極限環境生物由来ヘムタンパク質の構造および機能解明
極限環境生物由来ヘムタンパク質の構造および機能解明
批准号:
15J06345
负责人:
藤井 創太郎
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2017-03-31
中文摘要
【研究背景】温泉のような高温・酸性環境から見出される生物由来の蛋白質は、安定性が高く、高温・酸性条件で効率よく機能する。蛋白質が安定性を獲得するためには、内部をより密にして、相互作用等を増やすことが一般的である。しかしそれは同時に、ヘモグロビンのようなガス結合能を有するヘム蛋白質にとっては酸素親和性の低下に繋がるため、安定性とガス親和性は言わば天秤の関係にある。【研究目的】当研究では、温泉環境に棲む生物の好熱菌や、酸耐性ユスリカ幼虫由来のヘム蛋白質に着目し、安定性とガス親和性の関係を明らかにすることとした。本研究の目的は、様々な極限環境生物由来のヘム蛋白質に着目し、それらの安定性とガス親和性に関する環境適応戦略を明らかにすることである。【方法および結果】好熱菌Hydrogenophilus thermoluteolus由来シトクロムc′は、安定性が高いことが特徴なガス結合型ヘム蛋白質である。当研究では、X線回折実験によりその立体構造を決定し、安定化やガス親和性に関与するアミノ酸を明らにした(S. Fujii et al., Protein Sci. 26, 737-748, 2017)。また、酸耐性ユスリカChironomus sulfurosus幼虫は、pH 2.0の酸性環境でも正常に生育する。この幼虫をpH 2.0 およびpH 7.0の条件で飼育し、mRNA次世代シーケシングによって酸性条件下で特異的に発現する遺伝子を探索した。その結果、34,964個の遺伝子を同定し、1,204個の遺伝子がpH 2.0で発現量が増加した。目的とするヘモグロビン遺伝子に関して、21種類のヘモグロビンの立体構造予測から、安定性の向上とガスへの親和性の向上を各ヘモグロビンが役割分担していることを見出した。
英文摘要
【研究背景】温泉のような高温・酸性環境から見出される生物由来の蛋白質は、安定性が高く、高温・酸性条件で効率よく機能する。蛋白質が安定性を獲得するためには、内部をより密にして、相互作用等を増やすことが一般的である。しかしそれは同時に、ヘモグロビンのようなガス結合能を有するヘム蛋白質にとっては酸素親和性の低下に繋がるため、安定性とガス親和性は言わば天秤の関係にある。【研究目的】当研究では、温泉環境に棲む生物の好熱菌や、酸耐性ユスリカ幼虫由来のヘム蛋白質に着目し、安定性とガス親和性の関係を明らかにすることとした。本研究の目的は、様々な極限環境生物由来のヘム蛋白質に着目し、それらの安定性とガス親和性に関する環境適応戦略を明らかにすることである。【方法および結果】好熱菌Hydrogenophilus thermoluteolus由来シトクロムc′は、安定性が高いことが特徴なガス結合型ヘム蛋白質である。当研究では、X線回折実験によりその立体構造を決定し、安定化やガス親和性に関与するアミノ酸を明らにした(S. Fujii et al., Protein Sci. 26, 737-748, 2017)。また、酸耐性ユスリカChironomus sulfurosus幼虫は、pH 2.0の酸性環境でも正常に生育する。この幼虫をpH 2.0 およびpH 7.0の条件で飼育し、mRNA次世代シーケシングによって酸性条件下で特異的に発現する遺伝子を探索した。その結果、34,964個の遺伝子を同定し、1,204個の遺伝子がpH 2.0で発現量が増加した。目的とするヘモグロビン遺伝子に関して、21種類のヘモグロビンの立体構造予測から、安定性の向上とガスへの親和性の向上を各ヘモグロビンが役割分担していることを見出した。
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変異を導入した好熱菌由来シトクロムc′の熱安定性比較
引入突变的嗜热细菌细胞色素 c 的热稳定性比较
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山根大典, 藤井創太郎, 三本木至宏]
通讯作者:
三本木至宏
好熱菌および常温菌由来シトクロムc′への相互変異導入による安定性変化
嗜热菌和嗜热菌来源的细胞色素c相互诱变导致稳定性变化
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[藤井創太郎, 山根大典, 三本木至宏]
通讯作者:
三本木至宏
Comparative study on stabilization mechanism of monomeric cytochrome c5 from deep-sea piezophilic Shewanella violacea
深海嗜压希瓦氏菌单体细胞色素c5稳定机制的比较研究
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[藤井創太郎, 政成美沙, 三本木至宏]
通讯作者:
三本木至宏
Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551 denaturation by five systematic urea derivatives that differ in the alkyl chain length.
铜绿假单胞菌细胞色素 c551 被五种烷基链长度不同的系统脲衍生物变性。
DOI:
10.1080/09168451.2017.1303361
发表时间:
2017
期刊:
Biosci. Biotech. Biochem.
影响因子:
--
作者:
[78.Kobayashi, S., Fujii, S., Koga, A., Wakai, S.,Matubayasi, N., Sambongi, Y]
通讯作者:
Y
Pyrophosphate hydrolysis in the extremely halophilic archaeon Haloarcula japonica is catalyzed by a single enzyme with a broad ionic strength range.
极嗜盐古菌 Haloarcula japonica 中的焦磷酸盐水解是由具有宽离子强度范围的单一酶催化的。
DOI:
10.1007/s00792-017-0917-3
发表时间:
2017
期刊:
Extremophiles
影响因子:
2.9
作者:
[S. Wakai, A. Abe, S. Fujii, K. Nakasone, Y. Sambongi]
通讯作者:
Y. Sambongi
共 12 条
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