樹状突起スパインの刈り込みにおけるオートファジーの役割の解析

自噬在树突棘修剪中的作用分析

• 批准号: 16J04376
• 负责人: 貝塚 剛志
• 金额: $ 2.08万
• 依托单位: Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-22 至 2019-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16J04376/
• 关键词: 樹状突起スパイン; PSD; シナプス; プロテオミクス; プロテオーム; シナプス後肥厚; オートファジー

今年度は、前々年度および前年度の報告書に記載した方針に従い、樹状突起スパインに存在する巨大タンパク質複合体であるシナプス後肥厚(PSD)のプロテオーム解析を推進した。◆発達段階におけるPSDタンパク質のリモデリング：マウスの生後の発達段階において、樹状突起スパインの数や単位時間あたりの形成数・剪定数は大きく変化する。この過程にPSDタンパク質のリモデリングが関与している可能性を考え、異なる発達段階のマウスの脳からPSDを精製し、プロテオーム解析を行った。前年度のデータはばらつきが大きい、血液のタンパク質が混入しているなどの問題があったため、PSDの精製手順、および解析する質量分析装置・ソフトウェアを変更し、再解析を行った。その結果、上記の問題が改善された精度の高いデータを得ることに成功した。さらにk平均法による変動パターンのクラスタリング、統計学的解析による有意な変化の検出、およびバイオインフォマティクス解析により、生後発達段階のマウスの脳において、シナプスの成熟を説明しうるPSDのリモデリングが生じていることを明らかにした。また、既存のオミックスデータとの相関を調べることで、このPSDリモデリングが主に転写レベルで制御されていること、げっ歯類・霊長類間で進化的に保存されていることを見出した。これらの成果は国内外の学会で発表を行っている。◆既存PSDプロテオームデータの分析：前年度の研究をさらに拡張し、過去に出版されている25報の論文に含まれる計43セットのPSDプロテオームデータを統合し、解析した。まずクラスタリング等により、相互のデータの関連性を示した。また「複数のプロテオーム解析で検出されているが、機能が全く調べられていない因子」をさらに解析したところ、PSDの液-液相分離に関与している可能性が示唆された。今後はこれら未知のPSDタンパクの機能解析を進めていきたいと考えている。

This year's annual report records the progress of policy analysis, tree structure analysis, and the existence of large protein complexes. The number of individual units in the development stage, the number of dendrites and the number of individual units in the development stage after birth, the number of units in the development stage, the number of cuts, and the number of changes. This process is related to the possibility of PSD separation and separation, and the possibility of PSD separation and separation. In the past year, the quality of blood was mixed with the quality of PSD. The quality of PSD was analyzed. The results of the above mentioned problems were improved and the accuracy of the results was improved. K-mean method, dynamic analysis, statistical analysis, analysis of intentional changes, postnatal development, maturity analysis, PSD analysis, postnatal development This is the first time that a new generation of PSDs has been created. The results of the study are expected to be published in the Chinese Academy of Sciences at home and abroad.◆ Analysis of existing PSD profiles: The previous year's research has been expanded, and the past 25 papers published in the past include 43 articles of PSD profiles. The relationship between the two groups is shown. The possibility of liquid-liquid phase separation of PSD is demonstrated by the analysis of "complex solution" and "functional adjustment factor." In the future, the function analysis of PSD is unknown.

项目成果

Proteomics of postsynaptic density and neuronal development

突触后密度和神经元发育的蛋白质组学

• 发表时间: 2017
• 作者: Takeshi Kaizuka;Toru Takumi
• 通讯作者: Toru Takumi

オートファジーの定量的解析

自噬的定量分析

• 发表时间: 2017
• 期刊: 実験医学増刊
• 作者: Kento Kawakita;Evan P. Beaumier;Yuya Kakiuchi;Hayato Tsurugi;Ian A. Tonks;Kazushi Mashima;貝塚剛志
• 通讯作者: 貝塚剛志

Remodeling of PSD composition during postnatal development

产后发育过程中 PSD 成分的重塑

• 发表时间: 2018
• 作者: Takeshi Kaizuka;Toru Takumi
• 通讯作者: Toru Takumi

精神科領域の用語解説 オートファジー

精神病学领域术语表：自噬

• 发表时间: 2016
• 期刊: 分子精神医学
• 作者: Victor Mougel;Ka-Wing Chan;Georges Siddiqi;Kento Kawakita;Haruki Nagae;Hayato Tsurugi;Kazushi Mashima;Olga Safonova;Christophe Coperet;貝塚剛志
• 通讯作者: 貝塚剛志

An Autophagic Flux Probe that Releases an Internal Control

• DOI: 10.1016/j.molcel.2016.09.037
• 发表时间: 2016-11-17
• 期刊: MOLECULAR CELL
• 影响因子: 16
• 作者: Kaizuka, Takeshi;Morishita, Hideaki;Mizushima, Noboru
• 通讯作者: Mizushima, Noboru