重金属酵素・ニトリルヒドラターゼおよび重金属トランスポーターの構造機能解析
重金属酵素・ニトリルヒドラターゼおよび重金属トランスポーターの構造機能解析
批准号:
10129212
负责人:
清水 昌
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 --
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鉄型二トリルヒドラターゼ(NHase)のX線結晶構造解析から、鉄のリガンドであることが判明している3つのシステイン残基に相当する(Rhodococcus rhodochrousJlの)コバルト型NHaseのαサブユニットにおける107Cys,105Cys,102Cysの機能を解析した。すなわち、これら3つのシステイン残基をアラニンに部位特異的変異法により置換することで、合計7種類の変異酵素(107,105,102,107/105,105/102,107/102,107/105/102)に対応する各遺伝子を作製した後、宿主Rhodococcus rhodochrous ATCC12674に形質転換し、発現させた。これらの変異酵素は無細胞抽出液レべルで全てNHase活性を示さなかった。SDS-PAGEによる検討の結果、4種(107,105,107/105,105/102)はNHase変異酵素を発現し、残り3種(102,107/102,107/105/102)は対応するNHaseタンパク質を産生しなかった。107,105,107/105,105/102の4種類のNHase変異酵素の性質を解析すべく、精製を試みた。無細胞抽出液の調製、硫安分画に続き、DEAE-Sephacel、Superdex200、Phenyl-SepharoseCL-4B、Mono-Qにより均一な各変異酵素標品を得、諸性質を検討した結果、いずれの変異酵素においても、野生型のH-NHaseでみられるコバルトに由来すると考えられる420nmの吸収極大はほとんど認められなかった。2アミノ酸置換の実験結果から、102Cysあるいはl07Cysのどちらかが存在すればNHaseタンパク質が生成すると言えるのに対し、1アミノ酸置換の実験結果からは、102CysがNHaseタンパク質生成に重要な残基であることが示唆された。これらの結果から、いずれのシステイン残基もNHase活性発現にとって重要であることが判明した。さらに、NHaseの反応機構として2種類のモデルを提唱した。すなわち、OH^-(あるいは金属に結合した水分子)に基質であるニトリルが接近し、続いて、OH^-(あるいはOH^-の塩基としての作用によって活性化された水分子)がニトリルの炭素原子を求核攻撃しイミド酸を生成し、最終的にアミドに変換される。
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DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kobayashi,M.et al.: "The catalytic mechanism of amidase also involves nitrile hydrolysis" FEBS Lett.439. 325-328 (1998)
Kobayashi,M.et al.:“酰胺酶的催化机制还涉及腈水解”FEBS Lett.439。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kobayashi, M.et al.: "Lactone-ring-cleaving enzyme : genetic analysis, novel RNA editing, and evolutionary implications." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 12787-12792 (1998)
Kobayashi, M.等人:“内酯环裂解酶:遗传分析、新型 RNA 编辑和进化意义。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kobayashi,M.et al.: "Nitrilase catalyzes amide hydrolysis as well as nitrile hydrolysis" Biochem.Biophys.Res.Commun.253. 662-666 (1998)
Kobayashi,M.et al.:“腈水解酶催化酰胺水解以及腈水解”Biochem.Biophys.Res.Commun.253。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Single Cell Oilの新展開「機能性脂肪酸から構造脂質・機能性脂質へ」
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批准号:17658040
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2005
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负责人:清水 昌
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依托单位:
糸状菌が大量分泌する脂肪球の膜構成分子の解析と応用
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批准号:15658024
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2003
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负责人:清水 昌
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依托单位:
微生物機能を応用した環境修復技術の開発
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批准号:02F00761
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2002
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负责人:清水 昌
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依托单位:
ラクトン環開裂酵素の機能開発と有用化合物生産プロセスへの応用
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批准号:13556015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$6.59万
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财政年份:2001
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负责人:清水 昌
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依托单位:
生物的水素添加反応による有用脂質生産を機軸としたアネロバイオテクノロジーの新展開
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批准号:13876023
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2001
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负责人:清水 昌
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依托单位:
微生物による環状アミド化合物変換の生化学的解析と有用物質生産への応用
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批准号:00F00151
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2000
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负责人:清水 昌
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依托单位:
微生物ペルオキシダーゼの機能開発
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批准号:99F00115
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.51万
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财政年份:2000
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负责人:清水 昌
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依托单位:
機能性脂質の創製を目指した油脂生産微生物のメタボリックエンジニアリング
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批准号:12306006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$20.23万
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财政年份:2000
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负责人:清水 昌
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依托单位:
脂質分泌生産機構の解明と応用
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批准号:11876023
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:清水 昌
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依托单位:
微生物における脂質の生化学的解析及び遺伝子工学的改良
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批准号:98F00103
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1998
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负责人:清水 昌
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依托单位:
インドール酢酸生合成酵素の分子機能解析
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批准号:09876025
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1997
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负责人:清水 昌
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依托单位:
カルボニル還元酵素及びラクトナーゼの基質認識機構の解析と生物活性物質合成への応用
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批准号:04220223
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1992
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负责人:清水 昌
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依托单位:
コエンザイムAの酵素的合成法(フィードバック阻害の回避と収量増大との関係)
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批准号:57560102
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1982
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负责人:清水 昌
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依托单位:
微生物のアシルCoA合成酵素, 生成機構及びその利用
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批准号:X00210----476071
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.46万
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财政年份:1979
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负责人:清水 昌
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依托单位:
緑膿菌のアシルCoA合成酵素とその応用に関する研究
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批准号:X00210----376050
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.26万
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财政年份:1978
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负责人:清水 昌
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依托单位:
緑膿菌およびその変異株によるアシルCoAの生産とその生成機構に関する研究
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批准号:X00210----276060
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.23万
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财政年份:1977
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负责人:清水 昌
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依托单位:
微生物によるアシルCoAの生産およびその生成機構に関する研究
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批准号:X00210----176063
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.21万
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财政年份:1976
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负责人:清水 昌
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依托单位:
海外基金