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骨髄移植症例を用いたHLA近傍ゲノム領域における急性GVHD新規感受性多型の同定

利用骨髓移植病例鉴定 HLA 附近基因组区域的新型急性 GVHD 易感性多态性

基本信息

批准号：
22K08465
负责人：
鈴木進悟
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Tokai University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08465/
关键词：
造血幹細胞移植急性GVHD HLA 急性移植片対宿主病ヒト白血球抗原

项目摘要

急性移植片対宿主病 (aGVHD)は、古典的HLA遺伝子5座 (HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DQB1) を患者・ドナー間でマッチさせた骨髄移植症例であっても約半数の症例で発症する。申請者らは、その分子機序を理解にするためのaGVHD 関連解析を先行的に実施した結果、HLA-A座のテロメア側に位置する150 kbからなる連鎖不平衡 (LD) ブロック内にaGVHDと強く関連する遺伝的多型をHLA-F-AS1座に同定した。しかし、HLA-F-AS1座そのものが急性GVHDと相関するのか、それともLDブロック内の別の座位がより強い感受性を示すのかについては不明である。そこで、HLA-F-AS1座が座位するLDブロックにおける網羅的な多型解析を実施し、得られるSNPs情報を用いたゲノム相関解析から真のaGVHD感受性多型を同定することを目的とした。急性GVHDの重症度を考慮して選抜した患者・ドナー99ペア (計198検体)を供試し、Long-ranged PCR法を用いてLDブロックにおける網羅的な多型解析を次世代シーケンサーにより実施した。その結果、198検体から、データベースに登録されている1573箇所および未登録の262箇所の合計1835箇所のSNPsを検出した。次いで、得られた多型データにおける患者・ドナー間でのマッチおよびミスマッチの分布を比較したところ、150kbの内、テロメア側の約130kbに患者・ドナー間でのミスマッチが集中し、残り20kb中のSNPsはその殆どが患者ドナー間で一致するSNPsであった。今後は、得られた多型データを用いてaGVHD発症群と非発症群間、さらにはaGVHDのグレード別に分けた統計解析を実施することで、真のaGVHD感受性多型の同定を目指す。

Patients with acute graft "host disease (aGVHD)" and classical HLA constrictor 5 (HLA-A,-B,-C,-DRB1,-DQB1) were treated with bone transplantation. The molecular order of the applicant and the applicant understand the results of the previous aGVHD analysis, the location of the HLA-A, the location of the aGVHD, the imbalance of the link (LD), and the multi-type HLA-F-AS1 of the aGVHD. The HLA-F-AS1 seat is sensitive to acute GVHD, the LD seat is sensitive, the sensitivity is strong, and the sensitivity is unknown. The real aGVHD receptivity polymorphisms are the same as the true aGVHD receptivity polymorphisms of the real aGVHD receptivity by using the HLA-F-AS1 seat and the LD seat to analyze the polymorphisms in the Internet. In the acute GVHD severity test, the patients were selected for testing, and the Long-ranged PCR method was used to analyze the polymorphisms in the next generation of LD Internet. According to the results of the survey, we did not register the SNPs data from the total of 1835 in the total of 1835 in the last two years of the year. We did not register the data of the total of 1835 in the last two years. The patients with multiple phenotypes were divided into two groups. The distribution of the patients was compared with that of the patients in the 150kb, the patients in the 150kb, the patients in the 130kb group, the patients in the 20kb, the patients in the SNPs group, the patients in the remnant group. In the future, the patients with multiple aGVHD syndrome, the patients with non-infectious disease, the patients with multiple aGVHD susceptibility and the patients with true aGVHD susceptibility were analyzed by statistical analysis.