パーキンソン病における慢性脳低灌流のエピジェネティック制御を介した神経保護効果

表观遗传调控帕金森病慢性脑灌注不足介导的神经保护作用

基本信息

  • 批准号:
    22K07512
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

本研究では慢性虚血がパーキンソン病(PD)発症リスクに与える影響について、エピゲノム変化に注目して解析を行う。特に、脳組織は複数の細胞種により構成されており、慢性虚血に対する反応は異なることが想定される。このため、細胞種特異的なエピゲノム解析を行う実験系を確立し、同実験系を慢性虚血マウスモデルに適用する。脳組織における主要な細胞群について,それぞれの核および細胞質マーカーの検索を行う.その上で,フローサイトメトリーに利用可能な抗体について蛍光標識を行い,脳組織から分離した核の染色を行い,それぞれの細胞種を適切に染色できていることを確認する.これらの抗体を用いて,各種細胞核をフローサイトメトリーにより分離し,CUT&Tag法によるヒストン修飾解析を行った.神経細胞およびアストロサイトについては,細胞質マーカ用いて分離することが可能であった.オリゴデンドロサイトおよびミクログリアについては,核マーカーを用いることにより分離可能であった.ヒストン修飾解析については,HH3K4me3およびH3K27acについて行い,5000個の核からゲノムワイドのヒストンプロファイルデータを得ることができた.Technical replicateではいずれも相関係数0.9以上と,少ない細胞数から良好な再現性のあるデータを得ることができた.Gene ontology解析ではそれぞれの細胞種の機能を反映した遺伝子領域のピーク検出ができていることを確認した.本手法を慢性脳虚血モデルマウスに適用し,ヒストン修飾解析およびクロマチンアクセシビリティ解析を行った。
This study で は chronic deficiency blood が パ ー キ ン ソ ン disease (PD) 発 disease リ ス ク に and え る influence に つ い て, エ ピ ゲ ノ ム variations change に attention し て parsing う を line. に, 脳 organization は plural の cell type に よ り constitute さ れ て お り, chronic deficiency blood に す seaborne る anti 応 は different な る こ と が scenarios さ れ る. こ の た め, cell species specific な エ ピ ゲ ノ ム parsing line を う be 験 し を established, with be 験 department を chronic deficiency blood マ ウ ス モ デ ル に applicable す る. Main な 脳 organization に お け る cells に つ い て, そ れ ぞ れ の nuclear お よ び cytoplasm マ ー カ ー の 検 cable line を う. そ の で, フ ロ ー サ イ ト メ ト リ ー に using antibodies may な に つ い て 蛍 light logo を い, 脳 organization か ら separation し た nuclear の dyeing を い, そ れ ぞ れ の cells of を appropriate に dyeing で き て い る こ と を confirm す る. を こ れ ら の antibody with い て, various nuclei を フ ロ ー サ イ ト メ ト リ ー に よ り separation し CUT&Tag method に よ る ヒ ス ト ン line modified analytic を っ た. The Shinto cells およびアストロサ トに トに とが て て て, and the cytoplasm て カ can be isolated by て て する する とが とが possibly であった. オ リ ゴ デ ン ド ロ サ イ ト お よ び ミ ク ロ グ リ ア に つ い て は, nuclear マ ー カ ー を with い る こ と に よ り separation may で あ っ た. ヒ ス ト ン modified analytic に つ い て は, HH3K4me3 お よ び H3K27ac に つ い い て lines, 5000 の nuclear か ら ゲ ノ ム ワ イ ド の ヒ ス ト ン プ ロ フ ァ イ ル デ ー タ を have る こ と が で き た. Masato Technical replicate で は い ず れ も phase coefficient over 0.9 と, less な い cell number か ら な good reproducibility の あ る デ ー タ を must る こ と が で き た. Gene ontology parsing で は そ れ ぞ れ の cell types of の を reflect し た heritage 伝 sub-fields の ピ ー ク 検 out が で き て い る こ と を confirm し た. This technique を chronic 脳 virtual blood モ デ ル マ ウ ス に applicable し, ヒ ス ト ン modified analytic お よ び ク ロ マ チ ン ア ク セ シ ビ リ テ ィ parsing line を っ た.

项目成果

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Proteomic profile of nuclei containing p62-positive inclusions in a patient with neuronal intranuclear inclusion disease
  • DOI:
    10.1016/j.nbd.2023.105989
  • 发表时间:
    2023-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    M. Kurihara;T. Mano;Fumihiro Eto;I. Yao;Kenichiro Sato;G. Ohtomo;T. Bannai;Shota Shibata;H. Ishiura;M. Ikemura;T. Matsubara;M. Morishima;Yuko Saito;Shigeo Murayama;Tatsushi Toda;M. Setou;A. Iwata
  • 通讯作者:
    M. Kurihara;T. Mano;Fumihiro Eto;I. Yao;Kenichiro Sato;G. Ohtomo;T. Bannai;Shota Shibata;H. Ishiura;M. Ikemura;T. Matsubara;M. Morishima;Yuko Saito;Shigeo Murayama;Tatsushi Toda;M. Setou;A. Iwata
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    Shinohara Fumiya;Arakaki Saya;Amano Taiju;Minami Masabumi;Kaneda Katsuyuki;間野 達雄;平野(野元)美佐
  • 通讯作者:
    平野(野元)美佐

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