Construction of predictive algorithm for therapeutic effect and exploration of molecular targets in esophageal cancer by the next-generation integrated genome analysis

新一代整合基因组分析构建食管癌治疗效果预测算法及探索分子靶点

• 批准号: 23390325
• 负责人: IMOTO Issei
• 金额: $ 12.15万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23390325/
• 关键词: 食道癌; ゲノム; エピゲノム; 遺伝子; トランスレーショナルリサーチ; 次世代シーケンサー

In order to make personalized medicine for esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) , omics data were obtained from tumor samples with detailed clinical data in patients with ESCC treated by sufficiently systematized protocols through next generation sequencing- and microarray-based methods, and integrated. Through this approach, we constructed algorisms to perform the estimation of malignancy and prognosis of ESCC using molecular markers. In addition we identified novel candidate genes for a diagnostic, prognostic, prophylactic and/or therapeutic target in ESCC as well as other cancers, indicating our approach to be useful and widely applicable for various types of cancers.

为了对食管鳞状细胞癌（ESCC）进行个性化治疗，通过基于下一代测序和微阵列的方法，从ESCC患者的肿瘤样本中获得了详细的临床数据，并进行了整合。通过这种方法，我们构建了使用分子标记来估计ESCC恶性程度和预后的算法。此外，我们确定了新的候选基因，用于ESCC和其他癌症的诊断、预后、预防和/或治疗靶点，表明我们的方法是有用的，并广泛适用于各种类型的癌症。

项目成果

統合的アレイ解析による肝細胞がんの新規がん抑制遺伝子候補PACAPの同定

通过集成阵列分析鉴定肝细胞癌中的新型抑癌基因候选PACAP

• 发表时间: 2011
• 作者: 村松 聡;他
• 通讯作者: 他

次世代シークエンサー解析により診断したSENDA小児例

通过下一代测序仪分析诊断的 SENDA 儿科病例

• 发表时间: 2013
• 作者: 岡本伸彦;他
• 通讯作者: 他

ゲノムワイドなDNAメチル化解析に基づく非B非C肝癌例の非癌部肝組織におけるDNAメチル化異常の特徴

基于全基因组DNA甲基化分析的非B、非C肝癌非癌肝组织DNA甲基化异常特征

• 发表时间: 2013
• 作者: 宇都宮徹;島田光生;居村暁;森根裕二;池本哲也;金本真美;荒川悠佑;岩橋衆一;齋藤裕;山田眞一郎;石川大地;田嶋敦,
• 通讯作者: 田嶋敦,

機能的スクリーニングとDNA メチル化解析による口腔癌関連新規癌抑制遺伝子型 microRNA の検索

通过功能筛选和DNA甲基化分析寻找与口腔癌相关的新型抑癌基因型microRNA

• 发表时间: 2011
• 作者: 上杉 篤史;他
• 通讯作者: 他

食道癌におけるオートファジー関連遺伝子 ATG7 の不活性化

食管癌中自噬相关基因ATG7的失活

• 发表时间: 2011
• 作者: 小西 博貴;他
• 通讯作者: 他