Analysis of epigenome and functional RNA in colorectal cancer cells and cancer stem cells

结直肠癌细胞和癌症干细胞的表观基因组和功能RNA分析

• 批准号: 23501261
• 负责人: SUZUKI Hiromu
• 金额: $ 3.24万
• 依托单位: Sapporo Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23501261/
• 关键词: 大腸癌; 癌幹細胞; エピジェネティクス; DNAメチル化; microRNA; メチル化; noncoding RNA

By analyzing epigenome and microRNA expression profiling in colorectal cancer (CRC) cells, we identified a series of epigenetically silenced microRNA genes. We found that DNA methyltransferase 1 (DNMT1) is essential for the maintenance of cancer stem-like cells (CSC)/ cancer initiating cells (CIC), and we also identified microRNA genes which are differentially expressed in CSC/CIC. We carried out genome and epigenome analysis in precursor and malignant lesions in colorectum, and identified aberrant DNA methylation patterns in the premalignant stage. Finally, by performing integrative analysis of molecular, pathological and endoscopic findings of premalignant colorectal lesions, we identified a novel surface microstructure which is specific to the precursor lesions of CpG island methylator phenotype (CIMP)-positive CRC.

通过分析表观基因组和结直肠癌(CRC)细胞中的microRNA表达谱，我们鉴定了一系列表观遗传沉默的microRNA基因。我们发现DNA甲基转移酶1(DNMT1)对于维持肿瘤干细胞(CSC)/肿瘤起始细胞(CIC)是必不可少的，我们还发现了在CSC/CIC中差异表达的microRNA基因。我们对结肠直肠前病变和恶性病变进行了基因组和表观基因组分析，并鉴定了癌前阶段的异常DNA甲基化模式。最后，通过对结直肠癌癌前病变的分子、病理和内窥镜表现进行综合分析，我们发现了一种新的表面微结构，它是CpG岛甲基化表型(CIMP)阳性结直肠癌前体病变的特异性表面微结构。

项目成果

エピゲノム解析による造血器腫瘍の新たな分子標的の同定

通过表观基因组分析鉴定造血肿瘤新分子靶点

• 发表时间: 2011
• 作者: Iimori M;Ozaki K;Chikashige Y;Habu T;Hiraoka Y;Maki T;Hayashi I;Obuse C;Matsumoto T;下野 洋平;豊田実,野島正寛,鈴木拓,丸山玲緒,山本英一郎,甲斐正広,時野隆至,篠村恭久,今井浩三
• 通讯作者: 豊田実,野島正寛,鈴木拓,丸山玲緒,山本英一郎,甲斐正広,時野隆至,篠村恭久,今井浩三

Genomic vulnerability to LINE-1 hypomethylation is a potential determinant of the clinicogenetic features of multiple myeloma.

• DOI: 10.1186/gm402
• 发表时间: 2012
• 期刊: Genome medicine
• 影响因子: 12.3
• 作者: Aoki Y;Nojima M;Suzuki H;Yasui H;Maruyama R;Yamamoto E;Ashida M;Itagaki M;Asaoku H;Ikeda H;Hayashi T;Imai K;Mori M;Tokino T;Ishida T;Toyota M;Shinomura Y
• 通讯作者: Shinomura Y

microRNA遺伝子のメチル化を用いた膀胱癌新規バイオマーカーの開発

利用 microRNA 基因甲基化开发新型膀胱癌生物标志物

• 发表时间: 2013
• 作者: Koga F;Yoshida S;Kobayashi S;Ishii C;Tanaka Hiroshi;Fujii Y;Tanaka Hajime;Masuda H;Saito K;Komai Y;Kawakami S;Kihara K;鈴木 拓
• 通讯作者: 鈴木 拓

腸管洗浄液のメチル化検出による大腸癌診断法の開発

检测肠灌洗液甲基化诊断结直肠癌方法的开发

• 发表时间: 2013
• 作者: Yoshida S;Koga F;Kobayashi S;Ishii C;Tanaka H;Tanaka H;Komai Y;Saito K;Masuda H;Fujii Y;Kawakami S;Kihara K;原田拓,山本英一郎,野島正寛,丸山玲緒,佐藤亜紀子,甲斐正広,山野泰穂,鈴木拓
• 通讯作者: 原田拓,山本英一郎,野島正寛,丸山玲緒,佐藤亜紀子,甲斐正広,山野泰穂,鈴木拓

大腸癌におけるmiRNA遺伝子のエピジェネティックな制御の解析

结直肠癌中miRNA基因的表观遗传调控分析

• 作者: Toshihiro Suzuki;Kiyohito Mizutani;Akihiro Minami*;Kentaro Nobutani;Masato Nagino;Yohei Shimono;Yoshimi Takai;鈴木 拓
• 通讯作者: 鈴木 拓