集団遺伝学的アプローチによる疾患関連遺伝子の同定

使用群体遗传学方法鉴定疾病相关基因

• 批准号: 13F03096
• 负责人: 山田 亮
• 金额: $ 1.09万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13F03096/
• 关键词: ゲノム; 集団遺伝学

研究代表者が所属する京都大学医学研究科が年来、推進してきている地域ゲノムコホートスタディ(ながはまスタディ)の一環として、地域コホート構成者の一塩基多型アレイデータならびに、エクソームシークエンスデータに由来するゲノムバリアントデータをその集団遺伝学的特性について解析を進めた。2年間の予定で着任するも、予定を変更し途中にて帰国することとなったことから、従来の予定を以下のごとく変更して実施した。従来予定では平成25年度中に、ゲノムコホートデータの質と量についての討議を進め、本研究の役割分担を確定し、遺伝的多様性の集団遺伝学的解析はKo氏が主体となり、その解析のための計算機環境の整備を行うとともに遺伝的多様性と表現型多様性に関する研究を進めるための予備的解析としてレアバリアントと臨床表現型とのデータにつき、一般化している解析手法を適用して表現型関連バリアントの検出解析を実施する、予定としていた。また、平成26年度・平成27年度に本格的な集団遺伝的解析を実施し、フェノタイプデータと絡めた解析に進める予定であった。帰国が早まったことから、当初予定の計算機環境の整備は簡略なものに留め、本格的な集団遺伝学的を前倒しで実施した。その中には、より短期間で有意な結論を導くだろうと思われた、次の解析を含めた。ここで言う次の解析とは、日本人を含む東アジアの多民族遺伝子多型解析スタディグループが先年発表したデータの集団遺伝学的構造解析を併せて実施し、ながはまコホートに見られる集団の地理・歴史的推定を進めるとともに、選択圧に関する推定を実施することである。また、Ko氏の過去の共同研究者で国内にて活動中の集団遺伝学者とも適宜、意見交換を進め、研究の促進を促した。

Over the past years, the Graduate School of Medicine of Kyoto University, to which the research representative belongs, has been promoting the analysis of the characteristics of the collection of genetic materials in the field of geographical composition. 2 years ago, we decided to change the rules. In the future, we will discuss the quality and quantity of the products in the next 25 years. We will determine the distribution of the products in this study. We will analyze the diversity of the products in Ko's body. The analysis of the computer environment, the preparation of the computer environment, the diversity of the computer environment, and the diversity of the computer environment. In 2016 and 2017, the analysis of the group information in this category was carried out, and the analysis of the network information was carried out. In the early days, the equipment of the computer environment was originally designed to be simple and simple, and the technology of the group was implemented in advance. In the short term, we intend to draw conclusions and analyze them. The analysis of the multi-ethnic heritage of the Japanese people, including the East China Sea, is based on the structural analysis of the historical heritage of the Japanese people, and the estimation of the geographical history of the Japanese people. The past co-researchers of Ko and Ko are invited to gather scholars and promote research in domestic activities, exchange opinions and promote research.