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Development of photochemical cloning for DNA-binding proteins

DNA 结合蛋白光化学克隆的发展

基本信息

批准号：
23510286
负责人：
SADAKANE Yutaka
金额：
$ 3.49万
依托单位：
Suzuka University of Medical Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2013
项目状态：
已结题

项目摘要

We developed the new method for analysis of DNA-binding proteins, which play the various physiological roles such as transcriptional regulation, using photo-reactive compound, which is able to form the covalent bond by light irradiation. Our photochemical gel-shift assay reveals that octamer DNA binds several proteins of nuclear extract. We further examined the photochemical cloning methods combining with molecular biological technique, phage panning or instrumental analysis of mass spectrometry. We also analyzed expression pattern and fibrillation of cranial nerve disease, which is a target disease for photochemical methods in this study.

我们开发了一种新的方法来分析的DNA结合蛋白，发挥各种生理功能，如转录调控，使用光反应化合物，这是能够形成共价键的光照射。我们的光化学凝胶位移分析表明，八聚体DNA结合几种蛋白质的核提取物。进一步探讨了结合分子生物学技术、噬菌体淘选或质谱分析的光化学克隆方法。我们还分析了脑神经疾病的表达模式和纤颤，这是本研究中光化学方法的目标疾病。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Effects of trace metals on the conformational changes of amyloidogenic proteins and their neurotoxicity

微量金属对淀粉样蛋白构象变化的影响及其神经毒性

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
Biomed. Res.Trace Elements
影响因子：
0
作者：
M. Kawahara;H. Koyama;Y. Sadakane
通讯作者：
Y. Sadakane

PrP106-126の高次構造変化に重要な配列

对 PrP106-126 构象变化重要的序列

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
小山裕也;坂口哲陛;定金豊;川原正博
通讯作者：
川原正博

光反応性糖鎖ミメティックペプチドの合成とレクチン解析への応用

光反应性聚糖模拟肽的合成及其在凝集素分析中的应用

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
定金豊;松下秀峰;山路充宏;大塚功
通讯作者：
大塚功

Determination of rate constants for beta-linkage isomerization of three specific aspartyl residues in recombinant human alpha A-crystallin protein by reversed-phase HPLC

通过反相 HPLC 测定重组人 α A-晶状体蛋白中三个特定天冬氨酰残基的 β-连接异构化速率常数

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
J Chromatogr. B.
影响因子：
0
作者：
Y. Sadakane;N. Fujii;K. Nakagomi
通讯作者：
K. Nakagomi

The effect of the structural differences in the reducing terminus of sugars on the binding affinity of carbohydrates and proteins analyzed using photoaffinity labeling.

使用光亲和标记分析糖还原末端的结构差异对碳水化合物和蛋白质结合亲和力的影响。

DOI：
10.1016/j.bmc.2010.11.067
发表时间：
2011
期刊：
Bioorg Med. Chem.
影响因子：
0
作者：
Isao Ohtsuka;Yutaka Sadakane;Mari Higuchi;Noriyasu Hada;Junko Hada;Nobuko Kakiuchi;Akiyo Sakushima
通讯作者：
Akiyo Sakushima