Statistical analysis of genetic analysis workshop 12data

遗传分析工作坊12data统计分析

基本信息

项目摘要

This project involved analysis of a simulated dataset from the Genetic Analysis Workshop 12. A set of data for a complex qualitative trait was simulated by the data organizing committee of the GAW12. We used these data to compare the power of two new family-based tests of linkage disequilibrium that are being developed by me and my collaborators to several other implementations of the published Transmission Disequilibrium Test (TDT). We showed that none of these tests had adequate power in the small samples originally supplied, but that when all the replicates were combined to yield a large dataset, then all the methods had good power to detect loci with very small effects on the trait at genome-wide significance levels. One of our new methods was particularly successful in that we were able to show that it yields good estimates of both the recombination fraction and a generalized measure of association, something that the TDT does not accomplish. These results were recently presented at the GAW12 workshop and a paper is in preparation.
该项目涉及分析来自遗传分析研讨会12的模拟数据集。GAW12数据组织委员会模拟了一组复杂质量性状的数据。我们使用这些数据来比较我和我的合作者正在开发的两种新的以家庭为基础的连锁不平衡测试与已发表的传递不平衡测试(TDT)的其他几种实施方式的功效。我们发现,在最初提供的小样本中,这些测试都没有足够的功效,但是当所有的重复组合产生一个大的数据集时,所有的方法都有很好的功效来检测对全基因组显著性水平上的性状影响非常小的基因座。我们的新方法之一是特别成功的,因为我们能够证明,它产生了很好的估计重组分数和广义的关联措施,这是TDT没有完成。这些结果最近已提交给GAW 12研讨会,目前正在编写一份文件。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Joan Ellen Bailey-Wilson其他文献

Joan Ellen Bailey-Wilson的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Joan Ellen Bailey-Wilson', 18)}}的其他基金

Linkage Analysis of Duane Syndrome
杜安综合征的连锁分析
  • 批准号:
    6109057
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Segregation Analyses of Human Esophageal Cancer
人类食管癌的分离分析
  • 批准号:
    6109058
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
LINKAGE ANALYSIS OF PROSTATE CANCER
前列腺癌的连锁分析
  • 批准号:
    6109033
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Linkage Analysis of Punctate Cataracts
点状白内障的连锁分析
  • 批准号:
    6109056
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
SEGREGATION ANALYSES OF HUMAN ESOPHAGEAL CANCER
人类食管癌的分离分析
  • 批准号:
    6290342
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
GENETICS OF HUMAN LUNG CANCER
人类肺癌的遗传学
  • 批准号:
    6290299
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Statistical Analysis of Genetic Analysis Workshop 12 Dat
遗传分析研讨会12数据的统计分析
  • 批准号:
    6555962
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Genetics of ADHD
多动症的遗传学
  • 批准号:
    6681677
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Linkage analysis of melanoma
黑色素瘤的连锁分析
  • 批准号:
    6830354
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Genetics of Hyperparathyroidism- Jaw Tumors
甲状旁腺功能亢进症的遗传学 - 颌骨肿瘤
  • 批准号:
    6830377
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:

相似海外基金

FAMILY GENETICS OF AUTISM AND ASPERGER DISORDER
自闭症和阿斯伯格症的家族遗传学
  • 批准号:
    6505593
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
FAMILY GENETICS OF AUTISM AND ASPERGER DISORDER
自闭症和阿斯伯格症的家族遗传学
  • 批准号:
    6480457
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
FAMILY GENETICS OF AUTISM AND ASPERGER DISORDER
自闭症和阿斯伯格症的家族遗传学
  • 批准号:
    6359630
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
FAMILY GENETICS OF AUTISM AND ASPERGER DISORDER
自闭症和阿斯伯格症的家族遗传学
  • 批准号:
    6336606
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
FAMILY GENETICS OF AUTISM AND ASPERGER DISORDER
自闭症和阿斯伯格症的家族遗传学
  • 批准号:
    6202109
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
FAMILY GENETICS OF AUTISM AND ASPERGER DISORDER
自闭症和阿斯伯格症的家族遗传学
  • 批准号:
    6108895
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
FAMILY GENETICS OF AUTISM AND ASPERGER'S DISORDER
自闭症和阿斯伯格症的家族遗传学
  • 批准号:
    6241397
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了