Fermentative production of rare natural compounds found in marine organisms living in the seas of Thailand

泰国海域海洋生物中发现的稀有天然化合物的发酵生产

基本信息

  • 批准号:
    19KK0146
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 11.65万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
  • 财政年份:
    2019
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2019-10-07 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

タイ国の海洋生物から見いだされた、医薬品として上市されている ecteinascidin 743 (ET-743) は、群体ホヤに共生する難培養の微生物によって生産されてい ることが明らかにされてきた。本化合物は現在、天然化合物由来の前駆体から半合成により供給されているが、反応ステップが多く収率が悪いのが問題となって いる。本研究においては、タイ国研究者と協力して、ET-743 の生合成遺伝子クラスターの正確な同定と、培養可能な宿主微生物を用いた異種発現による臨床薬の安定供給の可能性を検証する。さらに近年、ET-743 以外にも renieramycin 等の陸生微生物二次代謝産物には見られないような、特徴的な構造を持つ化合物が、海洋生物より多数見出されている。そのような、タイ国に棲息する海洋生物や植物などの共生細菌に由来する有用化合物の生合成遺伝子クラスターの解明についても、広く共同で進めるものである。今年度は、得られたゲノム配列情報よりETC-743の生合成に関わる全遺伝子クラスターの同定を進めた。これまでに唯一報告されているETC-743の生合成遺伝子は、地理的に離れたカリブ海産のホヤ共生微生物メタゲノムから同定されたものである。解析の結果、一部機能不明な領域が依然として存在し、全領域の同定には至らなかったものの、我々が構築したDNA調製方法およびシーケンス解析手法によって、この既報の共生細菌ゲノム配列に比べて、冗長度の高さおよびエラー率の低さの点で、はるかに高精度の共生細菌のゲノム配列を得ることに成功した。
の タ イ countries Marine か ら see い だ さ れ た, medical 薬 と し て listed さ れ て い る ecteinascidin は (ET - 743), 743 group ホ ヤ に symbiotic す る difficult の microbial に よ っ て production さ れ て い る こ と が Ming ら か に さ れ て き た. This compound は now, before natural compound origin の 駆 か ら semisynthetic に よ り supply さ れ て い る が, anti 応 ス テ ッ プ が more く 収 rate が 悪 い の が problem と な っ て い る. This study に お い て は, タ researchers と イ countries together し て, ET - 743 の biosynthesis heritage 伝 son ク ラ ス タ ー の な right be と, training may be using い な host microbial を た heterogeneous 発 now に よ る clinical 薬 の stable supply possibility の を 検 card す る. さ ら に in recent years, ET - 743 に も renieramycin の terrestrial microbial secondary metabolites such as に は see ら れ な い よ う な, 徴 な structure を hold が つ compounds, Marine よ り most see the さ れ て い る. そ の よ う な, タ に イ countries perched す る Marine や plant な ど の symbiotic bacteria に origin す る の useful compounds biosynthesis heritage 伝 son ク ラ ス タ ー の interpret に つ い て も, hiroo く で together into め る も の で あ る. Our は, ら れ た ゲ ノ ム match column intelligence よ り ETC - 743 の biosynthesis に masato わ る totally survived 伝 ク ラ ス タ ー の with fixed を め た. The only report さ こ れ ま で に れ て い る ETC - 743 の biosynthesis but 伝 は, geographic に from れ た カ リ ブ seafood の ホ ヤ symbiotic microbes メ タ ゲ ノ ム か ら with fixed さ れ た も の で あ る. Parsing の results, a functional が still unknown な field と し の て し, full field with constant に は to ら な か っ た も の の, I 々 が build し た DNA modulation method お よ び シ ー ケ ン ス parsing technique に よ っ て, こ の is submitted to the の symbiotic bacteria ゲ ノ ム match column に than べ て, high degree of lengthy の さ お よ び エ ラ ー rate の low さ の で, は る か に high precision The <s:1> symbiotic bacteria <e:1> ゲノム are combined with を to obtain る る とに successfully た.

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
海洋性難培養微生物が生産する有用物質の異種生産技術に関する研究
海洋难培养微生物产生有用物质的异质生产技术研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    工藤 慧;西田 みち代;酒井 紀子;末永 光;池田 治生;新家 一男
  • 通讯作者:
    新家 一男
Chulalongkorn University(タイ)
朱拉隆功大学(泰国)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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新家 一男其他文献

Screening of inhibitors of p27Kip1 ubiquitination by SCFSkp2 (SCFSkp2による p27Kip1のユビキチン化阻害物質の探索)
SCFSkp2筛选p27Kip1泛素化抑制剂
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    渡辺 信元;新家 一男;長田 裕之
  • 通讯作者:
    長田 裕之
植物内生放線菌由来スピロテトロン酸系抗生物質マクラマイシン生合成遺伝子群の機能解析
源自内生放线菌的螺环酮酸抗生素大霉素生物合成基因的功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Daduang R;木谷 茂;Thamchaipenet A;五十嵐 康弘;新家 一男;池田 治生;仁平 卓也
  • 通讯作者:
    仁平 卓也
プラスミドを利用した二次代謝産物生合成遺伝子クラスター導入法
使用质粒的次级代谢物生物合成基因簇导入方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小松 護;小曽根 郁子;橋本 詢子;新家 一男;片岡 正和;池田 治生
  • 通讯作者:
    池田 治生
癌抑制遺伝子p53活性を増強する新規抗癌剤の創製
创造增强抑癌基因p53活性的新型抗癌药物
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    清水 美来;松本 真悠子;高木 基樹;新家 一男;田沼 靖一;並木 秀男;胡桃坂 仁志;大木 理恵子
  • 通讯作者:
    大木 理恵子
I型ポリケタイド合成酵素の精密改変による次世代天然物化学
通过精确修饰 I 型聚酮合酶实现下一代天然产物化学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    工藤 慧;橋本 拓哉;橋本 絢子;小曽根 郁子;加賀谷 紀貴;上岡麗子;西村 壮央;小松護;末永 光;池田 治生;新家 一男
  • 通讯作者:
    新家 一男

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  • 发表时间:
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Studies on innovative technology for modification of structural skeleton of natural products and production of artificial novel natural compounds
天然产物结构骨架修饰创新技术及人工新型天然化合物生产研究
  • 批准号:
    23H05474
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    2023
  • 资助金额:
    $ 11.65万
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タンパク質相互作用を制御する天然生理活性物質に関する研究
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    07F07627
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    2007
  • 资助金额:
    $ 11.65万
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    13218042
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    1996
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    $ 11.65万
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  • 批准号:
    07760112
  • 财政年份:
    1995
  • 资助金额:
    $ 11.65万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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微生物中枢神经细胞保护物质的探索性研究
  • 批准号:
    06760104
  • 财政年份:
    1994
  • 资助金额:
    $ 11.65万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

海綿に共生する難培養微生物が生産するマンザミンの生合成機構の解明と異種発現生産
阐明与海绵共生的难以培养的微生物产生曼扎胺的生物合成机制和异源表达生产
  • 批准号:
    24K01855
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 11.65万
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シントロフィーな生態から見出す難培養微生物の物質循環への寄与
互养生态学发现难培养微生物对物质循环的贡献
  • 批准号:
    23K13433
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 11.65万
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    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Efficient Search for Bioactive Substances from Difficult-to-Cultivate Microorganisms
从难以培养的微生物中高效寻找生物活性物质
  • 批准号:
    22K06662
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 11.65万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of Heterogeneous Production Technology for Useful Natural Compounds from Difficult-to-Cultivate Microorganisms by Semi-Artificial Gene Clusters
利用半人工基因簇开发难培养微生物异质生产有用天然化合物的技术
  • 批准号:
    21K14798
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 11.65万
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    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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  • 批准号:
    21K14953
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 11.65万
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    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
シングルセル・ゲノミクスによる難培養微生物の機能解明と遺伝子資源化
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  • 批准号:
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  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 11.65万
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植物病原性難培養微生物の培養系・形質転換系の確立
植物病原及难培养微生物培养及转化体系的建立
  • 批准号:
    21658115
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 11.65万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
難培養微生物ゲノムデータベースの構築とその基礎的研究
难培养微生物基因组数据库的构建及基础研究
  • 批准号:
    16710143
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 11.65万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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