骨髄移植症例を用いたHLA近傍ゲノム領域における急性GVHD新規感受性多型の同定

利用骨髓移植病例鉴定 HLA 附近基因组区域的新型急性 GVHD 易感性多态性

• 批准号: 22K08465
• 负责人: 鈴木 進悟
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Tokai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08465/
• 关键词: 造血幹細胞移植; 急性GVHD; HLA; 急性移植片対宿主病; ヒト白血球抗原

急性移植片対宿主病 (aGVHD)は、古典的HLA遺伝子5座 (HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DQB1) を患者・ドナー間でマッチさせた骨髄移植症例であっても約半数の症例で発症する。申請者らは、その分子機序を理解にするためのaGVHD 関連解析を先行的に実施した結果、HLA-A座のテロメア側に位置する150 kbからなる連鎖不平衡 (LD) ブロック内にaGVHDと強く関連する遺伝的多型をHLA-F-AS1座に同定した。しかし、HLA-F-AS1座そのものが急性GVHDと相関するのか、それともLDブロック内の別の座位がより強い感受性を示すのかについては不明である。そこで、HLA-F-AS1座が座位するLDブロックにおける網羅的な多型解析を実施し、得られるSNPs情報を用いたゲノム相関解析から真のaGVHD感受性多型を同定することを目的とした。急性GVHDの重症度を考慮して選抜した患者・ドナー99ペア (計198検体)を供試し、Long-ranged PCR法を用いてLDブロックにおける網羅的な多型解析を次世代シーケンサーにより実施した。その結果、198検体から、データベースに登録されている1573箇所および未登録の262箇所の合計1835箇所のSNPsを検出した。次いで、得られた多型データにおける患者・ドナー間でのマッチおよびミスマッチの分布を比較したところ、150kbの内、テロメア側の約130kbに患者・ドナー間でのミスマッチが集中し、残り20kb中のSNPsはその殆どが患者ドナー間で一致するSNPsであった。今後は、得られた多型データを用いてaGVHD発症群と非発症群間、さらにはaGVHDのグレード別に分けた統計解析を実施することで、真のaGVHD感受性多型の同定を目指す。

Acute stents host disease (aGVHD) seaborne は, HLA of classical 伝 son 5 (HLA - A - B - C, - DRB1, DQB1) in patients with を · ド ナ ー between で マ ッ チ さ せ た bone marrow transplantation cases で あ っ て も about half of cases の で す 発 disease る. Applicants ら は, そ の molecular machine sequence を understand に す る た め の aGVHD masato even resolve に を first be applied し た results, HLA - A の テ ロ メ ア side に す る 150 KB か ら な る linkage disequilibrium (LD) Strong inside ブ ロ ッ ク に aGVHD と く masato even す る but 伝 polymorphism を HLA - F - with fixed し AS1 seat に た. し か し, HLA - F - AS1 そ の も の が acute GVHD と phase masato す る の か, そ れ と も LD ブ ロ ッ in ク の don't の seat が よ り strong い susceptibility を shown す の か に つ い て は unknown で あ る. そ こ で す, HLA - F - AS1 が seat る LD ブ ロ ッ ク に お け る snare な polymorphism analysis を be し, too ら れ る SNPs intelligence を with い た ゲ ノ ム phase masato parsing か ら is の aGVHD susceptibility polymorphism を with fixed す る こ と を purpose と し た. Acute GVHD の intensive degree を consider し て optional sorting し た patients, ド ナ ー 99 ペ ア 198 検 (body) を selected し, Long - ranged を PCR method with い て LD ブ ロ ッ ク に お け る snare な polymorphism analysis を nextgen シ ー ケ ン サ ー に よ り be applied し た. そ の results, 198 検 か ら, デ ー タ ベ ー ス に login さ れ て い る 1573 by お よ び not login の の by 262 is の total 1835 SNPs を 検 out し た. Time い で, ら れ た polymorphism デ ー タ に お け る patients, ド ナ ー between で の マ ッ チ お よ び ミ ス マ ッ チ の distribution を compare し た と こ ろ, within 150 KB の, テ ロ メ ア side の patients with about 130 KB に · ド ナ ー between で の ミ ス マ ッ チ が concentrated し, residual り 20 KB の SNPs は そ の perilous ど が patients ド ナ consistent between ー で す る SN Psであった. Future は, ら れ た polymorphism デ ー タ を with い て aGVHD 発 group と non 発 disease between group, さ ら に は aGVHD の グ レ ー ド don't に points け た statistical parsing を be applied す る こ と で, true の aGVHD susceptibility polymorphism の with fixed を refers す.

项目成果

Sequence Variations Within HLA-G and HLA-F Genomic Segments at the Human Leukocyte Antigen Telomeric End Associated With Acute Graft-Versus-Host Disease in Unrelated Bone Marrow Transplantation.

• DOI: 10.3389/fimmu.2022.938206
• 发表时间: 2022
• 期刊: Frontiers in immunology
• 影响因子: 7.3