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ミトコンドリアゲノム及び核ゲノム情報を用いた古代中国人類集団の遺伝的背景の解明

利用线粒体和核基因组信息阐明中国古代人类的遗传背景

基本信息

批准号：
15J08490
负责人：
石谷孔司
金额：
$ 1.79万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2015
资助国家：
日本
起止时间：
2015-04-24 至 2018-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

当該年度は，信頼性の高い古人骨ゲノム解析に向け劣化古人骨試料から得られた次世代シークエンスデータの解析方法の開発・改良を中心に実施した．本研究課題で取り組んだゲノムマッピングにおける精度改善や解析効率の低下に対するアプローチは，今後多くの古人骨試料への適用が期待される．また，本年度は膨大な塩基配列データベースを活用し，混入したヒトミトコンドリアハプログループ（コンタミネーション）を高精度に推定するための手法開発を行った．この研究手法は，日本DNA多型学会にて優秀研究賞を受賞する等高い評価を受けた．さらに，研究初年度から開発を進めているヒトミトコンドリアゲノム統合解析ツールMitoSuite(Ishiya and Ueda, 2017)は引き続き改良を進めており，操作性と機能の両面で改善がみられた．また，本年度は，古人骨ゲノムにおける欠損塩基の補完法（インピュテーション）についてもシミュレーションデータと実データの両方を用いた検証を実施した．以上の研究成果は，今後国際学術誌に投稿予定である．本年度は自身が開発した手法やツールを活用することで，約3,000年前の遺跡から出土した複数の人骨試料を用いてゲノム解析も実施した.各サンプルは，古代DNAの信頼性(Authenticity)を示す上で重要な脱アミノ化やコンタミネーションを調べた上で解析に用いた．また，ゲノム配列の一部が欠損した個体に対しては，上記の欠損補完法（インピュテーション）を適用した．以上の研究成果は，国際学術誌に投稿を予定している．今後は温暖湿潤なアジア地域で出土する劣化古人骨を対象に，全ゲノム解析へ向けてさらなる解析手法の開発・改良に取り組んでいきたいと考えている．

During the year, the development and improvement of the analytical method of the high reliability and high reliability ancient bone samples were carried out in the center. This study aims to improve the accuracy and efficiency of analysis and to anticipate the application of more ancient bone samples in the future. This year, we have expanded the use of the basic layout of the project, and we have developed methods to estimate the cost of the project with high accuracy. The Japanese DNA Polytype Society was awarded for its excellent research. In the beginning of the study, the development of the system was improved and the operability of the system was improved. This year, the Chinese government has implemented a series of measures to improve the quality of products and services. The above research results will be submitted to international academic journals in the future. This year, we have developed our own techniques and applied them to a number of human bone samples unearthed about 3,000 years ago. Each server is used to analyze the Authenticity of ancient DNA, which is an important part of its analysis and analysis. A part of the allocation is incomplete. The above research results are expected to be submitted to international academic journals. In the future, the deterioration of ancient bones unearthed in warm and humid areas should be studied.