Developing stress-adapted crop by domesticating wild Vigna species

通过驯化野生荠菜品种开发抗逆作物

• 批准号: 23688002
• 负责人: NAITO Ken
• 金额: $ 17.14万
• 依托单位: National Institute of Agrobiological Sciences
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23688002/
• 关键词: Vigna属; ゲノム; 遺伝学; 栽培化; 環境ストレス; 突然変異; 育種; 遺伝資源; 遺伝; アズキ; QTL

To develop DNA markers, we sequence Azuki bean genome by next generation sequencer. The assembled sequences covered more than 90 % of the genome.With the genome sequence information, we fin-mapped the mapping population derived from Vigna species. We identified two useful genes, mog and ptw. The mog gene makes the seed size doubled, while the ptw gene controls seed pod twisting, which is related to seed pod dehiscence.We also tried to screen EMS-treated M2 population of V. stiplucacea, which is pests and diseases resistant. As a result, we found 5 lines with bigger seed size and one line with non-seed pod dehiscence. With all these results, we considered domestication of wild Vigna species is a quick and practical approach to develop a stress-tolerant crop.

为了开发DNA标记，我们利用下一代测序仪对红豆基因组进行测序。组装的序列覆盖了90%以上的基因组。利用基因组序列信息，对Vigna种群进行了定位。我们发现了两个有用的基因，mog和ptw。mog基因使种子大小增加一倍，ptw基因控制种荚扭转，与种荚开裂有关。我们还尝试筛选ems处理的抗病虫害刺槐M2群体。结果发现5个品系种子大小较大，1个品系种子荚不开裂。综上所述，我们认为驯化野生野葡萄是一种快速而实用的培育抗胁迫作物的方法。

项目成果

アズキのオルガネラゲノム

小豆细胞器基因组

• 发表时间: 2012
• 作者: Matsumoto CS;Shidara H;Matsuda K;Nakamura T;Mito T;Matsumoto Y;Oka K;Ogawa H;内藤健
• 通讯作者: 内藤健

Agriculture : Feeding the future

农业：养活未来

• 发表时间: 2013
• 期刊: Nature
• 影响因子: 64.8
• 作者: Koichi Matsuo;Hirofumi Namatame;Masaki Taniguchi;Kunihiko Gekko;千原 崇裕;佐藤美由紀;松尾光一，生天目博文，谷口雅樹，月向邦彦;Susan McCouch and Ken Naito et al
• 通讯作者: Susan McCouch and Ken Naito et al

Vigna属野生種のNeo-Domesticationを目指した栽培化遺伝子のファインマッピング

豌豆属野生物种新驯化驯化基因的精细定位

• 发表时间: 2011
• 作者: 松田涼;他;内藤健,加賀秋人,磯部祥子,白澤健太,平川英樹,田畑哲之,友岡憲彦
• 通讯作者: 内藤健,加賀秋人,磯部祥子,白澤健太,平川英樹,田畑哲之,友岡憲彦

De novo assembly of the complete organelle genome sequences of azuki bean (Vigna angularis) using next-generation sequencers.

• DOI: 10.1270/jsbbs.63.176
• 发表时间: 2013-06
• 期刊: Breeding science
• 影响因子: 2.4
• 作者: Naito K;Kaga A;Tomooka N;Kawase M
• 通讯作者: Kawase M

The Vigna Genome Project

维尼亚基因组计划

• 发表时间: 2014
• 作者: Hiroaki Sakai;Ken Naito;Eri Ogiso;Akito Kaga;Takeshi Itoh and Norihiko Tomooka
• 通讯作者: Takeshi Itoh and Norihiko Tomooka