Rapid screening of gene(s) related to the phenotype of model rats with high levels of voluntarily wheel running activity

高水平自主轮跑活动模型大鼠表型相关基因的快速筛选

• 批准号: 23650406
• 负责人: IMOTO Issei
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23650406/
• 关键词: 高運動習性ラット; ゲノム; 次世代シーケンサー; 連鎖解析

In order to identify gene(s) and molecular pathway(s) possibly related to the phenotype of model rats with high levels of voluntarily wheel running activity(Spontaneously-Running-Tokushima-Shikoku, SPORTS) established from Wistar rats, we established a novel integrated screening system through combining exome sequencing using a next-generation sequencer, linkage analysis, and selection algorithm using genome and polymorphism databases. Through this study, we successfully established a novel screening system for rat genome analysis and identified a set of candidate genes related to the phenotype of SPORTS rats.

为了确定Wistar大鼠自发性跑轮运动（spontantan-runningtokushima - shikoku， SPORTS）模型大鼠表型可能相关的基因和分子通路，我们利用下一代测序仪进行外显子组测序，利用基因组和多态性数据库进行连锁分析和选择算法相结合，建立了一种新的综合筛选系统。通过本研究，我们成功建立了一种新的大鼠基因组分析筛选系统，并鉴定出一组与sport大鼠表型相关的候选基因。

项目成果

徳島大学・大学院ヘルスバイオサイエンス研究部・人類遺伝学

德岛大学 健康生物科学研究生院 人类遗传学

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メディカルサイエンス遺伝子検査学(IV染色体検査法-1染色体分染法-2染色法)

医学基因检测（IV染色体检测法-1染色体分割法-2染色法）

• 发表时间: 2011
• 作者: Uesugi A;et al;井本逸勢
• 通讯作者: 井本逸勢

miR-152 Is a Tumor Suppressor microRNA That Is Silenced by DNA Hypermethylation in Endometrial Cancer

• DOI: 10.1158/0008-5472.can-11-0364
• 发表时间: 2011-10-15
• 期刊: CANCER RESEARCH
• 影响因子: 11.2
• 作者: Tsuruta, Tomohiko;Kozaki, Ken-ichi;Inazawa, Johji
• 通讯作者: Inazawa, Johji

HECT-type Ubiquitin Ligase ITCH Targets Lysosomal-associated Protein Multispanning Transmembrane 5 (LAPTM5) and Prevents LAPTM5-mediated Cell Death

• DOI: 10.1074/jbc.m111.251694
• 发表时间: 2011-12-23
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Ishihara, Takaya;Inoue, Jun;Inazawa, Johji
• 通讯作者: Inazawa, Johji