天然基質の官能基の一部として誤認識される小分子を用いた酵素の誤作動と酵素反応制御

使用被错误识别为天然底物官能团一部分的小分子进行酶故障和酶反应控制

基本信息

  • 批准号:
    16J02846
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.79万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2016
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2016-04-22 至 2019-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

多くの生体触媒は、特定の原料を効率的に目的の分子へ変換する為に、高い基質特性を示す。この高い基質特異性により、生体触媒の汎用的な応用が制限されていた。私は、過酸化水素を用いて長鎖脂肪酸を特異的に酸化するCYP152B1を、酢酸水溶液中で扱うだけで、長鎖脂肪酸とは構造の異なる非天然基質の酸化反応を触媒する「基質誤認識システム」を報告していた。本研究では、「汎用的な基質誤認識システム」の開発を目指した。2017年度までに、好熱性細菌Exiguobacterium sp. AT1bから発見されたCYP152N1の発現系、精製手法の確立と、結晶構造の解析に成功した。この酵素が、過酸化水素を等量的に用いて、1分間あたり1900回転の速さで長鎖脂肪酸のα-位を(S)-選択的に水酸化することを2017年度に報告した。CYP152N1は、脂肪酸特異的なペルオキシゲナーゼであるCYP152A1やCYP152B1と同様に、長鎖脂肪酸のカルボキシル基を認識するので、長鎖脂肪酸以外の基質を酸化することができない。私達は、CYP152B1の活性部位近傍にカルボキシル基を持つグルタミン酸を変異導入することで、A245E変異体が「グルタミン酸のカルボキシル基を長鎖脂肪酸のカルボキシル基と誤認識」し、長鎖脂肪酸以外の基質を酸化する事を2016年度に報告していた。2018年度は、活性部位にグルタミン酸を導入する手法の汎用性を確認するために、CYP152A1 A246E変異体とCYP152N1 A243E変異体を作成し、チオアニソールのスルホキシド化活性とスチレンのエポキシ化活性を評価した。いずれの変異体もスルホキシド化活性とエポキシ化活性を示した。特にCYP152N1 A243E変異体は、野生型の長鎖脂肪酸水酸化反応の触媒活性活性より効率的な、スルホキシド化反応の触媒活性を示した。
The へ transformation of に target <s:1> molecules with multiple く <s:1> biological catalysts <e:1>, specific <s:1> raw materials を efficiency, する into に, and high <s:1> matrix properties を show す. The な応 with high <s:1> matrix-specific によ な応 and biocatalyst <s:1> universal is limited by が されて <s:1> た. Private は を, acidic water element with い て long locks を specific に fatty acid acidification す る CYP152B1 を, boggy acid in aqueous solution, で Cha う だ け で, long locks fatty acid と は の different structures な る の unnatural matrix acidification anti 応 を catalyst す る "matrix by mistake understanding シ ス テ ム" を report し て い た. This study で で, "General な matrix misunderstanding システム" システム development を points to た た. In 2017, までに, the thermophilic bacterium Exiguobacterium sp. AT1b ら was found された, CYP152N1 sequence was found と, the refining method was established と, and the crystal structure was analyzed に successfully た. こ が の enzyme, water element を acidification passes the same amount of に い て, 1 minute between あ た り 1900 back to the planning の speed さ で の alpha a long lock fatty acids を (S) - sentaku に water acidification す る こ と を に report 2017 し た. CYP152N1 は, fatty acid specific な ペ ル オ キ シ ゲ ナ ー ゼ で あ る CYP152A1 や CYP152B1 と with others に, long locks fatty acid の カ ル ボ キ シ ル base を know す る の で, long locks fatty acids を の matrix acidification す る こ と が で き な い. Private は, CYP152B1 の active site near alongside に カ ル ボ キ シ ル base を hold つ グ ル タ ミ ン acid を - different import す る こ と で, A245E - variant が "グ ル タ ミ ン acid の カ ル ボ キ シ ル を long locks の fatty acid カ ル ボ キ シ ル base と mistakenly" outside の matrix を し, long locks fatty acid acidification す る matter を に report 2016 し て Youdaoplaceholder0 た. 2018 annual は, active site に グ ル タ ミ ン acid を import す る gimmick の universal availability を す る た め に, CYP152A1 A246E - variant と CYP152N1 A243E - variant を し, consummate チ オ ア ニ ソ ー ル の ス ル ホ キ シ ド change active と ス チ レ ン の エ ポ キ シ change active を review 価 し た. The <s:1> ずれ variant ス ス ホキシド ホキシド chemical activity とエポキシ chemical activity を shows た た. Special に CYP152N1 A243E - variant は, wild type の long fatty acid water acidification anti lock 応 の catalytic activity of active よ り な sharper rates, ス ル ホ キ シ ド turn against 応 の を catalytic activity in し た.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The University of Adelaide(オーストラリア)
阿德莱德大学(澳大利亚)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
脂肪酸特異的ペルオキシゲナーゼの基質結合状態を模した非特異的ペルオキシゲナーゼの開発
开发模拟脂肪酸特异性过氧化酶底物结合状态的非特异性过氧化酶
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小野田浩宜;荘司長三;杉本宏;城宜嗣;渡辺芳人
  • 通讯作者:
    渡辺芳人
脂肪酸特異的ペルオキシゲナーゼの反応場解析に基づいた基質寛容性の拡張
基于脂肪酸特异性过氧化酶反应场分析的底物耐受性扩展
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小野田浩宜;荘司長三;杉本宏;城宜嗣;渡辺芳人
  • 通讯作者:
    渡辺芳人
α-Oxidative Decarboxylation Reaction of Fatty Acid Using CYP152N1 peroxygenase
使用 CYP152N1 过氧化酶进行脂肪酸的 α-氧化脱羧反应
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hiroki Onoda;Osami Shoji;Hiroshi Sugimoto;Yoshitsugu Shiro;Yoshihito Watanabe
  • 通讯作者:
    Yoshihito Watanabe
酢酸水溶液を用いた脂肪酸特異的ペルオキシゲナーゼの基質特性拡張
使用乙酸水溶液扩展脂肪酸特异性过氧化酶的底物性质
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小野田浩宜;荘司長三;渡辺芳人
  • 通讯作者:
    渡辺芳人
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