定量リン酸化プロテオミクスを用いたバクテリアの病原性シグナルの解明

使用定量磷酸蛋白质组学阐明细菌毒力信号

• 批准号: 12F02078
• 负责人: 石濱 泰
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12F02078/
• 关键词: プロテオーム; リン酸化プロテオーム; バクテリア; シグナル伝達

前年度に確立したバクテリア試料用リン酸化ペプチド濃縮法を用いて大腸菌試料に対し適用したところ、現在までに393種のリン酸化タンパク質、1229種のリン酸化サイトを同定することに成功した。既知のリン酸化情報と比較すると、我々の結果は約10倍のリン酸化プロテオームをカバーしていることになる。セリン・スレオニン・チロシンの比は62.9/24/6.8であり、これは既知のものとほぼ同様であった。他のバクテリアと同様、大腸菌においてもリン酸化は多様な細胞機能(例えば中心炭素代謝系や他の恒常的プロセスに関わっており、その局在も細胞質から細胞膜まで偏りなくあらゆるものを含んでいた。さらに、ゲノムに約7%含まれる必須遺伝子の30%がリン酸化されていた。これらの結果は真核生物と同様にバクテリアでもタンパク質リン酸化は、重要な役割を果たしていることを示唆している。興味深いことにセリン、スレオニンリン酸化がphosphotransferase (PTS)やtwo-component systemなどの今までHis, Cys, Aspのリン酸化が関与しているとされていたシステムでも見出された。これらのリン酸化は、様々な環境条件に対処するために、真核生物のような別個のタンパク質リン酸化システムと協同している可能性も考えられる。大腸菌以外のバクテリアとしてグラム陽性菌であるB. subtilisとグラム陰性菌であるK. pneumoniaeに対して本法を適用した。B. subtilisからは443リン酸化ペプチド(175リン酸化タンパク質)、246リン酸化サイトが、K. pneumoniae試料からは673リン酸化ペプチド(286リン酸化タンパク質)、379リン酸化サイトが同定された。

In the past year, the concentration method for Escherichia coli samples was established. Now, 393 kinds of Escherichia coli samples were successfully determined. The results of the comparison between the known acidification information and the original acidification information are about 10 times that of the original acidification information. The ratio of the two is 62.9/24/6.8. He is a member of the same group, and the Escherichia coli is a member of the same group. The Escherichia coli is a member of the same group, and the Escherichia coli is a member of the same group. About 7% of the samples contain essential components and 30% of the samples are acidified. The result is that eukaryotes and eukaryotes are different in nature, and important in nature. In this paper, the author discusses the relationship between phosphotransferase (PTS) and two-component system, and discusses the relationship between His, Cys, Asp and PTS. The possibility of co-ordination between different species of eukaryotes and different environmental conditions is examined. B. positive bacteria other than Escherichia coli subtilis-negative bacteria K. pneumoniae, and this law applies. B. subtilis443, 175, 246, K. pneumonitis sample from 673 to 286, and from 379 to 389.

项目成果

Enhanced Phosphopeptide Identification in Bacteria by Stepwise Hydroxy Acid-Modified Metal Oxide Chromatography with Elevated Sample Loading Capacity

通过提高样品上样量的逐步羟基酸修饰金属氧化物色谱法增强细菌中磷酸肽的鉴定

• 发表时间: 2013
• 作者: M. -H. Lin;S. Takagi;M. Wakabayashi;N. Sugiyama;Y. Ishihama
• 通讯作者: Y. Ishihama

Pyruvate Phosphate Dikinase Phosphorylation Increases LipidProduction in Rhodopseudomonas palustris: a Phosphoproteomic Analysis

丙酮酸磷酸二激酶磷酸化增加沼泽红假单胞菌的脂质产生：磷酸蛋白质组学分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Lin;M. H.; Hu;C. W.; Huang;H. C.; Ku;W. C.; Yi;T. H.; Tsai;C. F.; Chen;Y. J.; Sugiyama;N.; lshihama;Y.;、Juan;H. F.; Wu;S. H
• 通讯作者: S. H

Enhanced Phosphopeptide Identification in Escherichia Coli by Stepwise Hydroxy Acid-Modified Metal Oxide Chromatography with Elevated Sample Loading Capacity

通过提高样品装载量的逐步羟基酸修饰金属氧化物色谱法增强大肠杆菌中磷酸肽的鉴定

• 发表时间: 2013
• 作者: M. -H. Lin;S. Takagi;M. Wakabayashi;N. Sugiyama;Y. Ishihama
• 通讯作者: Y. Ishihama

Phosphoproteomic Analysis of Rhodopseudomonas palustris Reveals the Role of Pyruvate Phosphate Dikinase Phosphorylation in Lipid Production

• DOI: 10.1021/pr300582p
• 发表时间: 2012-11-01
• 期刊: JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
• 影响因子: 4.4
• 作者: Hu, Chia-Wei;Lin, Miao-Hsia;Wu, Shih-Hsiung
• 通讯作者: Wu, Shih-Hsiung