骨髄移植症例を用いたHLA近傍ゲノム領域における急性GVHD新規感受性多型の同定

利用骨髓移植病例鉴定 HLA 附近基因组区域的新型急性 GVHD 易感性多态性

基本信息

批准号：
22K08465
负责人：
鈴木進悟
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Tokai University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08465/
关键词：
造血幹細胞移植急性GVHD HLA 急性移植片対宿主病ヒト白血球抗原

项目摘要

急性移植片対宿主病 (aGVHD)は、古典的HLA遺伝子5座 (HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DQB1) を患者・ドナー間でマッチさせた骨髄移植症例であっても約半数の症例で発症する。申請者らは、その分子機序を理解にするためのaGVHD 関連解析を先行的に実施した結果、HLA-A座のテロメア側に位置する150 kbからなる連鎖不平衡 (LD) ブロック内にaGVHDと強く関連する遺伝的多型をHLA-F-AS1座に同定した。しかし、HLA-F-AS1座そのものが急性GVHDと相関するのか、それともLDブロック内の別の座位がより強い感受性を示すのかについては不明である。そこで、HLA-F-AS1座が座位するLDブロックにおける網羅的な多型解析を実施し、得られるSNPs情報を用いたゲノム相関解析から真のaGVHD感受性多型を同定することを目的とした。急性GVHDの重症度を考慮して選抜した患者・ドナー99ペア (計198検体)を供試し、Long-ranged PCR法を用いてLDブロックにおける網羅的な多型解析を次世代シーケンサーにより実施した。その結果、198検体から、データベースに登録されている1573箇所および未登録の262箇所の合計1835箇所のSNPsを検出した。次いで、得られた多型データにおける患者・ドナー間でのマッチおよびミスマッチの分布を比較したところ、150kbの内、テロメア側の約130kbに患者・ドナー間でのミスマッチが集中し、残り20kb中のSNPsはその殆どが患者ドナー間で一致するSNPsであった。今後は、得られた多型データを用いてaGVHD発症群と非発症群間、さらにはaGVHDのグレード別に分けた統計解析を実施することで、真のaGVHD感受性多型の同定を目指す。

在大约一半的骨髓移植病例中，急性移植物抗宿主病（AGVHD）发生在患者和供体之间五个经典的HLA基因基因座（HLA -A，-b，-c，-ddqb1，-DQB1）。申请人进行了先前的与AGVHD相关的分析，以了解其分子机制，并在HLA-A轨迹端的150-KB连锁不平衡（LD）块中确定了HLA-F-AS1基因座的遗传多态性。但是，尚不清楚HLA-F-AS1基因座本身是否与急性GVHD相关，或者LD块中的另一个基因座是否表现出更大的灵敏度。因此，在HLA-F-AS1基因座所在的LD块中进行了全面的多态性分析，目的是使用获得的SNP信息从基因组相关分析中鉴定出真正的AGVHD敏感多态性。测试了99名患者/供体对（总共198个样本），以考虑急性GVHD的严重程度，并使用长期PCR方法使用下一代测序仪进行了LD块中的全面多态性分析。结果，从数据库中注册的1,573个地点，从198个标本中检测到总共1,835个地点中未注册的262个站点。接下来，在比较患者和捐助者在获得的多态性数据中的匹配分布和不匹配的分布时，在150 KB中，患者和捐助者之间的错配在端粒侧约130 kb，而在剩余的20 kb中，大多数SNP是患者与供体之间的SNP。将来，我们旨在使用获得的多态性数据通过进行统计分析来确定真正的AGVHD敏感多态性以及通过AGVHD发作和非发育组以及AGVHD等级的统计分析。