末梢血におけるアルツハイマー病脳関連遺伝子のエピジェネティック・遺伝子発現解析

外周血中阿尔茨海默病脑相关基因的表观遗传学和基因表达分析

• 批准号: 24510275
• 负责人: 宮下 哲典
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: Niigata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24510275/
• 关键词: アルツハイマー病; タウ; バイオマーカー; 死後脳; 遺伝子発現; トランスクリプトーム

ヒト脳疾患の進展を末梢血のエピゲノムやトランスクリプトームの変化として捉えられるか？本研究プロジェクトではアルツハイマ ー病（AD）の抹消血に着目し、特定遺伝子のエピジェネティックな変化と遺伝子発現の変動を調べることを目的とする。これまでに行ったヒト死後脳の遺伝子発現データを用いて、ADに特徴的な脳病変である「神経原線維変化（NFT）」の進展と関連する遺伝子群を同定する。その中から遺伝子を選抜し、DNAのシトシンメチル化レベル（5-mC）と遺伝子発現レベルを解析する。ADの進行が末梢血の変化に反映されていれば、侵襲度の低いバイオマーカーとしての可能性が期待でき、研究の更なる展開につながると考えられる 。平成25年度はヒト死後脳（村山繁雄博士提供）の嗅内野、側頭葉、前頭葉に由来する全RNAを用いたエクソンアレイデータ（Affymetrix社）から、NFTの進展（Braak NFTステージ分類）と関連するNFT関連遺伝子を同定し論文化した（印刷中）。一部のNFT関連遺伝子についてはTaqMan法による定量的リア ルタイムPCR（qPCR）によって再現性を確認した。各遺伝子の機能や末梢血での発現量をデータベースで検索し、精査した 上でさらに遺伝子を絞り込み、本研究プロジェクトの解析対象遺伝子として限定した（宮下・中谷・桑野・池内）。臨床被検体のリクルート は新潟大学病院の物忘れ外来で実施し、採血はインフォームド・コンセントを経て行った（池内）。その際、統計解析に必要な臨床情報（認知機能テスト情報など）も合わせて取得した（池内）。血液から全RNAを抽出し、qPCRによって遺伝子発現量を定量した（宮下）。NFT関連遺伝子として同定された遺伝子は末梢血で発現しているのか？脳と末梢血の間で遺伝子発現量に相関はあるか？また、エピジェネティックな変化はどうか？などが今後の解析課題である。

の ヒ ト の 脳 disease progress を peripheral blood エ ピ ゲ ノ ム や ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム の variations change と し て catch え ら れ る か? This study プ ロ ジ ェ ク ト で は ア ル ツ ハ イ マ ー disease (AD) の erase traces of blood に mesh し, specific 伝 son の エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ッ ク な variations change と heritage 伝 son 発 の now - motion を べ る こ と を purpose と す る. Line こ れ ま で に っ た ヒ ト died 脳 の heritage 伝 son 発 now デ ー タ を with い て, AD に 徴 of な 脳 disease - で あ る "god 経 original line d - (NFT)" の progress と masato even す る heritage 伝 subgroup を be す る. In そ の か ら heritage 伝 を choose sorting し, DNA の シ ト シ ン メ チ ル change レ ベ ル (5 - mC) と heritage 伝 son 発 now レ ベ ル を parsing す る. AD の is の が peripheral blood - the に reflect さ れ て い れ ば, low degree of invasion の い バ イ オ マ ー カ ー と し て の possibility が expect で き, research more な の る expand に つ な が る と exam え ら れ る. Pp.47-53 25 year は ヒ ト 脳 after death (tomiichi) Dr Shigeo の olfactory infield front, side head leaves, leaf に origin す る RNA を filled with い た エ ク ソ ン ア レ イ デ ー タ (Affymetrix) か ら, NFT の progress (Braak NFTステ ステ ジ ジ category と related するNFT Related Relics 伝 child を monograph on culture た (in print). A の NFT masato even heritage 伝 son に つ い て は TaqMan method に よ る quantitative リ ア ル タ イ ム PCR (qPCR) に よ っ て reproducibility を confirm し た. Function of the heritage 伝 son の で や peripheral blood の 発 now quantity を デ ー タ ベ ー ス で 検 cable し, fine し た on で さ ら に heritage 伝 son を ground り 込 み, this study プ ロ ジ ェ ク ト の parsing as heritage seaborne 伝 son と し て qualified し た (palace, in the valley, kuwano, pool). Is clinical 検 body の リ ク ル ー ト は niigata university hospital の thing forget れ foreign で be し, blood は イ ン フ ォ ー ム ド · コ ン セ ン ト を 経 て line っ た (pool). Youdaoplaceholder0 そ and statistically analyze に necessary な clinical information (cognitive function テスト information な た) and combine わせて to obtain た た (in the pool). Blood ら ら total RNAを extraction <s:1>, qPCRによって 伝 particle output を quantification た た (under the uterus). Nft-related legacy 伝 seed と て て the same された legacy 伝 seed る peripheral blood で occurrence て 伝 る る る る 伝? Is the amount of で residual 伝 between 脳と peripheral blood vessels に related to 脳と ある ある に? Youdaoplaceholder0, エピジェネティッ な な change to エピジェネティッ う う? Youdaoplaceholder0 が が in the future, な will analyze the subject である.

项目成果

新潟大学脳研究所遺伝子機能解析学分野・生命情報工学分野のHP

新泻大学脑研究所基因功能分析部/生物信息工学部HP

アルツハイマー病のコピー数多型解析（Copy number variation analysis of Alzheimer's disease）.

阿尔茨海默病的拷贝数变异分析。

• 发表时间: 2012
• 作者: 中谷明弘;宮下哲典;西田奈央;徳永勝士;井原康夫;桑野良三（Akihiro Nakaya;Akinori Miyashita;Nao Nishida;Katsusi Tokunaga;Yasuo Ihara;Ryozo Kuwano）.
• 通讯作者: Ryozo Kuwano）.

Gene expression analysis in the postmortem brains classified by Braak NFT-SP staging.

根据 Braak NFT-SP 分期对死后大脑进行基因表达分析。

• 发表时间: 2012
• 作者: Miyashita A;Saito Y;Hatsuta H;Tsukie T;Nakaya A;Murayama S;Ihara Y;Kuwano R.
• 通讯作者: Kuwano R.

SORL1 is genetically associated with late-onset Alzheimer's disease in Japanese, Koreans and Caucasians.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0058618
• 发表时间: 2013
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Miyashita A;Koike A;Jun G;Wang LS;Takahashi S;Matsubara E;Kawarabayashi T;Shoji M;Tomita N;Arai H;Asada T;Harigaya Y;Ikeda M;Amari M;Hanyu H;Higuchi S;Ikeuchi T;Nishizawa M;Suga M;Kawase Y;Akatsu H;Kosaka K;Yamamoto T;Imagawa M;Hamaguchi T;Yamada M;Morihara T;Takeda M;Takao T;Nakata K;Fujisawa Y;Sasaki K;Watanabe K;Nakashima K;Urakami K;Ooya T;Takahashi M;Yuzuriha T;Serikawa K;Yoshimoto S;Nakagawa R;Kim JW;Ki CS;Won HH;Na DL;Seo SW;Mook-Jung I;Alzheimer Disease Genetics Consortium;St George-Hyslop P;Mayeux R;Haines JL;Pericak-Vance MA;Yoshida M;Nishida N;Tokunaga K;Yamamoto K;Tsuji S;Kanazawa I;Ihara Y;Schellenberg GD;Farrer LA;Kuwano R
• 通讯作者: Kuwano R

晩期発症型アルツハイマー病とTREM2の関連解析

晚发性阿尔茨海默病与TREM2的关联分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 宮下哲典;温雅楠;初田裕幸;村山繁雄;山口晴保;赤津裕康;柿田明美;高橋均;井原康夫;池内健;桑野良三
• 通讯作者: 桑野良三