Analysis of the diversity of fungal endophytes with metagenomics

宏基因组学分析真菌内生菌多样性

• 批准号: 23770083
• 负责人: OSONO Takashi
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23770083/
• 关键词: エンドファイト; メタゲノミクス; 多様性; 林冠生物学; 次世代シーケンサー; 熱帯林; 菌類

The alpha diversity and taxonomic composition of endophytic fungi associated with leaves of six tree species were examined in two lowland tropical forests and a subtropical forest in Asia and Australia, using ITS metabarcoding with Roche 454 pyrosequencing. A total of 95,278 fungal reads were clustered into 224 OTUs at 97% similarity threshold. Of the 178 OTUs identified to the phylum, 148 and 30 OTUs belonged to Ascomycota and Basidiomycota, respectively. Major OTUs were common foliar endophytes and pathogens. The low similarities of endophytic fungal assemblages between leaf samples of a single tree species suggested high beta diversity.

利用Roche 454焦磷酸测序技术，对亚洲和澳大利亚两个低地热带森林和一个亚热带森林的6种树木叶片内生真菌的α多样性和分类组成进行了研究。将总共95，278个真菌读段以97%相似性阈值聚类成224个OTU。在鉴定的178个OTU中，分别有148个和30个OTU属于子囊菌门和担子菌门。主要OTU是常见的叶片内生菌和病原菌。同一树种叶片内生真菌群落的相似性较低，表明其β多样性较高。

项目成果

菌類の生物学

真菌生物学

• 发表时间: 2014
• 作者: Izumi Iwata;Daiske Honda;本多大輔
• 通讯作者: 本多大輔

国内亜熱帯林におけるクロサイワイタケ科内生菌の多様性―気候帯間比較による評価

日本亚热带森林陶瓷科内生真菌多样性：气候带比较评价

• 发表时间: 2011
• 作者: Imae;Y.;Takada;K.;Okada;S.;Ise;Y.;Morii;Y.;Yoshimura;H. & Matsunaga;S.;宮澤清太;池田あんず・広瀬大・松岡俊将・大園享司
• 通讯作者: 池田あんず・広瀬大・松岡俊将・大園享司

Environmental DNA analysis reveals the fungal succession on Camellia japonica leaves and the functioning of ligninolytic endophytes

环境 DNA 分析揭示了山茶花叶子上的真菌演替和木质素内生菌的功能

• 发表时间: 2011
• 作者: Osono T;Hirose D.
• 通讯作者: Hirose D.

Diversity and Ecology of Endophytic and Epiphytic Fungi of Tree Leaves in Japan: A Review

• DOI: 10.1007/978-81-322-1575-2_1
• 发表时间: 2014
• 作者: T. Osono

グラスエンドファイト―その生態と進化

草内生菌 - 其生态学和进化

• 发表时间: 2012
• 作者: Inoue;Y.;Tsubota;H.;Sato;H. & Yamaguchi;T.;木曽 彩子（岡彩子）;飯野隆夫，伊藤公夫，大熊盛也;伊勢優史;大園享司
• 通讯作者: 大園享司