methodology based on state-space modeling to extract dynamic drug-effect profile on cellular system from time-course gene expression data taken from cells stimulated by a drug.
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Estimation of dynamic drug effects on gene modules from time-course transcriptome data by using state-space model
使用状态空间模型从时程转录组数据估计药物对基因模块的动态影响
使用状态空间模型从时程转录组数据估计药物对基因模块的动态影响
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Rui Yamaguchi, 他]
通讯作者：
他
動的予測による遺伝子間制御関係の異常探索
使用动态预测探索基因之间调控关系的异常
使用动态预测探索基因之间调控关系的异常
DOI：
--
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
--
作者：
[佐藤健吾, 加藤有己, 浅井潔, 阿久津達也, 久保田浩行, 柳川堯,荒木由布子, 佐藤健吾, Zhuang J., Narazaki K, 山口類]
通讯作者：
山口類
Sign: large-scale gene network estimation environment for high performance computing.
标志：用于高性能计算的大规模基因网络估计环境。
标志：用于高性能计算的大规模基因网络估计环境。
DOI：
10.11234/gi.25.40
发表时间：
2011
期刊：
Genome informatics. International Conference on Genome Informatics
影响因子：
--
作者：
[Y. Tamada, Teppei Shimamura, R. Yamaguchi, S. Imoto, Masao Nagasaki, S. Miyano]
通讯作者：
S. Miyano
Identification of dissimilarities in high-dimensional gene regulatory systems by predicted discrepancies from state space model
通过状态空间模型预测的差异来识别高维基因调控系统中的差异
通过状态空间模型预测的差异来识别高维基因调控系统中的差异
DOI：
--
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Wang, Q., Jackson, D. D. and Zhuang, J., 荒木由布子, Kato K, Rui Yamaguchi]
通讯作者：
Rui Yamaguchi
Detection of Systematic Differences in Gene Regulations and Extraction of Gene Signatures by Using State Space Model
利用状态空间模型检测基因调控的系统差异并提取基因特征
利用状态空间模型检测基因调控的系统差异并提取基因特征
DOI：
--
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
--
作者：
[廣瀬修一, 花輪孟, 松山泰男, 野口保, Rui Yamaguchi]
通讯作者：
Rui Yamaguchi
共 8 条
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