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RNA regulator in breast cancer stem cells and its application to therapy

乳腺癌干细胞中的RNA调节因子及其在治疗中的应用

基本信息

批准号：
21K19403
负责人：
淺原弘嗣
金额：
$ 4.08万
依托单位：
Tokyo Medical and Dental University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-07-09 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19403/
关键词：
RNA binding protein breast cancer cancer stem cell

项目摘要

乳がんは、日本で年間9万人以上が罹患する、女性において最も頻度が高いがんである。中でもトリプルネガティブ乳がんは乳がん全体の約20%を占め、他のタイプの乳がんと異なり、十分な治療法が確立されていないため、予後不良な疾患である。トリプルネガティブ乳がんにおいてはCD44陽性CD24陰性などのマーカーで特徴づけられる乳がん幹細胞集団が存在し、治療抵抗性に寄与することが知られてきた。そこで我々は、予備実験において、TNBCのがん幹細胞において特異的に高発現するRNA結合タンパク(RBD24)を同定し、RBD24がRNA階層において、乳がん幹細胞を規定する可能性を見出した。このRBD24について本年度は以下の解析を行った。現在RBD24と共発現するような因子の探索を免疫染色とscRNAseqの再解析のデータをもとに行っている。1）RBD24のTNBC癌幹細胞の遺伝子発現プロファイルにおける機能解析：既報のscRNAseqデータの再解析を行ったところ、RBD24が乳がん幹細胞様の発現を示す細胞集団において強く発現することを明らかにした。またトリプルネガティブ乳がん患者由来の病理検体においてもRBD24の発現部位について検証を行った。2）RBD24のＲＮＡ結合能を介した分子機能解析：RBD24を発現するMDAMB231細胞を用いてPAR-CLIP解析を行うことで、RBD24が結合する標的遺伝子および塩基配列をtranscriptome wideに高解像度で同定した。特に乳がん幹細胞性を制御する上で重要な遺伝子の3’UTR上の特定のcis-element配列に結合することで標的遺伝子のmRNAを安定化させることを明らかにした。特にこのcis-elementをもつ領域を含む3’UTRを搭載したレポーターを用いてRBD24によるレポーター活性の変化を計測したところ、RBD24の発現によるレポーター活性の上昇が明らかとなった。

In Japan, more than 90,000 people suffered from breast cancer, and women suffered from the most severe diseases in Japan every year. In the hospital, the total number of breast cancer accounts for about 20% of the total, and the total number of breast cancer accounts for about 20% of the total breast cancer. Please tell me that there is something wrong with the presence of breast cancer, the presence of CD44 cells, the presence of breast cancer, the presence of breast cancer, the presence of breast cancer, We need to know that we are responsible for this, and that the high temperature of the TNBC cell is the same as that of the RBD24 (RBD24), the RBD24 RNA is the same, and the breast cancer cell specifies that the possibility is affected. Please RBD24 the following parsing lines for the current year. Now in RBD24, we explore the immune staining method, scRNAseq, and then analyze the immunostaining method, and then analyze the immune response. 1) RBD24 TNBC cancer cell cycle analysis: both scRNAseq and RBD24 breast cancer cell lines were analyzed to show that the cell population had a positive effect. The cause of the breast disease is the pathology, the RBD24, the location of the breast, the breast cancer, the breast cancer, the breast cancer. 2) the combination of RBD24 and RNA can improve the molecular analysis: the MDAMB231 cell of RBD24 can be analyzed by PAR-CLIP, and the sub-cluster of RBD24 and RBD24 will be matched with the high resolution of transcriptome wide. The specific cis-element collocation on the 3'UTR of the important baby on the special breast cancer cell control system is used to stabilize the baby in combination with the baby mRNA of the breast cancer. Special information is available in the field of cis-element information, which contains information about how to use the RBD24 information to change the activity of the computer. The RBD24 is used to display the information on the activity of the computer.