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Construction of predictive algorithm for therapeutic effect and exploration of molecular targets in esophageal cancer by the next-generation integrated genome analysis

Construction of predictive algorithm for therapeutic effect and exploration of molecular targets in esophageal cancer by the next-generation integrated genome analysis
新一代整合基因组分析构建食管癌治疗效果预测算法及探索分子靶点
批准号：
23390325
负责人：
IMOTO Issei
金额：
$12.15万
依托单位：
The University of Tokushima
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2011-04-01 至 2014-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23390325/
关键词：
食道癌ゲノムエピゲノム遺伝子トランスレーショナルリサーチ次世代シーケンサー

项目摘要

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In order to make personalized medicine for esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) , omics data were obtained from tumor samples with detailed clinical data in patients with ESCC treated by sufficiently systematized protocols through next generation sequencing- and microarray-based methods, and integrated. Through this approach, we constructed algorisms to perform the estimation of malignancy and prognosis of ESCC using molecular markers. In addition we identified novel candidate genes for a diagnostic, prognostic, prophylactic and/or therapeutic target in ESCC as well as other cancers, indicating our approach to be useful and widely applicable for various types of cancers.
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会议论文
統合的アレイ解析による肝細胞がんの新規がん抑制遺伝子候補PACAPの同定
通过集成阵列分析鉴定肝细胞癌中的新型抑癌基因候选PACAP
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [村松 聡, 他]
通讯作者： 他
次世代シークエンサー解析により診断したSENDA小児例
通过下一代测序仪分析诊断的 SENDA 儿科病例
DOI： --
发表时间： 2013
期刊：
影响因子： --
作者： [岡本伸彦, 他]
通讯作者： 他
ゲノムワイドなDNAメチル化解析に基づく非B非C肝癌例の非癌部肝組織におけるDNAメチル化異常の特徴
基于全基因组DNA甲基化分析的非B、非C肝癌非癌肝组织DNA甲基化异常特征
DOI： --
发表时间： 2013
期刊：
影响因子： --
作者： [宇都宮徹, 島田光生, 居村暁, 森根裕二, 池本哲也, 金本真美, 荒川悠佑, 岩橋衆一, 齋藤裕, 山田眞一郎, 石川大地, 田嶋敦,]
通讯作者： 田嶋敦,
機能的スクリーニングとDNA メチル化解析による口腔癌関連新規癌抑制遺伝子型 microRNA の検索
通过功能筛选和DNA甲基化分析寻找与口腔癌相关的新型抑癌基因型microRNA
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [上杉 篤史, 他]
通讯作者： 他
共 33 条
    Characterization of the esophageal carcinogenesis-promoting molecular switch existing inside the isoform of RNA-binding protein
    • 批准号：
      16K15618
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.16万
    • 财政年份：
      2016
    • 负责人：
      IMOTO Issei
    • 依托单位：
      The University of Tokushima
    Optimization of therapeutic strategy for esophageal squamous cell carcinoma based on modeling of intratumoral heterogeneity using omics data and genome editing
    • 批准号：
      26293304
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $10.23万
    • 财政年份：
      2014
    • 负责人：
      IMOTO Issei
    • 依托单位：
      The University of Tokushima
    Molecular genetic analysis of atherosclerosis and atrial thrombosis rat model spontaneously induced by hypoactivity
    • 批准号：
      25560368
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.5万
    • 财政年份：
      2013
    • 负责人：
      IMOTO Issei
    • 依托单位：
      The University of Tokushima
    Construction of systematic tools forgenome analysesto determinegenes responsible for various disease model in rats
    • 批准号：
      24650238
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.5万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      IMOTO Issei
    • 依托单位：
      The University of Tokushima
    海外基金