パーキンソン病における慢性脳低灌流のエピジェネティック制御を介した神経保護効果
パーキンソン病における慢性脳低灌流のエピジェネティック制御を介した神経保護効果
批准号:
22K07512
负责人:
間野 達雄
金额:
$2.66万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
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英文摘要
本研究では慢性虚血がパーキンソン病(PD)発症リスクに与える影響について、エピゲノム変化に注目して解析を行う。特に、脳組織は複数の細胞種により構成されており、慢性虚血に対する反応は異なることが想定される。このため、細胞種特異的なエピゲノム解析を行う実験系を確立し、同実験系を慢性虚血マウスモデルに適用する。脳組織における主要な細胞群について,それぞれの核および細胞質マーカーの検索を行う.その上で,フローサイトメトリーに利用可能な抗体について蛍光標識を行い,脳組織から分離した核の染色を行い,それぞれの細胞種を適切に染色できていることを確認する.これらの抗体を用いて,各種細胞核をフローサイトメトリーにより分離し,CUT&Tag法によるヒストン修飾解析を行った.神経細胞およびアストロサイトについては,細胞質マーカ用いて分離することが可能であった.オリゴデンドロサイトおよびミクログリアについては,核マーカーを用いることにより分離可能であった.ヒストン修飾解析については,HH3K4me3およびH3K27acについて行い,5000個の核からゲノムワイドのヒストンプロファイルデータを得ることができた.Technical replicateではいずれも相関係数0.9以上と,少ない細胞数から良好な再現性のあるデータを得ることができた.Gene ontology解析ではそれぞれの細胞種の機能を反映した遺伝子領域のピーク検出ができていることを確認した.本手法を慢性脳虚血モデルマウスに適用し,ヒストン修飾解析およびクロマチンアクセシビリティ解析を行った。
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会议论文
DOI:
10.1016/j.nbd.2023.105989
发表时间:
2023-01
期刊:
Neurobiology of Disease
影响因子:
6.1
作者:
[M. Kurihara;T. Mano;Fumihiro Eto;I. Yao;Kenichiro Sato;G. Ohtomo;T. Bannai;Shota Shibata;H. Ishiura;M. Ikemura;T. Matsubara;M. Morishima;Yuko Saito;Shigeo Murayama;Tatsushi Toda;M. Setou;A. Iwata]
通讯作者:
M. Kurihara;T. Mano;Fumihiro Eto;I. Yao;Kenichiro Sato;G. Ohtomo;T. Bannai;Shota Shibata;H. Ishiura;M. Ikemura;T. Matsubara;M. Morishima;Yuko Saito;Shigeo Murayama;Tatsushi Toda;M. Setou;A. Iwata
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