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Chemical Mapping of G-Quadruplexes in the Genome

基因组中 G-四链体的化学作图

基本信息

批准号：
BB/G008337/1
负责人：
Sir Shankar Balasubramanian
金额：
$ 40.38万
依托单位：
University of Cambridge
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2009
资助国家：
英国
起止时间：
2009 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FG008337%2F1
关键词：
Chemical Mapping Quadruplexes Genome

项目摘要

The DNA found in living cells is the basis for programming the functions associated with life. It has been assumed that all DNA exists primarily as a canonical two stranded double helix, as proposed by Watson and Crick. However, there is mounting evidence to suggest that a four stranded quadruple helix DNA structure, called a quadruplex, may be able to form, and may have a functional significance. This proposal aims to directly explore whether such quadruplex structures exist in cell and to localise where in the ~ 3 Billion bases of DNA, in the human geneome, quadruplexes exist. The outcome(s) will directly address the central hypothesis and may also identify new functional targets for future therapeutics.

在活细胞中发现的DNA是对与生命相关的功能进行编程的基础。正如Watson和Crick提出的假设，所有的DNA都主要以典型的双链双螺旋形式存在。然而，越来越多的证据表明，一个四链四螺旋DNA结构，称为四链，可能能够形成，并可能具有功能意义。这一建议旨在直接探索细胞中是否存在这样的四链结构，并定位在人类基因组的30亿个DNA碱基中存在四链结构的位置。研究结果(S)将直接解决中心假说，并可能为未来的治疗确定新的功能靶点。

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Small-molecule-induced DNA damage identifies alternative DNA structures in human genes.

DOI：
10.1038/nchembio.780
发表时间：
2012-02-05
期刊：
NATURE CHEMICAL BIOLOGY
影响因子：
14.8
作者：
Rodriguez, Raphael;Miller, Kyle M.;Forment, Josep V.;Bradshaw, Charles R.;Nikan, Mehran;Britton, Sebastien;Oelschlaegel, Tobias;Xhemalce, Blerta;Balasubramanian, Shankar;Jackson, Stephen P.
通讯作者：
Jackson, Stephen P.

Experimental approaches to identify cellular G-quadruplex structures and functions.

DOI：
10.1016/j.ymeth.2012.01.008
发表时间：
2012-05
期刊：
METHODS
影响因子：
4.8
作者：
Di Antonio, Marco;Rodriguez, Raphael;Balasubramanian, Shankar
通讯作者：
Balasubramanian, Shankar

Pyridostatin analogues promote telomere dysfunction and long-term growth inhibition in human cancer cells.

DOI：
10.1039/c2ob25830g
发表时间：
2012-08-28
期刊：
Organic & biomolecular chemistry
影响因子：
3.2
作者：
Müller S;Sanders DA;Di Antonio M;Matsis S;Riou JF;Rodriguez R;Balasubramanian S
通讯作者：
Balasubramanian S

Small-molecule-mediated G-quadruplex isolation from human cells.

DOI：
10.1038/nchem.842
发表时间：
2010-12
期刊：
NATURE CHEMISTRY
影响因子：
21.8
作者：
Mueller, Sebastian;Kumari, Sunita;Rodriguez, Raphael;Balasubramanian, Shankar
通讯作者：
Balasubramanian, Shankar

A single-molecule platform for investigation of interactions between G-quadruplexes and small-molecule ligands.