卵巣高異型度漿液性癌のシングルセルHRDの解析と腫瘍内不均一性の解明

卵巢高级别浆液性癌单细胞 HRD 分析及瘤内异质性阐明

• 批准号: 22K09606
• 负责人: 高矢 寿光
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kindai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K09606/
• 关键词: 卵巣がん; HRD; シングルセル解析

卵巣高異型度漿液性癌(HGSOC)9例について，Oncoscan FFPE Assay(ThermoFisher Scientific)を用いたSNPアレイデータから，我々の開発したプログラムを用いてHRD解析を行った結果，全症例において化学療法後にHRDスコアが低下することを確認した．中でも，化学療法後に大きくHRDスコアが低下した症例と，HRDスコアが低下したものの，低下の程度が小さい症例とに分かれており，化学療法後にもHRDの性質を有する腫瘍細胞が残存する可能性が考えられた．また，それぞれのBRCA1/2遺伝子の変異について解析するために，Oncomine BRCA Research Assay (ThermoFisher Sientific)を用いてBRCA1/2遺伝子のターゲットシークエンスを行い，各症例のHRDスコアおよびBRCA1/2遺伝子におけるヘテロ接合性の欠失(LOH)の有無と合わせて化学療法前後での変化を解析した．その結果，BRCA1遺伝子の変異とLOHが両方とも認められた症例では，BRCA1/2遺伝子の変異またはLOHが単独で認められた症例に比べHRDスコアが高値であった．また，化学療法後にHRDスコアが顕著に減少した全症例において，化学療法後にBRCA1遺伝子のLOHが消失していた．一方で，BRCA1遺伝子の変異を有する症例では，化学療法後の腫瘍においてもほぼ同程度の変異率でBRCA1遺伝子の変異を有しており，BRCA1遺伝子変異そのものは化学療法の効果の指標とはなり得ない可能性が考えられた．

9 cases of high-grade atypia serous carcinoma (HGSOC), Oncoscan FFPE Assay (ThermoFisher Scientific)いたSNPアレイデータから，我々の开発したプログラムを用いてThe results of the HRD analysis were confirmed. All cases showed that the HRD was low after chemotherapy. In case of low HRD after chemotherapy, low HRD, low degree of HRD The nature of HRD after chemotherapy is small, and there is a possibility that tumor cells will remain. Oncomine BRCA Research Assay (ThermoFisher Sientific)いてBRCA1/2 inherited 伝子のターゲットシークエンスを行い, each case of HRDスコアおよびBRCA1/2 legacy 伝子におけるヘテロのLOH (LOH) の无 と合わせて での剉 change を ANALYSIS した．そのResults, BRCA1 伝子の変differentとLOHが両方とも admitted められた cases では, BRCA1/ 2弝子の変differentまたはLOHが単多でcognizeめられたsymptom caseに比べHRDスコアが高値であった.また, after chemotherapy, the HRD was reduced, the total symptom was reduced, and after chemotherapy, the BRCA1 gene was lost, and the LOH was disappeared. On the one hand, there are cases of BRCA1 mutation, and there are cases of BRCA1 mutation, such as swelling and ulcer after chemotherapy.伝子変同を有しており, BRCA1 伝子変different そのものはchemotherapy の Effect のINDICATOR とはなり got ない POSSIBILITY がtest えられた．